间充质干细胞（MSCs）最先在骨髓中被发现，广泛分布于人体，如骨髓、脐带、脂肪、脐带血、羊膜、（胎盘）绒毛膜、牙髓、胸腺、滑膜、胎儿血和肝脏等。
一、不同组织MSCs含量有差异
根据成纤维细胞克隆形成单位（CFU-F）实验，骨髓MSCs的含量大概占单个核细胞（MNC）的0.001%~0.01%；胎盘羊膜和脐带MSCs占约MNC的0.2%~1.8%。另有研究显示从羊膜和脐带分离到的MNC中，MSCs的含量高达80%~100%；但从脐带血中分离的MNC中只有8%是MSCs。
脐带血中的MSCs数量少，从脐带血中分离并能培养成功的概率只有5.7%~10%，有研究小组分离118份脐带血的MNC，只有11份能培养出MSCs；甚至有研究提示这些数量是检测不到的，无法进行体外扩增。
二、不同组织MSCs增殖能力有差异
三、不同组织MSCs免疫调节功能有差异
MSCs（P2代）和CD3+T细胞1：1共培养实验中，和对照组（没有MSCs组）相比，骨髓MSCs和脐带血MSCs抑制CD3+T细胞增殖效果明显，分别为48.2%和42.9%，而胎盘MSCs只是轻微抑制CD3+T细胞增殖（77.0%）。
四、不同组织MSCs分泌因子谱有差异
在基因水平，脂肪MSCs表达BDNF的量高于骨髓MSCs，但骨髓MSCs表达更高的NGF。商品化的骨髓MSCs和脂肪MSCs有相似的增殖能力和趋化能力，但是实验室培养的不同个体脂肪MSCs的增殖能力和趋化能力却出现明显差异。
五、总结
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