肉毒素在临床可以用于治疗面部皱纹、咬肌肥大、腓肠肌肥大、斜方肌肥大、眼肌痉挛、多汗症（腋臭、手汗）、痤疮、肌痉挛、表情不对称调整、预防瘢痕增生等。
注意事项：
1注射后针眼避水4-6小时，之后洗脸洗澡、化妆均不受影响。
2面部肉毒素治疗后4-6小时内不可平卧，防止肉毒素顺肌间隙被挤压或流到不需要治疗的地方，引起并发症，如眼肌无力。
6注射腓肠肌和斜方肌后，可能出现暂时走路失衡或提肩无力等现象，需小心平衡。
7部分患者注射后饮酒，出现皮疹，因此建议注射后两周不要饮酒。
8偶有极少数患者注射后出现头痛、牙痛、一般数日可以自愈。
9仅有极少数患者出现药物治疗无效的，可以换用进口或国产的不同品牌进行尝试，但仍不能排除天然耐药者。
10肉毒素治疗多汗症(腋臭、手汗等）只是减轻症状，不能百分百停止出汗。因此对轻中度的比较合适。
11肉毒素可以通过抑制皮脂腺分泌治疗痤疮，但是痤疮的病因不解决，仅治疗区不发痤疮，身体其他部位仍然会继续长痤疮。
13瘢痕手术早期可以注射肉毒素，减少瘢痕周围的张力，预防瘢痕的增生，通常一次治疗维持半年，就可以达到稳定效果。
14肉毒素最早应用于眼肌痉挛然后发现有减轻皱纹的功效，但眼肌痉挛的患者用肉毒素只是治标。需要根据病因，选择更好的治疗，是外伤性肌痉挛或是脾虚型肌痉挛，因采用不同的治疗方式。
15大剂量使用肉毒素有中毒风险，一般300u内注射是安全的。
16氨基糖苷类抗生素（如庆大霉素等）或大观霉素，其影响神经肌肉传导的药物（如神经肌肉阻滞剂，包括去极化和非去极化、林可酰胺、多黏霉素、奎尼丁、硫酸镁和抗胆碱酯酶剂）会加强肉毒素作用，应避免同时使用。
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