免疫荧光图片的批量处理技能,Get√抗原抗体阈值

免疫荧光技术又称荧光抗体技术,该技术主要通过抗原-抗体反应以检测或定位各种抗原,可实现特异标志物的可视化。目前,随着各类期刊要求的不断提高,在免疫荧光实验中,许多期刊都要求提供免疫荧光图片的荧光强度定量图。但在小伙伴们的日常数据处理中,常常只能一张一张地处理图片,这对数据的处理效率大打折扣,接下面将详细介绍免疫荧光图片的批量处理方法,需要的小伙伴们快打开电脑一起学起来吧!

所需软件:ImageJ

前期准备:将所有需要分析的免疫荧光图片放到一个文件夹中,文件夹命名input;再另建一个空的文件夹,命名output。具体步骤如下:

打开ImageJ软件——点击File→Open——导入一张免疫荧光图片

Step.2

点击软件工具栏中的Plugins→Macros→Record

此时会弹出Recorder页面,此页面是用于记录后续图片处理整个流程的代码区,记得处理过程中不要关闭该页面,这是后续实现批量处理的关键!!!

Step.3

点击Image→Type→8-bit(图片变成黑白色)→点击Image→Adjust→Threshold

此时弹出Threshold页面,且可以发现图片中荧光部分被特异识别了出来,在该页面中,可以手动调节阈值以改变其识别荧光区域;但为减小因人为调整阈值而引起的误差,通常会点击左下角的Auto,让软件自动识别荧光区域。

Step.4

点击Analyze→SetMeasurements

此时弹出SetMeasurements页面,大家可自行选择需要测定的项目。通常,作者会选择Area、Meangrayvalue、Integrateddensity、Displaylabel和Limittothreshold,然后点击ok即可。

Step.5

点击Analyze→Measure

此时弹出Results页面,可以发现,刚才在SetMeasurements页面所选中的测定项目都已得出相应的结果。此时,一张免疫图片的分析工作就到此结束。

Step.6

复制recorder页面代码→点击Process→Batch→Macro

此时会弹出BatchProcess页面,点击input,选中input文件夹,点击output,选中output文件夹;outputformat中可自行选择输出的文件格式,然后将Recorder页面中的代码复制到BatchProcess页面下方的空白区域中,点击process即可。然后,会弹出Results页面,input文件夹中所有荧光图片均已得到相应结果。

Step.7

点击Results页面右上角File→Saveas

可对测定结果进行保存,其中Mean即为所需的平均荧光强度。

THE END
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