莲塘公路口岸位于广东省深圳市罗湖区莲塘街道，北临罗沙路，南至深圳河，在香港命名为“香园围边境管制站”，是构筑深港跨境交通“西进西出、东进东出”重大格局的东部重要口岸。2008年9月，深港双方决定共同兴建莲塘口岸；2013年11月，动工建设;2019年10月，国务院批复同意对外开放；2020年5月，通过国家验收；2020年8月，莲塘口岸正式开通，启用货检功能；2023年2月，启用旅检功能。莲塘口岸采用“两地两检”的查验方式和人车直达、车辆“一站式”通关模式，设计通关能力为旅客30,000人次/日，车辆17,850辆次/日（其中货车15,000辆次/日、小客车2,000辆次/日、大客车850辆次/日），目前旅客最高峰客流已突破10万人次，日均达6.5万人次。
广深港高铁西九龙站口岸位于香港特别行政区境内，为国际性常年开放铁路客运口岸，于2018年9月23日正式对外开放。西九龙站内设立香港口岸区和内地口岸区，按照“一地两检”模式进行出入境查验，由双方分别按照各自法律，进行出入境监管查验。
高铁西九龙站共有四层地下楼层，总建筑面积为38万平方米。地下一层为售票大厅，地下二层为抵达层，地下三层为离港层，地下四层为列车站台，口岸日设计通关流量为20万人次。其中，内地口岸区总建筑面积约10.9万平方米，出入境大厅各设置30条自助和18条人工查验通道；香港口岸区总面积约2.41万平方米，入境大厅设置人工柜台66个，自助通道22条，离境大厅设置人工柜台32个，自助通道29条。西九龙站口岸的设立和开放，不仅提高了通关便利化水平，同时也丰富了“一国两制”实践，为内地同香港深化合作，使香港特别行政区能更好地融入国家发展大局，尤其是对粤港澳大湾区的创新实践提供了有益借鉴。
福田口岸是旅客出入境的陆路口岸，位于福田区裕亨路（福田保税区东侧）。总用地面积62962平方米，总建筑面积82035.85平方米，设出入境大厅各一层，出入境通道共146条。出境大厅内设有边检通道78条（自助式通道20条、人工验放通道58条），入境大厅内设有边检通道68条（自助式通道20条、人工验放通道48条），设计日过境旅客为25万人次。人行通道桥工程连接福田口岸联检大楼和香港九广铁路落马洲管制站，是连接深圳地铁4号线和香港轻铁东部支线的口岸枢纽工程。桥长240米，深方116米，港方124米，桥宽16.5米，上下两层，单向行走，桥内有自动步行梯（深圳一方每层有一部长80.5米的自动步行梯），分别供深港出入境旅客使用（上层为出境，下层为入境）。口岸查验机构有海关、边检、检验检疫局，服务机构有省公安厅驻深签证处，经营单位有银行、免税店等。
罗湖口岸（LuohuPort）位于深圳市罗湖区罗湖商业中心南侧，与香港新界一河之隔，深港两地由一座双层人行桥和一座铁路桥相连，是改革开放前深圳仅有的两个陆路口岸之一，是中国对外交往的重要窗口，也是深圳市客流量最大的旅客入出境陆路口岸之一。罗湖口岸包含联检楼、交通楼二栋建筑物。联检大楼于1984年1月开始动工兴建，1986年6月14日竣工启用，总占地面积为18107平方米，总建筑面积70623平方米。交通楼占地面积5942.55平方米，建筑总面积48387.36平方米，是开敞式8层建筑。罗湖口岸于2006年6月16日采用指纹身份识别技术，2007年1月1日开通旅客自助查验通道。目前，查验通道共计190条，其中自助通道115条（入境57条，出境58条），人工通道75条（入境36条，出境39条）。旅客2-5秒内可以完成自助查验，保障旅客出入境通关排队不超过30分钟。罗湖口岸原设计通关能力8万人次/日（1985年设计规模），目前旅客历史最高峰为39.5万人次/日，日均达17万人次。
皇岗口岸是连接深圳市与香港特别行政区的口岸，位于深圳市南部，是深圳全天候（24h）开放的客货综合性口岸。
皇岗口岸于1985年5月动工兴建，于1988年11月30日经国务院批准后，对外开放，1989年12月29日货运部分启用通车，1994年11月3日货检通道24小时通关，2003年1月27日实行旅检通道24小时通关。2019年6月正式启动皇岗口岸重建项目，目前已经拆除老旅检区，建成临时旅检楼。临时旅检口岸楼占地面积约5.1万平方米，总建筑面积约1.4万平方米，首层为出入境旅客查验大厅，首层夹层及二层为服务用房；查验通道分为旅客查验通道40条，客车查验通道8条。
文锦渡口岸位于广东省深圳市罗湖区黄贝街道，东邻莲塘口岸，西接罗湖口岸，北靠沿河南路，南邻深圳河，也是G107国道终点。1978年，文锦渡口岸经国务院批准对外开放，是改革开放前深圳仅有的两个陆路口岸之一，由一座公路桥与香港相连，以供港鲜活产品过境为特点的客、货运综合性公路口岸。口岸旅检场地于2011年5月改造建设，2013年8月26日旅检恢复运行。
口岸出、入境共30条车辆查验通道。其中货车查验通道18条(入境8条，出境10条)。小车、客车查验通道12条（入境6条、出境6条）。旅客查验通道出境18条（人工8条，自助10条），入境18条（人工8条，自助10条）。
文锦渡口岸为“两地两检”的查验方式，设计通关能力为出入境车辆1万辆次/日，旅客流量3万人次/日。目前，口岸日均出入境车辆2000余辆次，日均出入境旅客4000余人次。
深圳湾口岸是目前亚洲最大的客货综合性公路口岸，位于深圳市蛇口东角头，由口岸区、深圳湾大桥、连接线三大部分组成，通过深圳湾大桥与香港鳌勘石连接。口岸占地117.9公顷（其中香港口岸区域为41.6公顷，深圳口岸区域为76.3公顷）。深圳湾口岸于2007年7月1日正式开通启用，是我国国内第一个按照“一地两检”查验模式运作的陆路口岸。设计通关能力为旅客6万人次/日，车辆5.87万辆次/日（其中货车4.32万辆/日，大客车0.15万辆/日，小汽车1.4万辆/日）。口岸旅检大楼内共有旅检62条出境通道（人工通道15条，自助通道47条），55条入境通道（人工通道17条，自助通道38条）。
海关、边检分别在小（客）车出入境检查通道上，各设小车通道17条、大客车通道2条。货车出境检查通道上，海关设27条，边检设22条，货车入境检查通道上，海关设26条，边检设22条；海关二道设12条。口岸查验机构有海关、边检，经营单位有银行、免税店等。
盐田港口岸位于深圳大鹏湾海域西北部，南与香港九龙半岛隔海相望，分为盐田港区、下洞港区和广东大鹏液化天然气（LNG）专用码头。盐田港区于1990年6月经国务院批准对外国籍船舶开放，1994年7月正式开港。该港区位于距深圳市区13公里，距大鹏湾口12海里。由于大鹏半岛与九龙半岛天然的屏障掩护，湾内水深浪小，无淤积，大型船舶可以自由进出锚地，并被列为中国沿海重点发展的四大国际深水港之一。港区建有大型集装箱专用泊位15个，多用途泊位3个，可停泊10万吨级以上大型集装箱船舶，目前开通每周近100班远洋国际集装箱班轮；下洞港区位于大鹏湾畔，为深圳市东部石油、液化气等危险品码头专用作业区。2002年12月国务院批准下洞港区作为盐田港口岸危险品作业区对外开放，港区内共建有3个独立的栈桥式码头共9个泊位；广东大鹏液化天然气（LNG）专用码头位于深圳东部大鹏半岛秤头角，是“十一五”期间广东省口岸发展规划中主要建设项目。LNG码头建有1个靠泊能力为8万吨级的LNG船专用的栈桥式码头泊位和1个5000吨级的工作船舶。
蛇口口岸位于珠江口东岸、深圳市西部南头半岛南端。它东临深圳湾，南与香港隔海相望，西邻珠海、澳门及深圳机场，北靠南山内陆腹地。蛇口口岸于1981年9月经国务院批准对外国籍船舶开放，是我国改革开放初期第一个由企业自筹资金建设、管理和经营的国家一类口岸。目前，蛇口口岸已建成对外开放泊位共31个，其中集装箱专用泊位10个，多用途泊位9个，修船专用泊位4个，客运泊位8个。
蛇口集装箱码头建有10个泊位，其中，一期工程建设规模为2个集装箱专用泊位，年设计吞吐能力为100万标箱，于1991年8月建成投产，蛇口集装箱码头二、三期工程项目，于2001年上半年动工兴建，共建成8个集装箱专用泊位，其中二期工程2个集装箱专用泊位，已于2003年建成并投入使用，三期工程6个集装箱专用泊位于2010年3月前建成并陆续投入使用。
赤湾口岸位于珠江口东岸、深圳市西部的南头半岛西南端。东连蛇口港，位于蛇口港西侧；南面向伶仃洋，与香港、澳门、珠海隔海相望；西接妈湾电厂和妈湾港区；北靠南山半岛。陆路距深圳市中心30公里，可与广深、广惠公路干道以及广深高速公路、平南铁路衔接；水路与香港、澳门、珠海均在20余海里范围。赤湾码头于1982年8月动工兴建，1983年10月建成一个1万吨级泊位并开港，1984年5月经国务院批准对外国籍船舶开放。港区现有泊位17个，其中集装箱专用泊位6个，码头岸线总长3176米。赤湾口岸是中国主要的散装化肥及粮油进出口中转基地之一，是深圳西部港口群中规模仅次于蛇口港，功能集铁路、公路、水路等运输方式为一体的大型综合性口岸。
妈湾口岸位于珠江口东岸，深圳市西部的南头半岛西侧，东接赤湾港，南面向伶仃洋，与珠江口主航道对接，西邻深圳机场，北以南山半岛为腹地。陆路距深圳市区24公里，可与广深、广惠等公路干道以及广深高速公路、平南铁路衔接。水路距香港、澳门、珠海约20余海里。1987年开始建设，1990年7月建成第一个3.5万吨级多用途泊位，1990年2月经国务院批准对外国籍船舶开放码头岸线总长3877米，该港区现有泊位14个（其中集装箱专用泊位3个，煤码头专用泊位2个）。
深圳宝安国际机场是我国第一家以地方投资为主兴建的机场，一期工程于1989年5月动工兴建，1991年10月正式开通国内航线。1992年2月，经《国务院关于同意开放深圳航空口岸的批复》（国函[1992]9号）批准正式对外开放口岸。新建的航站楼建筑面积45万平方米，年设计旅客吞吐量4500万人次（其中国内旅客3600万人次，国际旅客900万人次）。于2013年11月28日正式启用。深圳机场口岸自2015年11月12日起实行24小时通关。
深圳宝安机场拥有中国现代化程度高的航空货站和货运停机坪，货站内建有现代化的立体散货及集装货处理系统，启用了货物存放、存取机械化自动系统。
与机场配套的福永码头,建设规模为3个1000吨级多用途泊位和4个500吨级的客运泊位。目前开通深圳-香港、深圳-澳门、深圳—中山航线。
大铲湾口岸位于珠江口仃洋矾石水道东南部，深圳西部妈湾港区以北的大铲湾内，港区地理位置优越，水、陆路交通便捷，水路南距香港20海里，北至广州40海里；陆路通过广深高速、机荷高速、107国道以及在建的广深沿江高速公路联系腹地。大铲湾港区岸线总长为11.6公里，陆域面积为10.28平方公里，拟建大型集装箱深水泊位17个，中型泊位7个及19个驳船泊位，设计年吞吐能力为1250万标箱，总投资约450亿人民币。港区整体工程分四期建设。其中，大铲湾港区集装箱码头（一期）工程于2005年9月正式开工兴建，其建设规模为3个10万吨级和2个7万吨级集装箱专用泊位，占地为112万平方米，泊位岸线总长为1830米，设计年吞吐能力为250万标箱，整体工程于2009年11月全部工程完工。2009年5月，《国务院关于同意广东深圳港口大铲湾港区对外开放的批复》（国函[2009]59号），批准深圳港口岸大铲湾港区对外国籍船舶开放。2011年11月，大铲湾口岸正式通过国家口岸验收。
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