夏苍和胃颗粒剂治疗慢性萎缩性胃炎的网络药理学研究及分子对接验证NetworkPharmacologyStudyandMolecularDockingValidationofXiaCangHeWeiGranulesintheTreatmentofChronicAtrophicGastritis

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夏苍和胃颗粒剂治疗慢性萎缩性胃炎的网络药理学研究及分子对接验证

于盈1*，王欣怡1*，张汇升1，吕晶1，刘彬1，王晓2#，张丽平3

1辽宁大学药学院，辽宁沈阳

2沈阳医学院附属中心医院消化内科，辽宁沈阳

3菏泽市中医医院药物临床试验机构，山东菏泽

收稿日期：2023年6月10日；录用日期：2023年7月6日；发布日期：2023年7月13日

摘要

关键词

半夏泻心汤，网络药理学，慢性萎缩性胃炎

NetworkPharmacologyStudyandMolecularDockingValidationofXiaCangHeWeiGranulesintheTreatmentofChronicAtrophicGastritis

YingYu1*,XinyiWang1*,HuishengZhang1,JingLv1,BinLiu1,XiaoWang2#,LipingZhang3

1SchoolofPharmaceuticalSciences,LiaoningUniversity,ShenyangLiaoning

2DepartmentofGastroenterology,CentralHospitalAffiliatedtoShenyangMedicalCollege,ShenyangLiaoning

3DrugClinicalTrialInstitution,HezeTraditionalChineseMedicineHospital,HezeShandong

Received:Jun.10th,2023;accepted:Jul.6th,2023;published:Jul.13th,2023

ABSTRACT

Keywords:BanxiaXiexinDecoction,NetworkPharmacology,ChronicAtrophicGastritis

ThisworkislicensedundertheCreativeCommonsAttributionInternationalLicense(CCBY4.0).

1.引言

慢性萎缩性胃炎(chronicatrophyicgastritis,CAG)是目前临床环境中常见的一种疾病，是以多种治病因素造成的胃粘膜层变薄、腺体萎缩等病理现象为特点的消化系统疾病[1]。患者表现主要为上腹胀痛、暧气、贫血以及消化功能障碍等症状[2]。患有CAG情况严重者甚至会发展成胃癌，因此这一疾病已被世界卫生组织列为胃癌的癌前疾病[3]。在目前的临床诊治中，西医治疗的效果并不能达到理想状态。而中医药具有毒副作用小、适应症广、成本低等特点，日渐被应用于CAG的临床治疗[4]。半夏泻心汤是东汉时期著名医家张仲景写于《伤寒论·辨太阳病脉证并治方》中的方剂[5]。原方常被用于治疗小柴胡汤证误下所导致的脾胃受损，胃气痞塞，寒热错杂的病症。随着现代分析仪器的不断发展，对半夏泻心汤进行现代药理学的深入探究，发现其含有黄酮、皂苷以及生物碱等多种天然有效产物[6]，在胃肠道疾病、内分泌疾病等系统疾病中有着显著的治疗效果。

2.资料与方法

2.1.颗粒剂主要活性成分筛选及潜在靶点预测

2.2.CAG颗粒剂疗法靶点的识别

2.3.“疾病–中药–主要成分–关键靶点(基因)”的网络图构建

在通过取交集得到有效靶点的基础上对颗粒剂的化合成分进行整合筛选，得到包含交集靶点的主要活性成分。向Cytoscape3.9.1软件中导入共有的有效靶点以及主要活性成分来进行“CAG–颗粒剂–主要成分–关键靶点(基因)”网络图的绘制和构建。并且通过软件内“Tools”中包含的“NetworkAnalyzer”功能进行拓扑分析。

2.4.筛选共有靶点蛋白互作(PPI)网络分析

2.5.基因本体(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析

2.6.分子对接验证

3.结果

Figure1.Venn’sdiagramofdiseasegene-herbstargetgene

3.2.构建PPI蛋白互作网络

Figure2.PPInetworkdiagram

3.3.构建“疾病–中药–主要成分–关键靶点(基因)”的网络关系

Figure3.Networkdiagramof“Disease-TraditionalChineseMedicine-MainComponent-CriticalTarget(Gene)”

3.4.GO功能富集分析结果

Figure4.GOenrichmentanalysis

3.5.KEGG通路富集分析结果

Figure5.KEGGpathwayanalysis

3.6.分子对接验证

Table1.Dockingbindingenergybetweenactiveingredientandcriticaltargetingranules

Figure6.DockingdiagramofLuteolinwithIL6andTP53

4.讨论

综上，本研究构建了颗粒剂中有效成分集，筛选挖掘出了药物作用于CAG的有效靶点，并且对关键靶标基因进行PPI蛋白相互作用关系的分析以及富集分析，在此基础上进行分子对接验证。分析了对传统名方半夏泻心汤进行加减化裁所制成的颗粒剂治疗CAG作用机制。表明了颗粒剂通过“多种化合物、多个作用靶点、多条信号通路”对CAG产生治疗效果，发挥出了天然药材的优势，为研究该颗粒剂治疗CAG的临床应用提供有效的理论依据。

基金项目

本文由2022年度沈阳市科学技术计划(22-321-33-98)和辽宁大学“大学生创新创业训练计划项目”资助。

THE END

STRINGCytoscape网络互作图0820LL

如何对蛋白

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干货如何使用cytoscape玩转网络图？（三）

如何利用cytoscape画互作网络图？

CytoScape下载CytoScape(生物信息分析工具)下载v2021绿色版

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