母猫会出现生殖、绝育，以及尿液标记方面的问题，常见的主要是以下6个：
为了控制猫的数量，对母猫进行绝育是很重要的。然而，伴随着这次大手术也产生一些问题。猫在做绝育手术时，必须全身麻醉，有时会导致并发症，如更频繁地发生尿路感染。
假孕是母猫最常见的生殖问题之一。交配行为本身会刺激母猫排卵，因此不论有没有成功怀上小猫，孕酮激素都会释放。母猫经历的一系列身体变化显示她怀孕了，但实际上并没有怀孕。假孕的母猫乳头也会变得红、肿，但不会产奶。脂肪堆积导致腹部增大，看上去像是生长发育的胎儿。母猫怀孕的迹象会持续3-7周，之后又会重新发情，所以很明显并没有真的怀孕。假孕对于繁育者来说，的确是个大问题。
另一个常见的生殖问题发生在怀孕期间。事实上，重吸收十分普遍，通常不被视为问题。如果胎儿不能存活，母猫会将胎儿重新吸收回自己体内。有时，在健康小猫出生时，部分被重吸收的胎盘碎片或无法存活的胎儿会排出体外。如果母猫感染了猫白血病病毒（FeLV），在受孕3-4周时，会导致胎儿的重吸收。
这是一个相当常见的生殖问题，会导致母猫反复生出死胎。母猫分泌的荷尔蒙，在子宫内创造了一个有利于细菌滋生的绝佳环境。在轻度病例中，母猫可以再次生育，但如果病情严重，母猫会失去生育能力。
母猫和公猫一样容易在体内形成囊肿。当囊肿附着在子宫或卵巢上时，猫会出现激素失调，导致早产。
尿液标记是未绝育的猫吸引配偶的方式。大多数母猫会在户外标记，但有些母猫也会在垂直的物体上留下少量尿液。这是一种很难纠正的行为，减少压力和焦虑会有所改善。
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