柴胡皂苷D对大鼠免疫性肝纤维化的保护作用及其机制研究

光学显微镜(ZEISS公司,德国,型号ImagerA2);涡旋振荡仪(海门市其林贝尔仪器制造有限公司,中国,型号Vortex-5);超纯水机(重庆力德高端水处理设备研发有限公司,中国,型号CCT-3320A);电子天平(上海舜宇恒平科学仪器有限公司,中国,型号YP202N);恒温水浴箱(江苏金坛市华欧实验仪器厂,中国,型号HH-601);垂直电泳转移装置(Bio-Rad公司,美国,型号Mini-PROTEANTetra1658001)、Trans-Blot转膜装置(Bio-Rad公司,美国,型号MiniTrans-BlotModule1703935)、凝胶成像系统(Bio-Rad公司,美国,型号CFX96);水平脱色摇床(海门市麒麟医用仪器厂,中国,型号TS-2000A);酶标仪(Bio-Tek仪器有限公司,美国,型号ELX800);高速台式离心机(湖南湘仪实验室仪器开发有限公司,中国,型号TG16-WS);-80℃低温冰箱(海尔生物医疗股份有限公司,中国,型号DW-86L388J)。

SPF级雄性SD大鼠40只,体质量(200±20)g,由北京华阜康生物科技股份有限公司提供[实验动物生产许可证号SCXK(京)2014-0004]。已通过重庆市中医院医学伦理委员会审查批准使用,符合实验室动物管理与使用准则,实验动物使用许可证号SYXK(渝)2017-0005。实验期间实验环境温度23~26℃,湿度50%~60%。SD大鼠40只,随机分为5组(n=8):①正常对照组;②模型组;③SSD高剂量(3.00mg/kg)组;④SSD中剂量(1.50mg/kg)组;⑤SSD低剂量(0.75mg/kg)组。模型组和SSD组大鼠予以无菌猪血清0.5mL/只腹腔注射,每周2次,连续8周。SSD组从第5周开始每天2次腹腔注射各组剂量的SSD,共4周。对照组和模型组腹腔注射等体积的0.9%氯化钠注射液。观察各组大鼠的状态,记录死亡数。样本采集前大鼠禁食不禁水12h,称量并记录。将大鼠按0.7mL/100g注射5%水合氯醛,腹主动脉采血10mL左右置于无菌抗凝管中,3000×g离心10min,吸取血清,-80℃分装保存待用。将大鼠剖腹取肝脏组织,4%多聚甲醛固定用于病理学检测;-80℃保存用于蛋白的检测。

ELISA试剂盒测量大鼠血清ALT、AST表达水平。全血标本于室温放置2h后以1000×g离心20min,取上清检测。BCA法测定蛋白浓度,采用ELISA试剂盒检测大鼠血清中TNF-α、IL-1β和IL-18的含量。

4%多聚甲醛固定大鼠肝脏组织,经脱水、石蜡包埋、切片后行HE染色,光学显微镜镜检,图像采集分析,观察大鼠肝脏组织的形态学变化。

研钵中加入液氮研磨组织至微末,收集50~80mg至1.5mLEP管中,每管加适量(约100μL/10mg)蛋白裂解液(用前需提前加入蛋白酶抑制剂);冰上裂解30min,超声处理。4℃、12000×g离心10min。离心后取上清装入干净的1.5mLEP管中,取一部分通过BCA法测定蛋白浓度,-80℃分装保存。取适量蛋白加入样品缓冲液于95℃煮沸10min。上样后经SDS-PAGE凝胶电泳分离,将蛋白条带电转至PVDF膜上,5%脱脂奶粉室温封闭2h,加入1∶500稀释的一抗(NLRP3、ASC、Caspase-1、GSDMD、TLR4、p65、p-p65)和1∶1000稀释的一抗(β-actin)4℃孵育过夜,洗膜后加入1∶1000稀释的二抗室温孵育2h,洗膜后采用ECL发光法检测蛋白条带,凝胶成像仪记录条带灰度值。以β-actin为内参,以目的蛋白/内参蛋白表示目的蛋白的相对表达水平。

应用SPSS21.0统计软件处理数据,计量资料用x±s表示,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验,以P<0.05为有统计学意义。

综上所述,本研究通过网络药理学研究方法初步发现了SSD治疗自身免疫性肝病的可能作用机制。在免疫性大鼠肝纤维化动物模型中,SSD可抑制TLR4/Myd88/NF-κB信号通路和NLRP3炎症小体的启动和激活,减轻下游炎症因子的释放,减轻肝脏炎症反应,起到保护性的作用。因此,本研究为SSD的进一步开发和临床利用提供了研究基础。

THE END
1.生信入门第十二课:用Cytoscape绘制PPI网络图并使用cytohubba识别...在线绘制带community的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图 导读:分子相互作用网络图揭示了细胞内部分子间的复杂相互作用。通过识别网络中密集连接的节点所形成的社区(commun... 微生信阅读 16评论 0赞 0 生信入门第十课:Clusterprofiler GO和KEGG富集分析R代码详解 微生信助力高分文章,用户230000,谷歌学术4500 微生信阅...https://www.jianshu.com/p/39ffbbd5e260
2.25张图带你玩转表达量差异分析思路生信菜鸟团25张图带你玩转表达量差异分析思路 最近看到了很多借助单细胞水平的不同细胞亚群的差异来解释以前的传统转录组混合各种细胞亚群的样品差异的文章, 如下所示: 研究者首先做了一个bulk转录组,走了标准的差异分析,拿到了上下调基因以及注释它们的功能。然后把这些基因在自己的单细胞转录组各个亚群具体看其是否有表达差异...http://www.bio-info-trainee.com/8529.html
3.Cytoscape软件画图说明1、Cytoscape软件画图说明1、画图前,先准备两个输入文件。K' edge.bct 囚 riode.bct2、打开cytoscape软件,导入数据。导入edge.txt 文件点击 File -Import -Network。Q田三口口白点击ok得到原始图形点击layout -Apply Preferred Out改变图形排列方式此处可以用鼠标在画布中拖动图形到合适的位置。ITI I) KLa) efiK改...https://www.renrendoc.com/paper/202611963.html
4.Cytoscape软件画图说明20210823074803.docxCytoscape软件画图说明 Cytoscape软件画图说明 PAGE PAGE11 Cytoscape软件画图说明 PAGE 可编写可更正 Cytoscape软件画图说明 1 可编写可更正 1、画图前,先准备两个输入文件。 2、打开cytoscape软件,导入数据。 导入文件 点击FileImportNetwork 2 可编写可更正 节点 1,文件中 节点2,文件中 连接种类,文件 点击ok获取原始...https://max.book118.com/html/2021/0823/8123104040003137.shtm
5.BiGSCAPE结果导入cytoscape出图全流程在Cytoscape 中,使用工具面板上的“从文件系统导入网络”按钮导入网络(图 4a)。从 BiG-SCAPE 输出中选择一个 .network 文件。 9、单击第一个列名称(“Clustername 1”)并将其标记为源节点;将第二列(“Clustername 2”)标记为目标节点。 10、选择“Raw Distance”列作为边缘属性。导入其余列是可选的,但它们也...https://mdnice.com/writing/1d334744401c4d819b5153f7c467b08b
6.Cytoscape软件使用教程蛋白互作网络图构建在生信分析里,各种物质相互作用网络(interaction network)的研究也很丰富,数据比较复杂。Cytoscape软件就是构建网络的神器,学习好这个软件,做出再漂亮的调控网络图都是有可能的。 在生物信息学分析里,各种symbol的相互作用网络(interaction network)的研究非常丰富,数据相对复杂。Cytoscape就是一个专用于互作网络数据可视化的...https://www.biowolf.cn/Video/6.html
7.一种抑制肺癌转移的中药复方组合物及其应用附图说明 25.图1为软坚散结方肺癌相关靶点韦恩图; 26.图2为软坚散结方治疗肺癌潜在作用靶点相互作用网络图; 27.图3为软坚散结方抗肺癌作用靶点功能分析...将从string数据库中获取的潜在作用靶点相互作用关系导入cytoscape3.7.2软件,构建潜在作用靶点相互作用网络。 68.5.4 go和kegg分析...https://www.xjishu.com/zhuanli/05/202210086642.html/
1.如何用Cytoscape::EnrichmentMap可视化GSEA的运算结果?愿武艺晴小朋友一定得每天都开心! 第一步:下载安装GSEA 4.3.3的桌面版;安装好后的界面如下图所示: 第二步:下载C5 数据集下的GO subset of BP的基因集,点击Gene Symbols,下载基因ID为Symbol号的gmt格式文件。(人和小鼠是两个不一样的链接,要按自己的实际下载) ...https://blog.csdn.net/jl19930703/article/details/144144222
2.Cytoscape中文教程(1)阅读清单腾讯云开发者社区写在前面,这个教程真的有点长,是我早期翻译的,如果你完全不懂Cytoscape,那么你读这些,应该会做出非常漂亮的各种基于cytoscape及插件的图,因为这个教程真的很白。原文地址 直接从第三部分开始 3 命令行参数 Cytoscape可以识别很多可选的命令行参数,包括network,节点,边和会话文件等数据文件运行规范,这些文件是可以输出...https://cloud.tencent.com/developer/inventory/9725/article/1332515
3.代谢网络图四部曲(三)如下图所示,Cytoscape主要可分6个主要的功能区:菜单栏;工具栏;控制面板;网络主视图窗口;常用功能快速按钮;数据表格面板。 4.1 菜单栏 1.4.1 File菜单 文件(File)菜单包含打开、保存、关闭网络图文件、导入导出网络数据、输出图片等操作。 注:如果您看了一些早期版本的Cytoscape教程,教程中可能会要求您将数据文件整理...https://www.antpedia.com/wxarticle/index.php?id=366032
4.Cytoscape的使用方法(带图片解析)最近在做网络构建的课题,用到了cytoscape软件,所以把软件的用法总结了一下。cytoscape是由许多研究单位共同合作开发的一个开放源码的生物信息分析软件。研究单位包括加州大学圣地亚哥分校的TreyIdeker实验室,加州大学旧金山分校的BruceConklin实...https://m.wang1314.com/doc/webapp/topic/20963015.html