近些年来，随着鱼类规模化养殖的不断发展，病虫害发生量增大，由于有些养殖户对病害防治方法认识不够，造成鱼类病死率增高，因此，正确掌握鱼药的使用方法，刻不容缓。
1泼洒法
泼洒法，就是根据鱼类实际病发生情况，对症选择防治药品，然后配制用药浓度，再用水稀释数倍后，全池均匀泼洒，即可有效灭杀池塘内各种病虫，减少鱼类死亡率和经济损失。特别是池塘寄生虫较多时，采用泼洒方法，防治虫害效果非常好。注意的是，泼洒药液时，最好在晴朗天气进行，尽量同时开动增氧机，以搅混药和水的相互溶合。遇有急病时，又恰遇阴雨绵绵数日，如果不用药鱼病会暴发，不得不用药以救急时，仍然可以用药，只不过必须开机增氧。
2挂袋法
3药浴法
药浴法，就是我们所说的浸泡，也可以理解成给鱼洗澡。就是鱼类在放养之前，先把鱼类放在配制好的消毒药液中浸浴5～10分钟，比如食盐溶液3%～5%、高锰酸钾15～20g/m3等，灭杀鱼类体外带来的各种病菌和寄生虫，然后再进行放养。使用药浴法，能有效减少用药量，节约养鱼成本。注意的是，药浴鱼类时，药桶内最好接入微孔增氧气管，边增氧并观察鱼类活动情况，若有跳跃或焦躁不安现象时，应及时停止药浴，并将鱼类与药液一起倒入养殖池塘内，否则，会出现药害，造成鱼类死亡和经济损失。
4涂抹法
涂抹法，就是用较高浓度的药液或药膏，涂抹在鱼类患病处，达到消灭病原体目的。使用涂抹法，能有效减少用药数量，并且安全可靠，池塘水体也不会被污染。这种方法，目前广泛用于鱼类亲鱼繁殖时的产卵后用药；最适用于珍贵鱼类和个体较大的鳖、龟等的患病处理，鱼类伤口抹药的效果最好。注意的是，涂抹药品时，要把鱼类头部朝上，不能让药液进入鱼类眼睛、鳃内、口内，否则，会造成鱼类死亡。
5口服法
口服法，就是我们所说的药饵。就是先按饲料重量折算成用药量，然后用水把药物溶化后，拌入饲料中进行投喂，当鱼类吃了这些拌药的饲料后，体内的病原体就会彻底消灭，鱼类机体很快会增强。使用口服法，目前常用在鱼类病害的预防和治疗中，见效速度快，并且用药数量少。在鱼类病虫害预防时，常用中草药有黄连、板蓝根、大蒜、黄柏、大黄、乌桕、穿心莲、五倍子、维生素、微生物制剂、免疫多糖、矿物质等，效果很好；常用化学制剂有土霉素、庆大霉素、利福平、磺胺类、甲醛溶液、硫酸锌、苯扎溴、氯胺T、精制敌百虫粉、磺胺二甲嘧啶、盐酸左旋咪唑溶液、精制马拉硫磷溶液、溴氰菊酯等，效果也很好。
口服药饵的具体操作方法：先把药品用清水溶解，然后倒入膨化饲料中，搅拌均匀，等饲料吸收药液后，用投饵机或人工投入池塘内即可。草料拌药饵的方法大致相同。注意的是，粉状饲料和硬颗粒饲料中，不能拌药液，否则，药液流失较多，使用效果差，尽量用膨化饲料就是这个道理。另外，口服法对发病严重的鱼则用不上药饵内服，因为病鱼大多不吃食了，滤食性鱼类因为只能滤食无法吃食，口服法也无效。
6注射法
注射法，就是通过注射针头把药液或者疫苗，注入鱼类身体内，达到预防或防治各种病虫目的。注射法，用药精准，吸收速度快，病虫预防或防治效果很好，特别是在保护名贵鱼类和繁殖亲鱼时，使用注射法，效果特别显著。具体操作方法：先将注射器吸入药液或疫苗，然后把针头朝上，排出针具内的空气，再注入鱼类腹部或肌肉部位即可。注意的是，注射针头要避开鱼类心脏部位，否则，会造成鱼类死亡。