Circos在windows环境下运行的详细教程hygine

####################################################################################一、下载安装circos及perl#####################################################################################

1.安装Perl运行circos需要Perl来编译其各种code,unix环境默认安装Perl的,而对于windows用户来说,需要自己安装,也可以通过Perl–v确认是否已安装。可以安装StrawberryPerl或者ActiveStatePerl都可以通过CPANshell来安装模块。(模块安装见第二步)

####################################################################################二、配置Perlmodule模块#####################################################################################

1、安装Perlmodules:运行Perl需要将以下modules都安装起来Config::General(v2.50orlater)Font::TTFGDList::MoreUtilsMath::BezierMath::RoundMath::VecStatParams::ValidateReadonlyRegexp::CommonSet::IntSpan(v1.16orlater)Text::Format

接下来的其他module按类似的步骤,全部配置好,防止将来跑程序出错。

####################################################################################三、运行circos提供的例子#####################################################################################

1、进入example目录:cdC:\circos-0.66\example2、调试第一个例子:perl..\bin\circos-conf.\etc\circos.conf3、调试第二个例子:perl..\bin\circos-conf..\tutorials\2\2\circos.conf4、调试第三个例子:跑这个程序之前得在example目录新建一个目录new_output,再输入以下代码perl..\bin\circos-conf..\tutorials\2\2\circos.conf-outputdir.\new_output-outputfiletutorial_image.png

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