SCI作图第9期.“精修”机制图,只差这一步!

(1)我们在面板上“类型”中可以选择自己喜欢的渐变效果,通常在蛋白标识中选择“中心渐变”;

(2)利用“反向渐变”可以将渐变部分的两个不同的颜色进行调换;

(3)在“渐变滑块”中我们可以进行多种操作。

>方法2

绘制两个基础图形

混合

指定步数

在“混合选项”中“指定步数”越多或“指定的距离”越小,渐变约精细。

注:本期涉及的软件版本如下

1)AdobeIllustrator2024

2)AdobePhotoshopCS5

本期我们以蛋白标识为例,介绍了两种渐变效果的运用,还可以应用于绘制图片背景、细胞器等多种素材绘制,是在机制图中不可或缺的绘图技巧,下一期我们将介绍在机制图中如何运用AI绘制各种多边形。

THE END
1.ScienceSlides插件作图:用PPT画autophagy文章中的美图ScienceSlides插件作图:用PPT画autophagy文章中的美图 图例1 传奇2 师妹:师兄,这幅画真漂亮,你是怎么画的呢? 兄弟:用PPT画画,装个插件就可以了。 学术大师福利:在“生物大师”后台对话框回复“插件”,即可免费领取软件并自行下载安装。 接下来我们将使用插件一步步绘制信号路径图。http://m.keduotianxia.com/sys-nd/12976.html
2.Cytoscape——美化Cytoscape美化 应用上篇所得到的网络图进行美化 1.统一模板美化: 采用模板进行简单美化 得到网络图 2.根据数据含义进行美化 根据的molecluar type标注节点所代表lncRNA或者protein 点击网络处理面板中style->node->shape进行设置点的形状,并勾选“Lock node width and height”。 https://shengxin.ren/article/161
3.Cytoscape.js美化Cytoscape.js 美化 Cytoscape.js 为了性能,在个性化样式定制上,没有给出开箱即用的法子。 例如,想实现下面这样的效果图,G6有动画支持,而 Cytoscape.js 却没有。 关系图 如果确定要用Cytoscape.js ,该怎么实现这个效果呢? 当然,最直接的办法是用canvas动画来处理,但我暂时没精力研究canvas。https://www.jianshu.com/p/a94679b395f4
4.Cytoscape372windows64bit.exe在写文章的过程中,我们经常需要对蛋白互作网络图进行调整和美化,如何根据自己的需求对蛋白互作网络图进行调整和美化呢? 为大家介绍一种可以对网络图进行自定义绘制的软件:Cytoscape,它是一款图形化显示网络并进行编辑和分析的软件,可以对获得的蛋白-蛋白互作网络图进行修改和进一步分析。 https://www.iteye.com/resource/bioms-12685276
5.5网络图绘制软件cytoscape使用介绍美吉生物讲义.pdf网络图绘制软件cytoscape使用 微生物事业部 meta@majorbio. 本节课准备工作: 网络图绘制软件cytoscape使用 1、确保自己的电脑上已经安装了cytoscape软件,并且可以打开; 2、登陆isanger账号、运行云平台上的物种相关性网络 ,以备文件 ; 3、确保已 用于绘图的表格文件; 网络图绘制软件cytoscape使用 1 cytoscape软件背 2 ...https://max.book118.com/html/2021/0311/8022023055003057.shtm
1.Cytoscape作图,边和节点的颜色设置cytoscape作图难?10分钟搞定OTU的互作网络分析相关性联系图+MENA使用教程! 科研小伙伴们,如果你是从事肠道菌群、微生物组、基因组、蛋白组、代谢组等组学分析,那就离不开一个强大的互作网络绘图软件CYTOSCAPE,安装过程在之前写的文章cytoscape安装及使用-1中已经安利给大家了,不过使用的教程还没完成。今天我想给大家介绍...https://www.pianshen.com/article/6551943743/
2.Cytoscape作图,边和节点的颜色设置cytoscape按mcc该节点颜色Cytoscape作图,边和节点的颜色设置 Step1:导入数据。数据至少有三行 其中第列行和第二列为基因名称(SNP名称),第三列为权重。在同一行中表示第一列和第二列相互作用,而且权值为第三列的数据,如下图,第一列选source 第二列选target,第三列选edgeattribute。https://blog.csdn.net/qq_37200550/article/details/80026653
3.预警!2022年经典分析绘图软件,总有一款适合你在科研作图中起了什么作用?(假设你对AI一无所知)。AI在科研绘图或者插画制作等方面有重大用处,只是平时的你让无所不能的PPT抢了AI的“饭碗”。AI容易上手又能够很好得解决包括很多PPT无法解决的问题,从而提高科研效率。AI可用于美化数据图,因此数据图尽可能保存成矢量图,矢量图导入AI能够进行深度修饰、美化、排版...https://www.antpedia.com/news/index.php/wx_article/708137.html
4.干货分享Cytoscape软件对经STRING数据PPI网络图美化采用Cytoscape软件对经STRING数据库分析所得PPI网络图进行美化大致可分为两种情况:其一则是直接通过调整图片颜色、线条、整体布局(注意:整体布局调整亦可手动调节或直接自动调节,较为灵活)等的调整以达到美化的效果;其二则是进阶版,依据“Degree”值进行分类设置,以使图片更加精致美观的同时层次更加分明,下面我将以第二种...https://www.bio-review.com/string-cytoscape-ppi/
5.保姆级教学Cytoscape—绘制互作网络图详细教程,给您的文章“精装...以上下调top20的差异基因为例,将基因列表导入string网站。选择Multiple proteins和物种信息,点击search,得到网络图。导出结果表格,选择TSV格式,便于cytoscape软件打开。 2. 结果导入Cytoscape,开始美化 导入数据,设置第一列第二列分别为source node和target node,得到初始图形。导入差异基因表格,添加基因的附加信息,比如差异...https://www.biomart.cn/news/16/3223736.htm
6.STRING网站+Cytoscape软件制作精美蛋白互作网络图(PPI)–王进的...用于导入Cytoscape。 6. 导入Cytoscape 第一步是导入数据:File-Import -Network from file,然后选择TSV格式的文件,默认参数OK。得到一个巨丑无比的网络图,看起来也比较复杂。 7. NetworkAnalyzer美化加工 对于Cytoscape V3.7用户可以很方便进行美化:依次点击Tools- NetworkAnalyzer-Network Analysis-Generate style ...https://www.jingege.wang/2023/07/19/string%E7%BD%91%E7%AB%99cytoscape%E8%BD%AF%E4%BB%B6%E5%88%B6%E4%BD%9C%E7%B2%BE%E7%BE%8E%E8%9B%8B%E7%99%BD%E4%BA%92%E4%BD%9C%E7%BD%91%E7%BB%9C%E5%9B%BEppi/
7.ggplot2高效实用指南(可视化脚本工具套路配色)主题与背景颜色 坐标轴:最大最小值 坐标变换 坐标刻度:刻度线、标签、顺序等 添加直线:水平线、竖直线、回归线 图形旋转:旋转、反向 分面 位置调整 坐标系 可视化套路、配色和编辑 在线绘图和插件 CIRCOS系列 R统计和作图 NGS可视化 Cytoscape网络图 R统计绘图 高颜值免费在线绘图 目录...https://blog.51cto.com/u_16077014/6252680
8.如何在cytoscape中获取neo4j网络节点的标签节点越大代表富集基因越多,节点颜色代表P值显著性。 3. 调整网络图 (1)上传(文件>导入>表>文件)子组文件(subgroups.txt)。...该包提供的cytoscape作图文件简直太好用了,对于网络图一些其他细节的修改,比如标签、边的粗细颜色形状、节点透明度之类的,小编这里就不赘述了,大家快去试试玩玩吧...https://cloud.tencent.com/developer/information/%E5%A6%82%E4%BD%95%E5%9C%A8cytoscape%E4%B8%AD%E8%8E%B7%E5%8F%96neo4j%E7%BD%91%E7%BB%9C%E8%8A%82%E7%82%B9%E7%9A%84%E6%A0%87%E7%AD%BE