1、门诊报销携带资料：门诊发票、合作医疗证历本（或病历）。
2、住院报销携带资料：住院发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、其它有关证明。
3、门诊特殊病报销携带资料：门诊发票、特殊病种合作医疗证历本。
（二）报销流程：参保户将报销所需资料备齐后交村（社区）合作医疗联络员由村（社区）合作医疗联络员审核后报镇合作医疗联络员在由镇联络员送区农易办结报中心进行报销。新型农村合作医疗报账指南医院直接报账：因疾病住院办理住院手续时，向医院出具新型农村合作医疗证直接参与报账。
参合农民持《新农合证》在定点机构门诊治疗，由定点医疗机构按《新农合证》家庭门诊帐户诊帐户现有的金额直接减免医药费用，超出部由参合农民自付。定点医疗机构应及时与农医所进行结算。
参合农民在市、县、乡定点医疗机构住院治疗的，由该定点医疗机构进行直补。由定点医疗机构对其发生的医药费用进行审核，按实施办法规定标准垫付应补助金额。
参合农民在省级定点医疗机构和非定点医疗机构住院治疗的，一律到乡镇农医所补偿。其住院医疗费用一次性在2000元以下（含2000元）的由乡（镇）农医所审核报销，2000元以上或对住院资料有疑问的由乡（镇）农医所审核后交县农医局复核批准后方可报销。
申领补偿时，需带身份证、户口本、《新农合证》（此三证原件审核后复印存底）医疗机构的有效住院发票、出院小结（或病历）、费用清单和转诊证明。
住院费用实行限时报结制度，出院后三个月内可随时办理补偿结算手续，超过三个月的视为自行放弃补偿（外出务工者可延迟到年底）。农医所按实施办法规定标准应补偿的金额在10个工作日内支付给参合农民。
新农合在三级省医院门诊补偿：三级医院就诊报销20%，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。中药发票附上处方每贴限额1元。新农合在三级省医院住院补偿：报销范围：药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费，限额200元；手术费（参照国家标准，超过1000元的按1000元报销）。报销比例：三级医院报销30%。新农合在三级省医院报销程序：参保者出院后，将经患者本人签字或盖章的住院发票、出院记录、费用清单、转诊证明及本人身份证复印件或户籍证明缴本乡镇合管所，经审核后集中统一送交市农保业务管理中心。