母猫通常会出现生殖与绝育的问题，而尿液标记则是另一个问题。
为了控制猫的数量，主要的办法就是给母猫做绝育手术。然而，做绝育手术前，猫必须接受有可能导致并发症的全身麻醉，在绝育手术后患上尿路感染。
假怀孕是母猫最常见的生殖问题之一。交配行为会刺激母猫排卵，有时并未怀上，但母猫体内仍在分泌黄体酮。这使她看上去像是怀孕了，但实际上并没有。母猫脂肪沉积导致腹部增大，乳头也变得红肿，但不能分泌乳汁。对于繁育者来说，假怀孕是个问题，会一直持续3-7周，之后再次发情。
另一个常见的生殖问题发生在怀孕期间。如果胎儿不能存活，母猫会将胎儿重新吸收回自己的体内。有时部分再吸收的胎盘碎片或死胎在健康的小猫出生时会排出体外。
慢性子宫内膜炎是一个相当普遍的生殖问题，会反复导致出现死胎。母猫的荷尔蒙创造了一个子宫环境，是有害细菌的完美滋生地，在症状轻微的情况下，母猫可以再次生育，但症状严重是不可能生育的。
公猫、母猫都容易在体内产生囊肿。当囊肿附着在子宫或卵巢上时，母猫会出现荷尔蒙失衡、不能生育的问题。
用尿液标记是猫吸引配偶的方式。大多数母猫在外面做标记，但有些母猫会在垂直的物体上留下少量尿液。这个行为很难消除，但减少压力和焦虑可以有所改善。
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