3、筛选感兴趣的通路，重新做PPI分析
我们选择P值最小的通路hsa04668：TNFsignalingpathway，复制对应的G列的44个基因，使用Notepad++的替换功能，将'，'替换成'n'，生成基因列表，用于PPI重新分析。
导入44个基因，重新分析，分析完成后，看到在网页上看到PPI网络图。
点击Export，选择文件和图片下载。文件可以使用Cytoscape软件绘制更专业的网络互作图。
THE END
新闻媒体
2020-06-19 00:00:00
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5.绘制scenic的转录因子调控网络图其实我想画这张图,是scenic分析后转录因子的调控图。 出自健明大佬分享的教程 我记得小洁老师讲过ceRNA调控网络有类似的图。回去找了教程,看到ceRNA调控网络和这个图...https://www.jianshu.com/p/3eaf055a637b
6.老师,请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图,我上传了...文本编辑建议用notepad++专业的文本编辑软件，不要用记事本，避免不必要的错误；https://www.omicsclass.com/question/2420
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9.四氢姜黄素在制备预防和/或治疗2型糖尿病合并非酒精性脂肪肝的...51.为了更形象的展示化合物-靶点-通路之间的关系,因此构建它们关系网络图。具体做法:通过上述资料获得的靶点和靶点的通路,将化合物-靶点和靶点-通路的信息整理好,导入cytoscape3.7.1(http://www.cytoscape.org/)软件,再输入定义各内容的属性文件,选中同一属性内容进行操作使之直观,并通过network analyzer插件评价网络...https://www.xjishu.com/zhuanli/05/202111501702.html/
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2.cytoscape绘制互作网络图(一)cytoscape网络互作图目前很多人可能都在考虑如何绘制一个好看的互作网络图,绘制这样的图是一件很难事情,下面我会分几次来分别讲述,如何绘制: 一、基本互作图的绘制 首先,需要一个绘制互作网络的软件,cytoscape,该软件是用Java来写的,在安装之前需要先安装Java,在这里我不详细去介绍,怎么下载并安装这个软件。 https://blog.csdn.net/weixin_43949246/article/details/101676171
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