区别：投保对象不同，缴费标准不同，报销比例和报销范围不同。
1、投保对象
新型农村合作医疗是针对农村人口实行的医疗制度，医保是针对城市居民及企业职工（分为居民医保和职工医保两种）。
2、缴费标准
新型农村合作医疗和居民医保的缴费虽然每年是固定的金额，但职工医保则跟个人工资以及当地平均工资挂钩。
3、报销比例
多地已开始实行城镇居民医保和新农合统一的政策，新农合的报销比例也在逐渐往医保报销比例上靠近。
4、报销范围
医保报销范围比新农合广，像新型农村合作医疗在一些大医院门诊就不能报销，但也是上面提到了的统一政策，新农合的报销范围也正在向城镇居民医保靠拢。
个人医保
【农村合作医疗】
参保范围：年满16周岁（不含在校学生）、未参加城镇职工基本养老保险的农村居民，可在户籍地自愿参保。
缴费方式：新农保基金由个人缴费、集体补助、政府补贴构成。
领取条件：年满60周岁、未享受城镇职工基本养老保险待遇的农村有户籍的老年人，可以按月领取养老金。
【社会保险】
是在参加工作的，有部分由自己缴纳，一部分由公司缴纳：
有养老、医疗、工伤、失业、生育、公积金（五险一金）
【养老保险】
至少累计缴纳满15年社保，不过多缴多得，退休后(男60，女55)就可以享受养老待遇。就目前而言，任何人累计买十五年社保，就可以在退休时享受当地退休养老待遇。
【医疗保险】
买了医疗保险，就可以享受门诊报销，住院优惠。医疗保险的购买，虽然企业与个人都需要支付费用，但个人当月缴纳的医疗保险费，全都转账到自己的医保卡或者存折上，相当于个人也不用缴纳费用。平常都可以使用这个账户的钱来购买药品或交费。而且，缴纳了医疗保险，也就不用再怕生病治疗费用高的问题，因为有国家担保，最高报销额按全市上年度年平均工资的4--6倍补偿。患大病超过最高支付额的部分可由重大疾病医疗补助金按90%--95%的比例支付，并最高可再支付15万元(重大疾病费用由企业购买)。退休以后，男缴满30年，女缴满25年不用再缴，也可以享受医疗保险待遇。
养老保险和医疗保险是不冲突的。
医疗保险
医疗保险的好处:
（一）门诊待遇
1、参加居民医疗保险A档的，医保基金支付标准为：每人每年的累计支付限额为200元；单次门诊费用支付比例为35%；经门诊定点机构转诊（含急诊）到其他定点医疗机构就诊的门诊费用，支付比例为25%；每次支付限额为12元。
2、参加居民医疗保险B档的，医疗保险基金支付标准为：每人每年的累计支付限额为300元；单次门诊费用支付比例为40%；经门诊定点机构转诊（含急诊）到其他定点医疗机构就诊的门诊费用，支付比例为30%；每次支付限额为20元。
3、参加居民医疗保险C档的，医疗保险基金支付标准为：每人每年的累计支付限额为600元；单次门诊费用支付比例为50%；经门诊定点机构转诊（含急诊）到其他定点医疗机构就诊的门诊费用，支付比例为40%；每次支付限额为60元。
4、参加职工医疗保险的，医疗保险基金支付标准为：每人每年的累计支付限额为800元；在基层卫生服务机构、二级、三级医院就医的，单次门诊费用医疗保险基金支付比例分别为75%、50%、40%；经门诊定点机构转诊（含急诊）到其他定点医疗机构就诊的门诊费用，支付比例分别减少10个百分点；每次支付限额为120元。
（二）住院待遇
参保人因病发生符合规定的住院费用（含参加居民医疗保的符合计划生育规定的生育或终止妊娠，下同），在起付标准以上的部分，由医疗保险基金按规定支付。起付标准按医院等级确定，一级医院100元、二级医院300元、三级医院500元。
1、参保职工连续缴费满6个月后（不含6个月），在本市行政区域内定点医疗机构或经转院到本市行政区域外定点医疗机构就医的，发生符合规定的基本医疗费用，职工医疗保险基金支付的比例为：在职职工90%，退休职工95%。未办理转院手续，自行到本市行政区域外定点医疗机构住院治疗的，基金支付比例为75%。到本市行政区域外非定点医疗机构治疗的，基金支付比例为60%。参保职工连续缴费不满6个月的，其住院发生的基本医疗费用，基金支付比例统一为60%。参保职工年度内发生符合规定的住院基本医疗费用按规定报销后，超过职工医疗保险基金最高支付限额的部分，由补充医疗保险基金支付90%，个人自付10%。
2、参保居民因病住院，发生符合规定的住院基本医疗费用，居民医疗保险基金支付标准为：⑴、参加A档的，一级医院75%，二级医院55%，三级医院40%。⑵、参加B档的，一级医院80%，二级医院60%，三级医院45%。⑶、参加C档的，一级医院85%，二级医院75%，三级医院65%。⑷、办理转院手续（含急诊）的参保居民到本市行政区域外定点医疗机构住院治疗所发生符合规定的基本医疗费用，居民医保基金支付比例按本市行政区域内同级医院标准执行；未办理转院手续自行到本市行政区域外医疗机构住院治疗所发生符合规定的基本医疗费用，居民医疗保险基金支付比例分别减少15个百分点（异地就读的学生除外）。