安捷伦DNA微阵列芯片扫描仪是一个具有48片装片器的扫描系统，它能够读取任何1"x3"规格玻片微阵列(安捷伦与非安捷伦产品均可)，并且可以利用安捷伦图像分析采集软件无缝连接进行图象分析。
扫描过程利用安捷伦SureScanHighResolution技术，动态自动聚焦功能会不断进行调整，以保持样点的聚焦；超低限检测、最佳的精确光学系统、宽动态范围以及最低的光谱干扰使用户能够检测微弱的信号，并且获得快速、准确和可靠的结果。快速扫描可在2，3，5，10微米分辨率下同时进行双色扫描，迅速得出结果。具有开放式扫描功能，可自由地使用安捷伦芯片扫描仪扫描和图象解析安捷伦或非安捷伦制作的1"x3"(25mmx75mm)芯片，厚度和宽度可有一定的差别。
2、GenePix4100A生物芯片扫描仪
建立在Axon的世界领先的光学、电子和软件设计的基础上，GenePixPersonal4100A生物芯片扫描仪相比于更昂贵的芯片扫描仪来说，具有同等的质量和简捷使用的优点，但它的桌上型小巧尺寸使它更适用于每个实验室。
虽然GenePixPersonal生物芯片扫描仪更为简捷，但它拥有您在基因组学、蛋白质组学或药物筛选领域的生物芯片全部研究所需的灵敏度、通量、可靠性和灵活性。GenePixPersonal的系列扫描模式使Axon能够在勿须牺牲您一直期待的Axon的高质量的基础上，即可减少开发和生产成本。
3、VersArrayChipReader芯片扫描仪
Bio-Rad公司的VersArrayChipReader系统是专为优质而快速地对芯片进行数据采集而设计的高度灵敏激光共聚焦系统。这种芯片扫描仪采用了ZL的技术，能增加信号采集并最大限度地提高使用简便性。缺省设置可获取优化的图像采集，而高级使用者可以拥有对激光能源和光电倍增管增益的完全控制以及“闲置”调节。实时反馈系统可监控激光和光电倍增管的调节，以获取优化的检测效果。
4、NimbleGen芯片扫描仪
NimbleGen芯片扫描仪是针对NimbleGenDNA芯片进行优化、展示NimbleGen芯片所有潜能、并且获取完整信息的高性能芯片扫描仪。具有2微米像素分辨率使得高密度NimbleGenDNA芯片能够获得理想的扫描结果；自动进样装置可24小时批量处理多达48张芯片，而无需人工操作；内置QC内参芯片可对芯片结果进行轻松校正，保证扫描结果准确可靠；确保高质量数据及可靠的实验结果；确保了现有高密度及未来超高密度NimbleGen芯片的适配性。
5、ScanArray激光芯片扫描仪
6、GeneTACLSIV激光芯片扫描仪
GenomicSolutionsGene公司出品的GeneTACLSIV激光芯片扫描仪具有以下特点：采用非共聚焦扫描光路；配有4个激光器、7块滤光片；1个PMT或2个PMT可选；可扫描25mm×75mm尺寸的标准生物芯片，用户可定义的最大扫描面积为22mm×65mm；灵敏度0.1mol/μm2，16位数字化信号输出；分辨率2～30μm可调，10μm分辨率时的扫描速度小于3分钟；具有条码读出功能，24片载片台；外形尺寸为0.92m×0.59m×0.61m，重量120kg。
7、GenePix4000B激光芯片扫描仪
8、GeneTAC2000CCD芯片扫描仪
GenomicSolutionsGene公司出品的GeneTAC2000CCD芯片扫描仪具有以下特点：500w氙灯，可冷却至-25℃工作的1317×1037像素CCD；配有4块激发滤光片和4块发射滤光片；扫描面积36mm×28mm，分辨率27μm；16位数字化信号输出；24片载片台。