1、出境原因不同。商务签证主要指有关人员因公务或者个人原因去目的地国家从事投资、贸易、会议、展览、劳务等方面事务所进行的实地考察或洽谈。这类人员进入目的地国时需持商务访问签证。工作签证是让你可以合法在国外工作，并由雇主根据当地劳工法例支付你薪水的签证；
2、申请材料不同。申请商务签证一份填写好的短期签证申请表，表格上贴近照一张；护照有效期需超过所申请签证有效期三个月，并附护照个人资料页复印件一份；中方公司出具的正式介绍信等；工作签证要提供证件身份证、户口本、健康证、护照、存款证明、照片、体检，提交体检表；通过以后，需要申办护照、卫检证等；
3、申请条件不同。商务签证的申请人在提出申请时，需要有足够的商务理由，没有任何不良意图。签证官一般需要这类签证的申请人提供足够的证据。申请工作签证必须具备的条件是专业技术工作要适合海外，专业不对口，技术不熟练者是不可能符合要求的；有良好的道德修养，遵守前往国的法律和劳动纪律；要有健康的身体，能够适应前往国的气候条件和劳动环境等；
4、申办途径不同。现在大部分国家的申根签证都需要面试，即面签，所以由本人自己前去办理。中国公民申办工作签证，通过专门从事劳务出口的国内企业公司办理申请登记、培训和派遣；或所在单位的劳动人事部门办理；
5、期限不同。工作签证和商务签证都是有一定期限的，不过工作签证的有效期一般较长。
法律依据：《中华人民共和国护照、签证条例》第二条
中华人民共和国签证是中国公民和外国人出、入、通过中国国境的许可证明。
签证分为：外交签证、公务签证和普通签证。
第三条
护照和签证有什么区别
护照和签证是有一定的区别，具体如下：
1、定义不同，签证是准许进入国境的一种许可证明，而护照是证明公民身份和国籍的一种身份证件；
2、申请地点不同，签证一般要去国外的领事馆或者大使馆申请，而护照一般是在本国申请；
3、使用期限不同，签证一般只能对一个国家使用，而护照可以在有效期内一直使用。