临床上主要是对症治疗配合高免血清和单克隆抗体治疗(针对早期病情较为轻，单克隆抗体效果高于高免血清)。成犬治愈率高于幼犬，串种犬治愈率高于血统犬(血统犬大多为近亲交配所得，免疫力低下)，幼犬预后谨慎。
在病发后严格控制饮食，禁食禁水，通过输液等方式防止脱水。由于此时病犬肠胃功能紊乱，功能停止，喂食只能增加负担，导致病情严重，口服葡萄糖和氯化钠等方式无任何治疗意义，切勿强灌。病犬在四十八小时内不再呕吐腹泻，可试探性喂食易消化食物，比如泡软狗粮，小米汤。
止血常维生素K3、安络血或止血敏;一般4~6小时一次，可同时或单独应用。止吐常用爱茂尔、胃复安等。止泻可用泻痢停、药用碳、腐敏、维迪康等。控制继发感染可用抗菌类药物，如青霉素、庆大霉素、氨苄青霉素、丁胺卡那霉素、硫酸小诺霉素、四环素和红霉素等。强心主要用强尔心、樟脑磺酸钠或安钠咖等。
宠物医院临床上常用的处方为生理盐水或5%~10%葡萄糖溶液20~50毫升/千克体重，氨苄青霉素5~10毫升/千克体重，强尔心0.5~2.0毫升/次，维生素C100毫升/千克体重，维生素K35~10毫升/千克体重，地塞米松2~5毫克/次，混合一次静脉注射，每天1~2次，同时静脉注射5%碳酸氢钠注射液50毫升/千克体重，1~2次/天，爱茂尔1~4毫升，3~6次/天肌肉注射，维迪康0.2毫克/千克体重口服或灌肠，有较好的疗效。
有饮欲的可给予足量的口服补液盐溶液，自由饮用，没有饮欲的可进行灌服，口服补液盐溶液的配方为:氯化钠3.5克，碳酸氢钠2.5克，氯化钾1.5克，葡萄糖20克，水1000毫升。为了补充营养，可静脉注射25%~50%葡萄糖溶液、氨基酸或代血浆和白蛋白等。可大剂量应用地塞米松和山莨菪碱(654-2)溶液进行静脉或肌肉注射。
为尽快排出肠道内容物，可进行灌肠。一般用0.05%~0.1%高锰酸钾溶液进行灌肠，或者先用口服补液盐溶液进行灌肠，最后再用口服液盐溶液加抗菌药或抗病毒药进行保留灌肠，也可用生理盐水、复方生理盐水、乳酸林格尔氏液灌肠。
目前市场上有犬细小病毒病高免血清，可以试用。据资料报道，早期使用，并配合对症治疗，有较好的疗效。但在其后期使用，意义不大。在治疗时，也可试用犬用干扰素、犬用病毒灵(主要成分为干扰素、免疫球蛋白等)、呕泻宁、犬病一针灵、犬病康等。
补液量根据患病犬只的体重,脱水由轻微到严重一般按每公斤体重50-80毫升不等进行输液。下面以体重10公斤的病犬为例,详细介绍犬细小病毒的用药情况:
注:(以下药物为成组搭配，而非一次性将其全部混合)剂量以病犬10千克体重为标准，ml为毫升。
R:
乳酸钠林格氏液150ml50%葡萄糖20ml维生素C2ml维生素B61ml肌苷2ml氯化钾2ml为一组静脉注射;
0.9%生理盐水100ml硫酸庆大霉素50000单位为一组静脉注射;
5%葡萄糖氯化钠100ml654-2(消旋山莨菪碱)0.5ml雷尼替丁0.5ml止血敏2ml为一组静脉注射,无论出血与否都加止血敏提前止血;
出血严重者:0.9%生理盐水100ml人用止血药立芷血1支为一组静脉注射;
5%葡萄糖氯化钠100ml注射用碳酸氢钠8ml为一组静脉注射;
0.9%氯化钠100ml血浆25ml为一组静脉注射.
另:犬细小病毒止吐不能用胃复安,因为可以加重肠道出血,可用溴米那普鲁卡因注射液或中药注射用止吐灵;出血还可肌注维生素K1。