致病菌是常见的致病性微生物，能够引起人或动物疾病。食品中的致病菌主要有沙门氏菌、副溶血性弧菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌等。据统计，我国每年由食品中致病菌引起的食源性疾病报告病例数约占全部报告的40%至50%。
为控制食品中致病菌污染，预防微生物性食源性疾病发生，同时整合分散在不同食品标准中的致病菌限量规定，国家卫生计生委委托国家食品安全风险评估中心牵头起草《食品中致病菌限量》（GB29921-2013，以下简称GB29921）。标准经食品安全国家标准审评委员会审查通过，于2013年12月26日发布，自2014年7月1日正式实施。
新版变化
1.修改标准名称
2021版标准由《食品安全国家标准食品中致病菌限量》修改为《食品安全国家标准预包装食品中致病菌限量》
2.修改适用范围
3.应用原则
4.指标要求
增加了乳及乳制品、特殊膳食用食品的致病菌限量要求，食品类别由11类增加到13类。
删除2013版肉制品类别下的熟肉制品和即食生肉制品
删除大肠埃希氏菌O157:H7要求
增加致泻大肠埃希氏菌要求，并在备注中限定仅用于牛肉制品，即食生肉制品、发酵肉制品。
金黄色葡萄球菌检验方法由GB4789.10第二法改为GB4789.10，不再限定金黄色葡萄球菌检验方法为第二法。
01删除2013版水产制品类别下熟制水产品、即食生制水产品、即食藻类制品
02增加单核细胞增生李斯特氏菌要求
03删除金黄色葡萄球菌要求
无变化
01删除粮食制品类别下熟制粮食制品（含焙烤类）、熟制带馅（料）面米制品、方便面米制品
02金黄色葡萄球菌检验方法由GB4789.10第二法改为GB4789.10，不再限定金黄色葡萄球菌检验方法为第二法。
01删除即食豆制品类别下发酵豆制品、非发酵豆制品
02金黄色葡萄球菌检验方法由GB4789.10第二法改为GB4789.10，不再限定金黄色葡萄球菌检验方法为第二法。同时m和M单位由CFU/g改为CFU/g（mL）
01删除大肠埃希氏菌O157:H7要求
02增加致泻大肠埃希氏菌要求，并在备注中限定仅用于牛肉制品，即食生肉制品、发酵肉制品。
03金黄色葡萄球菌检验方法由GB4789.10第二法改为GB4789.10，不再限定金黄色葡萄球菌检验方法为第二法。
04增加单核细胞增生李斯特氏菌要求
05单核细胞增生李斯特氏菌和致泻大肠埃希氏菌要求仅适用于去皮或预切得水果、去皮或预切的蔬菜及上述类别混合食品。
01删除饮料食品类别下（包装饮用水、碳酸饮料除外）
02删除金黄色葡萄球菌要求
01删除冷冻饮品类别下冰淇淋类、雪糕（泥）类、食用冰、冰棍类
01删除即食调味品类别下酱油、酱及酱制品、水产调味品、复合调味料（沙拉酱等）
01食品类别由坚果籽实制品修改为坚果与籽类食品，同时删除坚果及籽类的泥（酱），腌制果仁类
01增加解释表中“m=0/25g或25mL或100g”代表“不得检出每25g或每25mL或每100g”。