当激素治疗无效的时候，为了治病你可能必须进行手术。
如果你同时有子宫肌瘤、子宫腺肌症或者子宫内膜异位症比较广泛，那么子宫内膜异位症的手术可能非常复杂，可能需要修补直肠和膀胱。
腹腔镜手术
腹腔镜手术就是用叫做腹腔镜的手术器械进行的手术。目的是：
1.诊断子宫内膜异位症；
2.去除子宫内膜异位症病灶；
3.分解子宫内膜异位症引起的粘连。
腹腔镜是长约30cm，类似望远镜的纤细的手术器械。通过脐部的小切口插入盆腔。它有一个光源和镜头，照亮盆腔并有放大显示的作用，以便妇科医生能够看清楚盆腔器官和子宫内膜异位症病灶。一般会有第二个通道置入手术器械，观察当中发现如果需要进行手术，那么妇科医生通过这个管道进入的器械进行手术操作。
腹腔镜手术和开腹手术不能混淆。开腹手术是腹部有10-15cm切口的手术（而腹腔镜手术只有2-4个1cm的小切口）。目前开腹手术只用来治疗腹腔镜手术不能完成的、非常严重的子宫内膜异位症。
诊断性的腹腔镜——仅仅用于诊断子宫内膜异位症。腹腔镜是诊断子宫内膜异位症的金标准（最可信的方法）。如果腹腔镜没有看到子宫内膜异位症病灶，那么就不应该考虑子宫内膜异位症的诊断。大多数妇科医生也坚持认为应该进行病理检查进行确诊。
一般腹腔镜下看到轻-到中度的子宫内膜异位症病灶，应该同时完成腹腔镜下的手术。手术性腹腔镜是指在腹腔镜下切除子宫内膜异位症病灶，切除粘连。这就意味着，只需要一次手术，诊断和治疗同时完成。为此，手术前，你一定要充分了解并同意。
如果发现子宫内膜异位症很严重，侵蚀了肠管或泌尿系统，那么腹腔镜下的手术可能要推迟，因为，因为要进行充分的肠道和泌尿道的准备，并且获得患者的同意进行肠道和泌尿系统的手术。
子宫内膜异位症的手术是非常困难和复杂的，因此手术的医生需要特殊的技巧和专门的知识。许多妇产科医生能够治疗轻度的子宫内膜异位症。然而严重的子宫内膜异位症需要经验丰富的专家医生。只有很少的妇产科专家能够治疗严重的子宫内膜异位症。
手术过程
子宫内膜异位症手术就是通过切除肉眼可见的子宫内膜异位症病灶和子宫内膜异位症引起的粘连.腹腔镜手术方法可能包括：
1.切除或破坏腹膜子宫内膜异位症病灶;
2.切除或破坏卵巢巧克力囊肿;
3.切除粘连；
4.切除子宫直肠隔的深部病灶；
5.切除子宫；
6.切除一侧或双侧卵巢；
7.肠管和膀胱的手术；
8.腹腔镜下子宫神经切除术（LUNA）和骶前神经切除术（PSN）。{NextPage}
手术技术
子宫内膜异位症手术需要两种技术：切除和凝固。
切除：用剪刀、电刀、激光束切除子宫内膜异位症病灶极其周围组织来去掉子宫内膜异位症病灶。这个技术不损坏病灶内异位的内膜，以便给病理科医生进行病理检查，确定是子宫内膜异位症而不是癌或其它情况。切除允许手术医生把子宫内膜异位症病灶和周围的正常组织进行分离，以确保子宫内膜异位症病灶被完整去除而没有残留病灶。
凝固破坏：
凝固破坏是通过电刀或者激光束烧灼或者汽化病灶。凝固的时候，必须仔细的将全部病灶破坏，防止病灶再生长。同时也必须注意要只破坏子宫内膜异位症病灶而不是下面的正常组织进而损伤肠管和膀胱。因为会损伤下面的正常组织，所以医生会非常讨厌在重要器官上（肠管和膀胱）上进行凝固操作。
卵巢子宫内膜异位症
卵巢子宫内膜异位症的治疗根据病损类型和大小不同而不同。卵巢囊肿称为“内膜异位囊肿”或者“巧克力囊肿”
卵巢表面种植
卵巢表面的异位内膜种植，可以凝固或者汽化进行破坏。
小的卵巢囊肿
直径小于3cm的卵巢囊肿可以进行穿刺引流，囊肿内壁进行检查后进行凝固或者汽化。
大的卵巢囊肿
直径大于3cm的囊肿可以切除、凝固或者汽化。
切除大的卵巢囊肿就是把完整的囊肿从卵巢上切下来，为了确保囊肿的完整，囊肿周围的卵巢组织也被切除一部分。
当引流和凝固大的囊肿，先切开囊肿引流囊液。然后凝固囊肿内壁来破坏它。
选择那种方法？
推荐的是，超过3cm的囊肿要切除，而不是凝固和汽化。完全切除结果是更好的缓解疼痛促进生育，复发的风险更低。
粘连
子宫内膜异位症引起的粘连应该切除，可以用剪刀、电刀、激光等等。当切除粘连的时候，就存在新的切缘再粘连的可能。但是有很多预防措施。一些女性发生粘连和再粘连的可能性比另外一些女性风险要高。再次手术切除粘连也是麻烦的也不建议这样做。
深部子宫直肠隔和乙状结肠直肠的子宫内膜异位症
如果深部浸润型子宫内膜异位症引起症状或将来可能会引起症状，那么手术治疗是唯一的考虑。如果你患有阴道直肠隔深部浸润型子宫内膜异位症而没有症状，那说明是单发的，病灶较小，这样的病灶极少恶化或引发症状。如果病灶侵犯直肠和输尿管，因为会引起梗阻，那么这个病灶应该切除。
如果必须手术，那么应该一次手术切除所以的病灶，避免第二次手术。这样的手术是复杂的，困难的，也可能出现比较严重的并发症，你有必要和你的医生深入讨论手术的过程，以便你能够做好准备并接受手术。
深部浸润型子宫内膜异位症的手术，可能包括的沿着深部病灶进行韧带的切除和阴道后壁的切除。子宫和卵巢也许需要也许不需要切除。如果病灶侵蚀了直肠、膀胱或输尿管，引起或即将引起损害，那么可能进行部分肠管、输尿管、膀胱的切除和修补。
如果手术可能涉及到肠管或者泌尿系统，那么医生应该事先和你进行讨论和提前进行计划和准备。为了手术，你需要接受术前的肠道或泌尿系统的准备和治疗。这个手术需要妇产科医生和泌尿科医生、肠道科医生的密切配合。
子宫和卵巢的切除
如果其他任何办法都无效，而你又没有生育要求，才需要考虑切除子宫和卵巢。
如果子宫切除，那么应该把所有的子宫内膜异位症病灶同时切除。
全子宫+双侧卵巢的切除比单纯切除子宫而保留双侧卵巢更能缓解术后的疼痛，再次手术的风险也更低。
如果切除子宫，那么要同时切除宫颈，保留宫颈会因为宫颈和骶韧带的子宫内膜异位症引起持续的疼痛。
切除子宫和部分降结肠对治疗子宫直肠隔的子宫内膜异位症是有效的，能缓解疼痛，提高生活质量。{NextPage}
腹腔镜子宫神经切除术和腹腔镜下骶前神经切断术
腹腔镜下子宫神经切除书（LUNA）和腹腔镜骶前神经切断术（LPSN）是在腹腔镜下切断子宫到大脑的神经，以缓解慢性疼痛。
对两种手术进行回顾性的研究表明，对缓解慢性疼痛效果有限。子宫神经切除术，与腹腔镜手术结合也没有额外缓解疼痛，而骶前神经切除术比单纯腹腔镜手术能更缓解疼痛。做了腹腔镜手术和骶前神经手术的女性可能会出现便秘的并发症。如果你的医生倾向于做这两种手术，那么你要问他如果这样做手术的成功率是多少。
手术
根据需要切除病灶的大小和多少不同，腹腔镜手术可能需要半个小时，也可能需要6个小时。
医院的程序和做法也各不相同。以下的信息仅仅是个腹腔镜手术的指南，你可以咨询你的医生或者医院，他们是不是有患者指南手册，向患者解释医院的诊疗程序和做法。
术前6小时不能吃饭和喝水。只要有任何进行肠道手术可能性，术前必须进行肠道准备以保证手术的安全进行。这包括喝一些东西来清洁肠道。
要求你术前提前住院，了解你的一般健康状态，曾经吃的药物和曾经做过的手术，测量血压和脉搏，剔除阴毛，给你一套病员服。麻醉师也要和你讨论以前手术是否有药物过敏或者其他的问题。
进入手术室，给你进行全麻和气管插管，用呼吸机维持呼吸。
脐部做个5mm的切口，二氧化碳经过这个切口进入腹腔。二氧化碳可以使盆腹腔内的器官互相分离，以便腹腔镜能够安全地进入盆腔。然后腹腔镜经过这个切口进入盆腔。妇科医生还要在下腹部做另一个小切口，放置另一个手术器械，用它来移动盆腔内的器官，以便医生能全面检查整个盆腔。再放一个器械进入开放的盆腔，根据手术的需要使子宫前后移动。然后妇科医生彻底的检查盆腔发现那些明显的或者不明显的子宫内膜异位症特征。通过插入较低的切口和宫颈的器械，提升或者摆动子宫和卵巢，以便全面检查他们的表面。
如果发现内膜异位病灶，妇科医生通常会取些子宫内膜组织样本，然后送到病理科进行检查确定是子宫内膜异位症。因为子宫内膜异位症通常会和其它疾病混淆。
一旦确诊，妇科医生会填一张图表，表明病灶、巧囊、粘连的位置。rAFS评分表是常用的评分方法。
如果要做腹腔镜手术，那么医生要在下腹部做2-3个小切口，这些切口用来插入手术所需要的器械。
手术完成后，取出腹腔镜和手术器械，放出二氧化碳气体。切口用胶水粘合或者细针缝合。你也会被送回恢复室。
术中和术后的风险和并发症
腹腔镜是相当安全的手术，大多数的并发症很轻，恢复的也相当快。
比较严重的并发症包括：不能控制的出血、器官损伤例如肠管、膀胱和大血管、气体栓赛（气体进入血管和肺部）。经验丰富的医生能够控制这些并发症。
术后也可能发生并发症，包括：膀胱排空障碍、伤口感染、尿路感染、子宫感染、阴道分泌物增多等。
效果
很难提供关于腹腔镜手术治疗子宫内膜异位症疗效的可靠信息。一方面不可能精心设计临床试验来评估手术效果，另一方面手术效果受到患者个体差异、激动程度、子宫内膜异位症严重程度、侵犯的广度、医生的经验等等的影响。多因素的影响使我们难以得出关于手术效果的评估。虽然如此，外科医生的经验和外科医生是决定腹腔镜手术治疗子宫内膜异位症结果的关键因素。因此，如果有可能，你要找有经验的医生或者治疗子宫内膜异位症的中心去手术和康复。
一些关键性临床实验的结果的概述：
轻中度的子宫内膜异位症患者，手术治疗的效果优于期待治疗。治疗的随访，90％在一年以后疼痛仍然能够缓解。
在缓解疼痛和提高生活质量方面，切除比安慰治疗效果更好。
对于激素治疗无效的严重患者中，手术治疗的疼痛缓解率高达80％。
子宫直肠隔和乙状结肠的深部浸润型子宫内膜异位症的手术并发症发生率和其他腹腔镜手术发生率相似。
似乎是年轻女性术后容易复发：越是年轻越是容易复发。
术后随访
如果腹腔镜手术后发现下面任何症状，都应该立即通知医生：
发热；
伤口红肿、疼痛、渗出；
严重的腹痛或肠痉挛；
阴道分泌物有异味；
术后24小时后出现呕吐；
小腿的肿胀和触痛，走路时小腿疼痛加重；
呼吸短促、胸痛或者呼吸痛；
腹腔镜手术后4-6周进行随访，讨论手术恢复情况、术中发现以及后续的治疗。