徕卡课堂徕卡,助你驾驭基因编辑的隐形剪刀——显微操作技术在基因编辑中的应用

本文将大致回顾小鼠转基因领域的显微操作技术,包括CRISPR/Cas9技术,旨在对这类客户所用的工作流程和术语进行介绍。此外,还针对有用的显微操作系统配置提供一些建议。

显微操作技术概述

图1:CRISPR/Cas9、原核注射和胚胎干细胞移植技术的粗略比较。更多详情请参阅下文。

小鼠胚胎早期发育阶段

图3:原核阶段示意图(透明带标为红色)

图4:囊胚结构示意图

显微操作技术

原核注射(PNI)和胚胎干细胞移植(ESI)

不管是否涉及CRISPR(或者TALEN、ZFN(见第4章)),都要使用原核注射/受精卵注射技术或胚胎干细胞注射技术。这两种技术是成熟的主流技术,在世界范围内使用:

原核注射

受精后约12小时,出现了一个卵子原核和一个精子原核(图2)。在原核融合为一体并构成受精卵细胞核之前,将DNA注入原核阶段受精卵内的一个原核中,直径约80-100μm。注射的靶DNA随机整合到基因组DNA。方向和拷贝数不可预测,即这是一种非靶向技术,快速直接地获得感兴趣的转基因小鼠概率非常有限。

图5:PNI。以固定毛细管固定PN阶段的小鼠胚胎(左侧)。经由毛细管将溶于缓冲液的少量DNA注入其中一个原核(右侧)。可看见被注射的原核发生膨胀。图片以徕卡DIC采集。

图6:PN注射过程DNA随机非靶向整合到基因组中

典型的PNI系统设置:

-DMi8:手动、电动部件可供选择

-透射光轴;S28聚光镜及微分干涉差

-5/10倍物镜(FLUOTAR或NPLAN)用于大致观察

-20倍、40倍长工作距离物镜。40倍物镜用于注射

-3板载物台(固定载物台的物体导杆妨碍显微操作器!)

-气压式手动显微注射仪用于固定(逆时针转动产生的负压可固定胚胎)

-根据实验室偏好选择样品载体(玻璃底器皿、盖玻片等)

PN注射通常在室温下借助放大400倍的微分干涉差显微镜(一些还使用IMC)完成。(一些情况下还将胚胎冷却至10°C,使质膜更僵硬以方便注射)

胚胎干细胞移植

胚胎干细胞注入囊胚(图4),囊胚阶段从第3.5天开始,约128个细胞。内细胞群由多能性胚胎干细胞组成,也就是说它们可以发育并分化为不同类型细胞。有时注入八细胞阶段的桑椹胚胎(图9)。

图7:ESI。以固定的毛细管(左侧)固定小鼠胚囊。经由毛细管将基因修饰的胚胎干细胞注入囊胚腔(右侧)。注射在内细胞群外滋养外胚层细胞之间完成。图片以徕卡AM6000上的徕卡DIC采集。

图8:ES细胞DNA的靶向整合/突变

1)利用分子生物学技术创建含有靶DNA以及新霉素抗性位点、翻转酶识别位点(FTR)和CRE重组酶识别位点(loxP)的DNA。

2)通过转染方式将靶DNA注入ES细胞。重组体通过同源重组整合到基因组DNA。

3)往细胞培养物中添加新霉素(一种抗生素),以选择产生的ES克隆。只有具备新霉素抗性的克隆才能存活生长。挑出这些克隆继续培养。

4)添加翻转酶(一种切割DNA并将其重新结合的重组酶),消除新霉素抗性。

5)通过转基因小鼠与另外一只转基因“CRE小鼠”交配,loxP位点可以条件性敲除。表达CRE重组酶的小鼠通常具有类似组织特异性的表达,这种特异性的表达使小鼠具备例如在大脑中的基因的靶向敲除。

经由同源重组及ES细胞注射的靶向突变,多年来已成为“金标准”。与CRISPR相比,不足之处包括:

选择ES细胞克隆费时

载体克隆和ES细胞工作耗时约3个月

生成纯合子小鼠耗时约1年

如上所述,在大约99%的案例中,产生的嵌合体是杂合的。最终目的是获得用于研究的纯合子动物。

这是一个费时费力的交配、筛选过程:

1)胚囊(♀或♂)+ES细胞(♂)产生♂嵌合体。目的是获得生殖细胞中具有ES细胞修饰的嵌合体

2)♂杂合嵌合体+WT♀产生杂合F1(♂或♀)

3)杂合♂+杂合♀产生纯合F2代

纯合子小鼠的两个等位基因上均携带突变。最终获得这些有价值的动物耗时1年左右!

典型的ES移植系统设置:

-DMi8:手动、电动部件可供选择;

-透射光轴;S28聚光镜

-DIC为非必需。胚胎在胚囊阶段已经足够大,其细节容易观察。

-5/10倍;20倍;40倍长工作距离物镜;较小NA=较大景深

-气压式手动显微注射仪用于固定

-油压式或油压式带齿轮手动显微注射仪用于注射ES细胞。

ES细胞注射通常在室温下借助放大200倍的DIC/IMC/PH显微镜完成。

ESI的差异在于将ES细胞注入8细胞阶段的胚胎中(图9)。这项操作通常使用钝端毛细管完成,以免损伤细胞。激光器(Hamilton-Thorne,Octax或Piezo压电式破膜系统)可帮助钝端毛细管穿过透明带和膜。

图9:ESI注入8细胞阶段的胚胎。钝端毛细管

图10:EMBL转基因过程中使用的DMi8、EppendorfTransferMan4r显微操作器和PiezoXpert压电破膜仪。以钝端毛细管进行胚囊注射。DIC

用于小鼠转基因的CRISPR/Cas9技术

用于小鼠转基因的CRISPR/Cas9技术为靶向突变提供了工具(如ESI),但无需繁杂的ES处理工作!(当然CRISPR也可以用于ES细胞突变)。

转录激活子样效应因子核酸酶(TALEN)技术是一种更为成熟的技术。TALE(转录激活子样效应因子)是结合DNA特定序列的蛋白质。TALE与核酸酶融合即为TALEN,这是一种具有高度特异性的DNA剪刀。TALEN使双链断裂。修复机制导致靶基因缺失或敲除。

目前,CRISPR技术相对于TALEN技术而言并不昂贵。

另外一种基因组编辑技术是锌指核酸酶技术,它通过在用户指定位置上造成DNA双链断裂而发生作用。

CRIPR/Cas9技术所用的工具如下所示:

向导RNA:这种RNA与用户修饰的靶DNA同源。向导RNA与DNA上的大约20个核苷酸结合。RNA链的其余部分用于结合Cas9核酸内切酶。需要对20个结合的核苷酸进行设计,以找到/发现靶序列。

Cas9核酸内切酶:切割效率高,有时甚至切割两个等位基因。

将向导RNA和Cas9蛋白(或Cas9的DNA或mRNA)注射到受精卵里,Cas9切割DNA,修复机制开始起作用。该方法在第一代小鼠体内产生点突变的概率高。更先进的技术是注射携带靶基因或突变的同源DNA以及向导RNA/Cas9混合体。经由同源重组插入DNA相当有效。

小鼠转基因用CRISPR/Cas9的优点/缺点:

优点:

+Cas9切割效率非常高,有时甚至切割两个等位基因,即可获得同源1代小鼠!

+无需繁琐的ES细胞处理工作

+CRISPR/Cas9技术不依赖于小鼠(而PNI和ESI则依赖),即它也可用于其他物种(猪等)。

缺点:

-迄今已公布的最长插入片段为3kB

-目前loxP条件性敲除效率低

需要注射高浓度黏性分子(如RNA、蛋白质),会堵塞毛细管。因此需要更粗的毛细管,而且要求平角注射!

Cas9高效率地剪切DNA,DNA的修复机制造成了点突变。

*注射gDNA+Cas9+同源的DNA

图11:CRISPR/Cas9技术

典型的CRISPR/Cas9系统设置

与PN注射设置相同,以下除外:

将浓度较高的黏性CRISPR成分(RNA、蛋白质)注入受精卵时需要使用较粗的毛细管。这些毛细管结构笔直,内径较大,大多数实验室均制作。

因此极力建议沿着真正的平角方向注射(见图10),以避免胚胎受损。

此外,使用Piezo压电式破膜系统,可以更轻松地穿过透明带,尤其是质膜。

显微操作器水平移动,将目标片段注入悬浮细胞内

图12:受精卵注射过程的注射角度。显微操作器水平移动,零度角注射可使胚胎受损程度较轻。注射角度大于10°将导致受精卵出现较大的“洞”,使其存活率降低。

徕卡显微操作器的移动角度可调,也就是说,即便角度较陡,注射角度本身也是零度角!

这是徕卡显微操作器的一大优点:黏性的向导RNA和cas9蛋白混合物所需的较粗毛细管(减少堵塞)可以沿着零度角方向注射!

其他实验室设备(转基因实验室)

-立体显微镜是选择和控制胚囊、ES细胞和毛细管必不可少的工具。(如TL5000、M80、Rottermanncontrast)

图13:M80及TL5000Ergo。PN注射后的双细胞阶段。

DIC专用玻璃底器皿,一些实验室使用大号盖玻片

毛细管:若干公司提供即买即用产品。许多转基因实验室自己制作毛细管。

直线注射CRISPR/Cas9需要使用内径足够大的毛细管。转基因专家自己制作“高级”毛细管以达到最高效率。

需要工具:

拉针器(如Sutter、Narishige)

磨具(用于毛细管拉拔后加工)

显微拉制仪(用于弯曲毛细管)

上述显微操作器:

徕卡机械式显微操作器:转基因领域赞誉颇高的显微操作器类型。角度可调,即使毛细管角度较陡,也可获得零度注射角。稳健可靠,负载能力强,持久耐用。用户众多。当移动徕卡显微操作器的控制杆时,可以感觉到毛细管触及胚胎。

EppendorfTransferMan4r:全自动显微操作器,具有许多附加功能。可以平角注射。气压式、油压式、油压式带齿轮和Femtojet手动显微注射器经常用于其他显微操作器。性能最优,价格最高。

Narishige:新式Takanome显微操作器无平角操作功能。配备MOM-202D和MON-202D后可以平角操作。油压式显微操作器当然首屈一指。注射器:IM9B、IM9C、IM-11、IM300。

防震:在很大程度上取决于注射室位于地下室还是高层建筑的十层(不管需要与否)。采用被动(铁板、沉重石桌、网球等)和主动设置。

徕卡DMi8转基因系统特点

与Eppendorf和Narishige显微操作器兼容

参考文献

One-StepGenerationofMiceCarryingMutationsinMultipleGenesbyCRISPR/Cas-MediatedGenomeEngineering

HaoyiWang,HuiYang,ChikduS.Shivalila,MeeladM.Dawlaty,AlbertW.Cheng,FengZhang,RudolfJaenisch,Cell153,910-918,May9,2013

-MultiplexedactivationofendogenousgenesbyCRISPR-on,anRNA-guidedtranscriptionalactivatorsystem

AlbertWCheng,HaoyiWang,HuiYang,LinyuShi,YardenKatz,ThoroldWTheunissen,SudharshanRangarajan,ChikduSShivalila,DanielBDadonandRudolfJaenisch,CellResearch(2013)23:1163–1171.doi:10.1038/cr.2013.122;publishedonline27Aug2013

THE END
1.医用手术剪刀特点专业设计:手术剪刀的设计通常非常专业,以适应不同的手术需求,如直剪、弯剪、尖头剪、圆头剪等,以适应不同的组织结构和手术环境。材质优良:手术剪刀通常采用不锈钢材料制成,这种材料具有优良的耐腐蚀性和耐磨性,能够保证手术剪刀的长期使用和手术的安全性。精细加工:手术剪刀的制造过程要求非常精细,以确保剪刀的锋利度...http://jmmedical.cn/news/i786874.html
2.用剪刀剪胡子的优缺点快速问医生病情分析:用剪刀剪胡须,一个优点时对皮肤损伤比较小,缺点是不一定剪干净,而且外观也不一定好看,如果...https://m.120ask.com/askg/bd_detail/106185221
3.家用剪刀;医用剪刀,园林剪刀,它们的优点,特点和区别是什么?园艺师傅使用如图所示的剪刀修剪树枝时,常把树枝尽量往剪刀轴O靠近,这样做的目的是为了减小_,省力. 解答:解:图中剪刀在使用过程中,在同样的情况下,往剪刀轴O靠近,减小了阻力臂,由F1L1=F2L2可知:阻力臂L2越小,越省力.因此这样做的目的是减小阻力臂,可以省力.故答案为:阻力臂. 24663 园艺师傅使用如图所示的剪刀...https://qb.zuoyebang.com/xfe-question/question/60ab31a34e58f88e667cdf045f8b2129.html
4.PDF小剪刀Mac下载PDF小剪刀Mac最新版下载[剪辑工具]PDF小剪刀Mac软件功能 应用的典型工作流程由以下三步构成: - 从其它应用或位置导入PDF文件。 - 在此应用中分割并生成新的PDF文件。 - 将剪裁后的PDF文件导出到其它软件,或保存至其它位置。 PDF小剪刀Mac软件优点 - 支持三种分割模式:纵向、横向或十字。 - 额外选项:奇偶页对称以及单页分割。 - 分割...https://m.onlinedown.net/soft/10077637.htm
1.原装进口剪刀大,你有没有听说过原装进口剪刀?原装进口剪刀大包装的优点有很多,它们的尺寸较大,可以轻松地使用在不同的场合,如厨房、办公室、卧室等,它们的质量好,耐用性高,即使在频繁使用后也不会出现质量问题,它们的设计美观大方,符合现代审美标准。 虽然原装进口剪刀大包装具有许多优点,但也有一些缺点需要考虑,它们的价格较高,可能会给家庭带来一定的经济压力...http://link.sjzxasm.cn/post/195.html
2.推荐情人节促销活动策划其实,千卉花店前几年的情人节策划有很多值得我们继续沿用下去的优点。例如,经过长时间的积累,本花店已经在顾客心目中形成了良好的形象,且已经有不少老顾客一直支持着我们,才能让千卉花店能够在这站稳脚,并且得到人们的好评。但也不可忽视的是,我们店里的缺点也日益显现。尤其是在面对像情人节、春节这样的节日当中,...https://www.unjs.com/fanwen/Jierizhuangti/qingrenjie/jierizhuangti_80249.html
3.剪刀的种类与优点剪刀?切刀?钣金工具万能剪刀 用于切断材料或部件。 广泛应用于各种切割场景。 优点 ·从IV线等细电线以及薄铝板、铁板、马口铁、塑料板等硬质材料,到纱布等软质材料,都能顺利切割。 电工剪刀 优点 ·除纸张外,这种剪刀尤其适合用于切割难以切割的乙烯,或是电话线、电脑线材等机电领域的相关线材。 https://techinfo.misumi.com.cn/exportarticle/article/4096/
4.剪刀式楼梯剪刀式楼梯设计剪刀式楼梯特点设计百科剪刀式楼梯优点: (1)剪刀式楼梯外观轻巧,美观度较高。剪刀式楼梯为一组方向相反的直梯,没有拐角,观感上比较轻巧,不会给人厚重的感觉。 (2)剪刀式楼梯具有防火防烟功能。一般商场或者大型建筑物内的剪刀式楼梯都设置有防火、防烟隔墙并且在楼梯下面设有风道,因此有很好的防火防烟功能。 https://m.bzw315.com/baike/22903.html
5.剪刀式楼梯的优缺点有哪些1、剪刀式楼梯优点: (1)剪刀式楼梯外观轻巧,美观度较高。剪刀式楼梯为一组方向相反的直梯,没有拐角,观感上比较轻巧,不会给人厚重的感觉。 (2)剪刀式楼梯具有防火防烟功能。一般商场或者大型建筑物内的剪刀式楼梯都设置有防火、防烟隔墙并且在楼梯下面设有风道,因此有很好的防火防烟功能。 剪刀式楼梯缺点: (1...http://bh.17house.com/180305/
6.剪刀口房子风水优点是什么风水煞介绍剪刀口房子是没有任何风水优点的,不仅没有什么优点还有很多不好的地方。 民谚有“路剪房,见伤亡”之说,宅基地不宜处在两条街道斜交叉的“剪刀口”上,实践也验证,处在“剪刀口”的建筑,多灾害,这类用地适于街头绿化,进行化解,特殊处理,不宜擅动。 https://www.qiyuange.com/fengshui/42301.html
7.剪刀式体位怎么样:重塑性爱体验,剪刀体位实践指南剪刀式体位有许多优点,其中之一是可以提供深度的刺激,同时可以让双方更好地享受性爱的过程。此外,由于女性可以控制节奏,可以根据自己的喜好调整速度,增加性爱的乐趣。 重塑性爱体验的重要性 重塑性爱体验对于夫妻关系的长久幸福至关重要。通过尝试新的体位和方法,可以让夫妻之间更加亲密,增加对彼此的了解和信任。剪刀式体...https://m.meijianpin.com/zhishi/397554.html
8.剪刀鱼家常做法观赏鱼京韵国际名犬中心3.准备一盆食用凉水,汤锅水烧开,放几滴色拉油,用剪刀剪面团下锅。 4.全部剪好,煮开放凉水再次煮开,反复三次,捞出放凉水中冲凉,捞出备用。 红鼻剪刀鱼优缺点 红鼻剪刀的体长大约在4到5厘米,较为适合弱酸性的水质,饲养最佳水温在25度左右,优点是非常适合在草缸饲养,喜欢光照,可以与很多其他的小型热带鱼或者...https://www.jydogs.com/post/311740.html
9.培智学校义务教育课程标准(2016年版)教师应努力掌握现代信息技术,针对学生的个体差异,合理使用学生生活中较常见的影视、广播、网络等音乐资源,利用现代教育技术中视听结合、声像一体、形象性强、信息量大、资源宽广等优点为教学服务。 (六)因地制宜实施本标准 我国是幅员辽阔、人口众多的多民族国家,各地区、各民族和城乡之间存在差别。各学校和教师应结合...https://yun.nxeduyun.com/index.php?r=space/school/theme/content/view&id=794545
10.练不出袁珊珊那样的马甲线?很可能是你用错了方法优点:锻炼整片腹肌 怎么做: 1.俯身,将双脚放在健身球上,俯撑的双臂伸直; 2.用腹部的力量收拢、折叠你的身体; 3.缓慢放回; 4.重复10遍。 平躺剪刀脚 优点:锻炼下腹部 怎么做: 1.平躺,双手自然贴着身体放下; 2.抬起你的双脚; 3.在保持离开地面的状态中,来回提高放下你的双脚; ...https://m.thepaper.cn/newsDetail_forward_1328812
11.你不知道的细节剪刀脚结构键盘详解鼠标键盘硬件教程X架构很明确提到,X架构就是要结合传统键盘以及笔电键盘两者优点的键盘。 所以,当你在购买剪刀脚键盘时,也记得要考虑一下你本身的特性,是要选用与笔电一样行程的,还是再重新设计按键行程高度的剪刀脚键盘。 虽然基本上玩家应该都知道,不过我还是简单提一下,剪刀脚键盘本身就是薄膜式键盘,不过在按压结构上有其特殊的...https://www.jb51.net/hardware/jianpan/28688.html