在水产养殖过程中，不是所有的药物都对所有的鱼病有效，也不是所有的渔药都可以适用于所有的鱼。许多鱼类可能会对其中某一种渔药有特别的敏感性，一旦用药不慎，就会发生鱼类伤亡事故，给养殖户造成重大损失。
1、菊酯类杀虫药（广谱性杀虫剂）：
水质清瘦，水温低时（特别是20℃以下），对鲢鱼、鳙鱼（花鲢、胖头鱼、大头鱼）、鲫鱼毒性大；如沿池塘边泼洒或稀释倍数较低时，会造成鲫鱼或鲢鳙鱼死亡。虾蟹禁用。
2、阿维菌素溶液（广谱性杀虫剂）：按正常用量或稍微加量或稀释倍数较低或泼洒不均匀，会造成鲢鱼和鲫鱼的死亡。海水贝类（鲍鱼、牡蛎、扇贝、文蛤、珠母贝、缢蛏{yìchēng}）在泼洒不均匀的情况下，易导致死亡。
常用的杀菌制剂，对细菌性疾病具有很好的治疗作用，可调节、净化水质。对病毒性疾病不能使用。如草鱼出血病、鲤鱼急性烂鳃等；剂量要严格控制，容易杀水过重，造成水澥；不能和辛硫磷混用，易引起死鱼现象。
6、海因类含溴制剂（如溴氯海因、二溴海因）：
有效成份大于20％的，在水温超过32℃时，若水体内三天累计用量超过200克／亩·米，会造成在脱壳期内的甲壳水生动物（虾蟹）死亡。
7、杀虫药（敌百虫除外）或硫酸铜：
当水深大于2米，如按面积及水深计算水体药品用量，并且一次性使用，因药物渗水深度一般不会超过2-3米，如果仍按实际深度计算用药则会容易造成鱼类死亡，概率超过10％。
8、氯硝柳胺（针对绦虫，又称灭绦灵，杀虫剂）：
用于绦虫治疗有特效，但对鱼类剧毒，需要使用时注意把握好药物的用量。
9、甲苯咪唑溶液（针对指环虫、三代虫等，杀虫剂）：
甲苯咪唑是治疗三代虫、指环虫的理想药物，杀灭效果好，不会引起鱼停食，但是容易产生抗药性，长期使用影响治疗效果。
禁忌：按正常用量，胭脂鱼会发生死亡；淡水白鲳、斑点叉尾鮰对药物敏感；各种贝类对药物敏感。无鳞鱼不能使用。
无鳞鱼是指天生无鳞和鱼鳞很小的鱼种，并不是单指一点鱼鳞都没有的鱼，常见河里的无鳞鱼是泥鳅鱼和河鳝鱼，鲶鱼，银鱼，鮰鱼，黄颡鱼，黑鱼（乌鳢），常见海里的无鳞鱼是海鳗、带鱼等。
治疗大型的寄生虫病效果好，如三代虫、指环虫、锚头蚤，还不会引起鱼停食，也是治疗暴发病的主要药物，和敌百虫、硫酸铜搭配治疗草鱼出血病效果明显。
缺点：辛硫磷不能与氯制剂合用，易引起死鱼现象，与强氯精、漂白粉合用的毒性强一些，与二氧化氯合用毒性轻一些，杀虫效果没有敌百虫、甲苯咪唑好；大剂量使用后，鱼体易变黄。
禁忌：对淡水白鲳、鲷毒性大，不得用于大口鲶、黄颡鱼等无鳞鱼，无鳞鱼参照第七条。
除生物菊酯外，其余种类不得用于甲壳类水生动物（南美白对虾、河蟹、小龙虾等）。
12、碘制剂、季铵盐制剂（消毒杀菌剂）：
对冷水鱼类（如大菱鲆、虹鳟、鲟鱼）有伤害，并可能致死。
按照鱼类对于生活环境，尤其是水温的要求，高于20度水温就不能存活，所以叫冷水性鱼类。
13、一水硫酸锌（杀纤毛虫）：
用于海水贝类时应小心，有可能致死，特别注意使用后缺氧。常见海水贝类有：鲍鱼、牡蛎、扇贝、文蛤、珠母贝、缢蛏{yìchēng}。
14、代森铵和代森锰锌（杀车轮虫等原生动物）：
不可用于鳜鱼。代森铵用后易导致缺氧，使用后应注意增氧。
15、维生素c（补充维生素，增强抗应激能力，促进机体恢复）：
不能和重金属盐、氧化性物质同时使用。
16、硫酸铜主要成分是五水硫酸铜（杀虫杀藻）
不能和生石灰同时使用。温度升高毒性增大,水温16~30℃范围内,温度每升高10℃,硫酸铜对白鲢的毒性增加1.7~1.8倍，当水温高于30℃时，硫酸铜的毒性增加，硫酸铜的使用剂量不得超过300克／亩·米，否则可能会造成鱼类中毒泛塘。烂鳃病、鳃霉病不能使用，以免伤鳃。鳜禁用。
缺点：硫酸铜对鱼的鳃组织具有很大的刺激作用。使用硫酸铜后有两个副作用：一是硫酸铜伤鳃，使用硫酸铜后鳃组织黏液增多。二是硫酸铜使用后易引起缺氧，使用硫酸铜之后3天内(特别是第二天)，池塘水体极度缺氧。原因是鰓组织的黏液和死亡的藻类影响了鱼体的呼吸。
17、硫酸铜、硫酸亚铁(5:2)合剂贝类禁用，用药后注意增氧，瘦水塘、鱼苗塘适当减少用量；30日龄内的虾苗禁用。鲂鱼、鲟鱼、黑鱼（乌鳢）、宝石鲈（又名宝石鱼、宝石斑）慎用。使用计量为百万分之零点七，0.7PPM，全池泼洒，水深1米，每亩用133.4克，每亩用硫酸铜333.5克。
18、硫酸乙酰苯胺（杀虫剂）：
注意增氧，珍珠、蚌类等软体动物禁用；放苗前请试水；鱼苗及虾蟹苗慎用。
19、大黄流浸膏（中成药名，主要成分为大黄）：
易燃物品，使用后注意增氧。
20、敌百虫主要成分是有机磷杀虫剂（杀虫）：
优点：敌百虫对治疗三代虫、指环虫等大型鲤鱼寄生虫具有很好的效果。敌百虫与硫酸铜、辛硫磷搭配治疗草鱼出血病效果明显。
缺点：敌百虫具有很强的麻痹作用，易造成鱼停食，无鳞鱼禁用。
禁忌：虾蟹、淡水白鲳、鳜鱼禁用；加州鲈、乌鳢、鲶鱼、大口鲶、斑点叉尾鮰、鳜鱼、虹鳟、海水章鱼、胡子鲶、宝石鲈慎用。
21、高锰酸钾（消毒杀菌，不建议杀虫）：
高锰酸钾的杀菌效力与水中有机物含量及水温有关：在有机物含量高时，本品易分解失效，此时可适当调整其用量。水温高时，高锰酸钾的氧化作用增强。以高锰酸钾作消毒剂时，其用量要根据水质和水温条件而灵活掌握，浓度掌握不好容易烧鳃。
斑点叉尾鮰、大口鲶慎用。
22、阳离子表面活性消毒剂（苯扎溴铵，杀菌）：
若用于软体水生动物，轻者会影响生长，重者会造成死亡。海参不得食用。
笨扎溴铵学名为二硫代氨基甲酸铵，别名新洁尔灭，属季铵盐阳离子表面活性剂。优点是调节水质，具有诱食的作用。缺点是治疗车轮虫的效果不明显。与水质解毒剂混合使用，对草鱼的刺激性大，容易造成全池浮鱼甚至死鱼的现象。
23、盐酸氯苯胍（内服杀虫）：
若做药饵搅拌不均匀，会造成鱼类中毒死亡，特别是鲫鱼。
24、阿维菌素、伊维菌素（杀虫）：
按正常用药量或稍微加量或稀释倍数较低时使用，或泼洒不均匀，会造成鲢和鲫鱼的死亡。海水贝类在泼洒不均匀时，易导致死亡。内服时，无鳞鱼或乌鳢会出现强烈的毒性。阿维力素、伊维菌素：内服时，无鳞鱼或乌鳢会出现强烈的毒性。
25、季铵盐碘（杀菌消毒）：
瘦水塘慎用。
26、杀藻药物（漂白粉，高锰酸钾，硫酸铜）：
所有能杀藻的药物在池塘水体缺氧状态下均不能使用，否则会加速出现泛塘现象。
27、外用消毒、杀虫药：
早春，特别是北方，鱼体质较差，按正常用量用药，会发生鱼类死亡，特别是鲤鱼，死亡概率5－10％，且一旦造成死亡，损失极大。
28、内服杀虫药（盐酸氯苯胍、地克珠利、阿苯达唑、吡喹酮）：
早春，如按体重计算药品用量，会造成吃食性鱼类的死亡，概率10－20％。
29、水质因素：
(一)甲壳类
甲壳类应慎用或不用敌百虫、硫酸铜等杀虫类药物。杀菌消炎类药物也应注意尽量使用安全用量的下限值，避免药物刺激引起应激反应。
(1)河蟹河蟹对晶体敌百虫、硫酸铜较为敏感，一定要慎用，全池泼洒时敌百虫含量控制在0.3mg/L以下，硫酸铜含量控制在0.7mg/L以下较为安全。
(2)青虾青虾对杀灭菊酯、敌百虫晶体、硫酸铜等较为敏感，应禁用或慎用，特别对敌杀死十分敏感，应禁止使用。全池泼洒时，控制敌百虫含量在0.013mg/L以下，硫酸铜含量在0.3mg/L以下较为安全。
(3)罗氏沼虾对敌百虫特别敏感，应严禁使用。药物使用控制量为：漂白粉在1mg/L以下，硫酸铜在0.3mg/L以下，生石灰在25mg/L以下。
(4)鱼、虾、蟹混养鱼、虾、蟹混养时晶体敌百虫、硫酸铜应禁用或慎用。全池泼洒常用药物含量控制在生石灰10~15mg/L，优氯净0.3~0.6mg/L,土霉素0.1mg/L,硫酸锌0.5~1.0mg/L，福尔马林10~25mg/L。
(二)无鳞鱼类
无鳞鱼指体表不具鳞片的鱼类，如鲶鱼、革胡子鲶、斑点叉尾鮰、黄颡、黄鳝等，用药时应注意避免刺激性强的药物。同时该类鱼对有机磷农药最敏感，故应慎用或禁用晶体敌百虫、敌敌畏等杀虫类药物。
另外，在鱼体浸泡消毒时，禁用食盐，以免鱼体脱黏引起死亡。泥鳅鳞片很小，虽然属鲤科，但用药禁忌同无鳞鱼类。
(三)特种水产养殖品种
(1)鳜鱼(桂鱼)：对晶体敌百虫、氯化铜等药物较敏感。其中对敌百虫十分敏感，敌百虫的浓度在0.2克/立方米以上，就会造成鳜鱼不同程度的死亡，按常规用药，往往会导致全池死鱼，氯化铜浓度在0.7克/立方米以上，就可导致中毒死亡。因此，在鳜鱼池中不能使用这些药物。
(2)虹鳟：对晶体敌百虫、高锰酸钾较为敏感，特别是虹鳟幼鱼。在水温11.5~13.5°C时，敌百虫对虹鳟的安全浓度为0.049克/立方米。
(3)加州鲈：对晶体敌百虫较为敏感，一定要慎用。在用晶体故百虫全池泼洒防治鱼病时，根据试验，浓度控制在0.3克/立方米以下较为安全。
(4)乌鱧(乌鱼)：对硫酸亚铁敏感，因此在乌鳢的人工养殖中防治鱼病时应慎用或不用。
(5)淡水白鲳：对有机磷农药最敏感，故应绝对禁止使用晶体敌百虫、敌敌畏等药物。