物流公司收到的运费发票通常有增值税专用发票和普通发票两种。
增值税专用发票：
可以用于抵扣进项税额。对于一般纳税人的物流公司来说，这是降低税负的重要凭证。
发票上明确标注了货物或应税劳务名称、规格型号、单位、数量、单价、金额、税率和税额等信息。
普通发票：
不能用于抵扣进项税额，但可以作为成本费用的凭证入账。
普通发票的内容相对简单，一般只包括货物或服务名称、金额等基本信息。
二、账务处理流程
收到运费发票时：
如果是增值税专用发票：
借：主营业务成本/销售费用等(根据运费的用途确定科目)
应交税费——应交增值税(进项税额)
贷：应付账款/银行存款等(根据付款情况确定科目)
如果是普通发票：
借：主营业务成本/销售费用等
贷：应付账款/银行存款等
例如，物流公司为客户运输一批货物，收到运费发票金额为10.000元，其中增值税专用发票上注明的税额为900元。则账务处理为：
借：主营业务成本9100
应交税费——应交增值税(进项税额)900
贷：应付账款10000
支付运费时：
借：应付账款
贷：银行存款/库存现金等
月末结转成本：
借：本年利润
贷：主营业务成本/销售费用等
三、注意事项
发票的真实性和合法性：确保收到的运费发票是真实有效的，发票上的信息与实际业务相符。可以通过查验发票的真伪、核对发票上的开票单位与实际提供运输服务的单位是否一致等方式进行核实。
进项税额的抵扣范围：只有用于应税项目的运费发票才能抵扣进项税额。如果运费用于非应税项目、免税项目或集体福利、个人消费等，则不能抵扣进项税额。
发票的时效性：按照税法规定，增值税专用发票的抵扣期限为自开具之日起360天内。因此，物流公司应及时处理收到的运费发票，避免因逾期而无法抵扣进项税额。
运费的分摊：如果一笔运费涉及多个业务或项目，应合理分摊运费成本。可以根据货物的重量、体积、运输距离等因素进行分摊。