1.属性有区别：商业医疗保险属于商业性质，由保险人和投保人双方按照自愿原则签订保险合同，保险公司可以从中获得盈利；医保则属于社保的一种，具有社会福利性质，是国家或地方通过立法执行的，其中，城镇职工医保强制用人单位必须为员工购买，城乡居民医保和灵活就业医保则可由个人自愿选择其中的一种进行参保；
2.保障期限有区别：商业医疗保险一般是交一年保一年，但是有保证续保的，比如保证6年续保、保证20年续保；医保中的城乡居民医保则是交一年保一年，城镇职工医保和灵活就业医保则是交一个月保一个月，但是只要交满当地规定的缴费期限，那么就可以终身享受医保待遇；
3.保费缴纳有区别：商业医疗保险由投保人进行缴纳；医保中的城镇职工医保则由用人单位和员工共同缴纳，城乡居民医保和灵活就业医保则是由个人缴纳，但一般有国家补助；
5.保险对象有区别：商业医疗保险以自然人作为保险对象，但是对被保险人有投保年龄、健康方面的限制；医保中的城镇职工医保则以职工作为保险对象，灵活就业医保以灵活就业人员作为保险对象，城乡居民医保则以出生满28天以上居民作为保险对象；
6.作用有区别：商业医疗保险的作用在于当被保险人发生保险事故后，对其产生的医疗费用进行报销，从而弥补被保险人的经济损失；医保的作用则是在于维护社会公平和社会安定，实际上属于国民收入再分配的一个方面；
7.保险待遇有区别：商业医疗保险一般是依据一定金额补偿，补偿金额具有固定性，换言之，商业医疗保险是保险公司参照保险的大数原则来具体操作的，具有商业性的救济性质；医保则通常是依照医疗费用的一定比例给予补偿，数额是有浮动的，并不完全以个人缴纳的保费为准，具有社会救济的性质；
8.报销比例有区别：商业医疗保险一般可以100%报销，但若以社保身份参保却未以社保身份就诊并结算，那么报销比例就会有所降低，但一般也还能报销60%-90%；医保则一般可以报销60%-95%，不过具体报销比例还以当地政策为准；
9.起付线有区别：商业医疗保险中的百万医疗险起付线，也就是免赔额，一般为1万，小额医疗险的免赔额则一般为100-300，有的小额医疗险则没有免赔额；医保的起付线则一般比较低，一般为几百，不过如果是门诊报销，则通常没有起付线，不过具体还要以当地政策为准；
10.权利和义务对等关系有区别：商业医疗保险的权利和义务是建立在合同关系上的，任何一个有完全行为能力的人，只要自愿和保险公司签订了保险合同并按照规定缴纳保费，那么该被保险人就能获得相应的保险金给付的请求权，保额的多少则取决于所缴纳保费的多少。也就是说，保险公司和投保人之间的权利和义务关系是一种等价交换的对等关系，表现为多投多保，少投少保，不投不保；医保的权利和义务关系则是建立在劳动关系上，只要劳动者履行了为社会劳动的义务，那么就可以享受医保待遇。有时候为了便于用经济手段进行管理，增强劳动者的费用意识，要求缴纳少量保费，但他们所领取的保险金和所缴纳的保费数额并不成正比例关系，即权利与义务关系并不对等。