使用渔药时，应根据鱼体发病的原因及发病部位来确定科学的治疗方法。首先要了解池塘的养殖条件、水质水色情况、饲料投养等情况，科学掌握预防发病的外因。接着再对病鱼进行目检，得出初步结论，最好通过对鱼体解剖和镜检，结合病鱼的发病症状，才能对正确作出诊断，才能科学确定治疗方法。
2、药物禁忌。
不同养殖品种发生的同一种鱼病，要使用不同的药物。比如在使用敌百虫治疗鲢鳙小瓜虫病时，养殖鳜鱼、淡水白鲳、虾、蟹的就不能使用敌百虫。乌鳢对硫酸亚铁十分敏感，防治乌鳢病害时要慎用或不用硫酸亚铁。
3、面积水体测算。
科学测量发病鱼池面积和水深，计算出总用药量。有些养殖户不进行科学的测量，就去买药用药，结果造成一些不必要的浪费甚至发生药害事故。
4、水温。
5、药物混用。
两种药物混合使用时，应先分别溶化后再混合。使用漂白粉、敌百虫等粉剂药物时，应先用少量水调成浆糊状，再加水稀释。
6、用药方法。
根据鱼病特点和药物特性，一般可选择全池泼洒、拌饵内服、挂袋、药浴等方法使用鱼药，使用时应注意以下几点：
泼洒：容器中先放水后放药，药物要充分溶解，有药渣时要用６０目纱布过滤，避免鱼误食中毒。
内服：将药物均匀地拌入饲料中或制成颗粒料投喂，制成的药饵在水中的稳定性要好。内服药饵前应停食１-２顿，让鱼处于饥饿状态。投喂药饵时，药饵要撒均匀；量要适中，保证鱼能吃到足量的药饵。
挂袋：将鱼药装在药篓等有微孔的容器中，悬挂于食场周围，利用药物较慢的溶解速度，形成药物区，从而达到消毒、杀虫等目的。
7、喂食用药的先与后。
用药前应先投饵，后泼药，不可同时进行，禁止边洒药边喂食。
8、水位。
当水浅或水瘦时，水浅比深水的缓冲能力弱一些，可适当减少药量，特别是硫酸铜，瘦水池应特别注意减少用药量。
10、用药方向。
全池泼洒药物时，应从上风处或顺风方向开始逐渐向下风泼，使药液快速均匀分布在池中。开动增氧机更好，更加促进药液在水体中的均匀分散，以提高药效。
11、用药气候。
用药时应密切注意池鱼有无浮头现象，浮头时除增氧剂外禁用药物，鱼病严重须急救又遇阴雨连绵天气，不可能等个八天十天等天晴了再用药，可能这时候病鱼也死得差不多了。此时可以在用药后开动增氧机增氧即可，并非阴雨天气都不可用药。
12、施药器物。
全池泼洒药物，一定要均匀。可用喷雾器或机动撒药机，也可用瓢或勺子全池塘均匀泼洒，大塘可用船划至池塘各处用药。
特殊药物要用特别的盛药器具。使用硫酸铜、硫酸亚铁、高锰酸钾等药物时，都应放在木桶或胶桶或木盆中用50℃左右的水液溶化，以防发生不利反应。
13、不使用过期渔药和加量使用药物。
不使用过期渔药，也不可过度加倍使用药物。很多养殖户在购买鱼药时，不看有效期买的是过期药，不能有效治疗鱼病。有的则将过期药加倍使用，往往造成池鱼中毒死亡，造成不必要的损失。
有的药物可以适当加倍使用，一般不超过标准用量的20-30%，但有的药物则不能加量使用，往往造成池鱼中毒死亡，造成不必要的损失。主要看药物的使用说明书上有无特殊禁忌说明。
14、现配现用。
坚持各种药物现配现用原则，以免药物效力大打折扣。
15、水质影响。
在鱼病防治中，常用渔药与水质关系影响较大。
比如：
漂白粉和强氯精在碱性水体和肥水水体杀菌效果较差，所以其药效在酸性水体下作用较强。
溴氯海因不受水体肥瘦、pH值等因素影响。
苯扎溴铵在酸性水体中使用效果较好。
戊二醛在PH值7.5～8.6碱性水质中使用效果较好。
伊维菌素、阿维菌素在PH值偏碱性水体时使用效果更好。阿维菌素性质不稳定，对光线特别敏感，对鱼类毒性更大些。
溴氰菊酯在水体偏酸性杀虫效果较好。菊酯类药物在肥水下需加大用药量。
硫酸铜在水温16～30℃条件下，水温每升高10℃，其毒性提高2倍，水温60℃以上溶解可使其失效。
马拉硫磷在水温低时就可使用，而菊酯类渔药一般水温在25℃以下慎用或者禁用。