畜禽养殖场常用碱性消毒剂、烧碱、生石灰。氢氧化钠，也称为NaOH。氢氧化钠具有强腐蚀性，不能用于畜禽体表、车辆、铝制器具的消毒。主要用于疫点表面、畜舍、木质器皿等的消毒。用量:2%~4%溶液。石灰遇水产生大量热能和强碱，主要用于猪舍墙壁、畜栏、地面、养殖场大门的消毒。生石灰易产生粉尘，不宜直接铺在屋内地板或垫料上，也不能直接撒在畜舍内消毒，否则会对口腔和消化道造成灼伤。猪圈墙壁、畜栏、地面、养殖场大门消毒剂量为:配制10%~20%石灰水；制成浸泡在20%石灰乳中的草包或麻袋。注意定期更换新石灰水，干石灰和放置已久的熟石灰消毒效果差，甚至没有杀菌消毒效果。
2、季铵盐类
季铵盐消毒剂包括单链季铵盐和双链季铵盐。市面上常见的单链季铵盐有苯扎溴铵溶液(如新洁尔灭)、十二烷基二甲基苯氧基溴化铵(如度米芬)、十四烷基二甲基吡啶溴化铵(如消毒剂)；双链季铵盐有双十二烷基二甲基氯化铵(如四甲基苯酚盐)。
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