这是由于孢子在鱼体内形成的孢囊坚韧的外壳，药物很难进入，特别是在这个阶段往往是用药越多，药量越大，鱼的死亡越严重，损失越惨重。因此，建议养殖户提前做好预防措施。
一、孢子虫的分类
二、孢子虫爆发的原因
1、苗种本身带有孢子虫；
2、池塘清塘不彻底，水质、底质较差；
3、养殖过程中没有注意鱼体保肝护胆、增强体质；
4、没有提前预防孢子虫，使用便宜药或用药不到位；
5、发病后病急乱投医，诊断错误导致乱用药。
三、孢子虫的危害
目前危害较大的是对鲫鱼、裸鲤夏花鱼种等，初期表现为鳃上小的有孢子囊球，体表有一个个结节状的突起，后期发展成咽喉部位较大的孢子囊球。这时治疗难度加大，伴随肠炎、出血、烂鳃等并发症，容易造成大量的损失。
外表病征不太严重的病鱼，往往作波浪式旋转活动，表现出极度疲乏无力的样子。严重的病鱼，在水中离群独自急游打转，经常跳出水面，又钻入水中，如此反复多次，最终死亡。
│咽喉部孢子虫，俗称“喉癌”、“肿嗓子眼”│
│鲫鱼孢子虫鳃体表│
│框镜孢子虫鳃肠道│
│孢子虫肠道│
四、预防措施
1、定期改底增强水质，改善水体环境，破坏孢子虫的生存环境。可用过硫酸氢钾复合盐为主的安蓝、抑菌底安产品定期改底，阴雨天也能使用。
3、增强鱼体自身的抵抗力，100KG料用200G黄芪多糖免疫草，4月开始定期用，每10天用一次，每次连用两天。体质强更不易发病。
五、防治方法
对于成鱼来说，一旦爆发孢子虫，是很难治疗的。孢子虫病需要及早发现处理，在没有形成成熟的孢子和包囊之前，才能有一定的疗效。
建议方案1：克孢灵1包（地克珠利预混剂）+纤灭1包+虫虫草1包，拌料10公斤，连续使用3-5天。
建议方案2：三宝蛋氨酸碘1瓶盖+纤灭1包拌料5-10公斤，连续使用3天。
同时外用三宝蛋氨酸碘和纤灭，混合兑水全池泼洒，以增加药物的渗透，同时碘也具有杀菌，防止细菌继发感染的作用。三宝蛋氨酸碘的用量为每瓶2-4亩。