兽用抗菌药大多是处方药，属于处方药的，按照农业农村部《兽用处方药和非处方药管理办法》规定，不能随便购买，需持有兽医处方方可购买，并在兽医指导下使用。
2.严格掌握适应症
正确诊断是选择药物的前提，有了确切诊断，了解致病菌种类，通过药敏试验，选择对病原菌高度敏感的药物。
3.制定合理的给药方案
4.控制用量和疗程
使用抗菌药治疗，就要依据药物说明按时按量投药，不轻易停药，保证疗程。
5.防止产生耐药性
6.避免配伍禁忌
抗菌药物之间以及抗菌药与其他药物联合使用时，有时会发生相互作用，影响药物疗效，引起不良反应，应设法避免。
7.防止不良反应
动物机体的机能状态不同，对药物的反应亦有差异，应用抗菌药物治疗畜禽疾病的过程中，除要密切注意药效外，同时要注意可能出现的不良反应，一经发现应及时停药、更换药物和采取相应解救措施。
8.严格遵守休药期
为有效避免抗菌药物在动物源性食品中残留的发生，要严格遵守休药期的规定。
9.避免影响免疫反应
在进行各种菌苗预防接种前后数天内，不宜使用抗菌药。
10.联合应用抗菌药
联合应用抗菌药指的是不同类别的抗菌药的联合使用，联合应用抗菌药的目的主要在于扩大抗菌谱、增强疗效、减少用量、降低或避免毒副作用，减少或延缓耐药菌株的产生。
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