交强险和机动车的全险商业险都是在保险公司缴纳的，车船使用税可以在保险公司缴纳，也可以在税务局办理缴纳，如果未缴纳车船税，保险公司可以作为扣缴义务人来进行征收。
1、地税局
想要知道车船税在哪个部门交就需要了解什么是车船税，车船税全称是车船使用税，它是地方政府向车辆使用者征收的一种税。所以它理应各个地方的地税局征收该险种。不过也正是因为它是属于地税的一种，所以在不同的地区当中车船税的缴纳费用还是有一定区别的。
2、车管所
有相当一部分车主在决定车船税在哪个部门交的时候选择的部分就是车管所，因为汽车在验审的时候有一个条件就是一定要保证当年的车船税已经完成缴纳。而有的地方车管所为了让车主在缴纳车船税的时候更加的方便所以开设了车船税缴纳的服务窗口，这也让用户不用再关心车船税在哪个部门交的问题，不过这种缴纳方式只在部分地区当中有，在很多其它的城市当中还未开展。
3、保险公司
税务机关应当加强车船税风险管理，构建车船税风险管理指标体系，依托现代化信息技术，对车船税管理的风险点进行识别、监控、预警，做好风险应对处置工作。
税务机关应当根据国家税务总局关于财产行为税风险管理工作的要求开展车船税风险管理工作。
税务机关重点可以通过以下方式加强车船税风险管理：
（一）将申报已缴纳车船税车船的排量、整备质量、载客人数、吨位、艇身长度等信息与税源数据库中对应的信息进行比对，防范少征、错征税款风险；
（二）将保险机构、代征单位申报解缴税款与实际入库税款进行比对，防范少征、漏征风险；
（三）将备案减免税车船与实际减免税车船数量、涉及税款进行比对，防范减免税优惠政策落实不到位风险；
（四）将车船税联网征收系统车辆完税信息与本地区车辆完税信息进行比对，防范少征、漏征、重复征税风险等。
税务机关应当根据本地区车船税征管实际情况，设计适应本地区征管实际的车船税风险指标。