注意:血清型和生物型不是一个概念哈,所以I,II型并不对应FECV和FIPV。
中国流调:临床健康猫和疑似FIP猫中猫冠状病毒I型和II型的流行情况和遗传多样性
猫传染性腹膜炎(FIP)是野猫和家猫的一种致死性传染病,FIP的发生在我国屡见报道。为追踪我国Ⅰ、Ⅱ型猫冠状病毒的演变过程,从我国兽医院采集FIP疑似猫腹水115份,临床健康猫粪便54份。
以6b基因为靶点的RT‐PCR检测样本中是否存在FCoV。结果发现,共有126份(74.6%,126/169)样本FCoV阳性:75.7%(87/115)的FIP‐疑似样本FCoV阳性,72.2%(39/54)的临床健康样本FCoV阳性。在126份FCoV阳性样本中,95个部分S基因测序成功。部分基于S基因的基因分型表明,Ⅰ型FCoV和Ⅱ型FCoV分别占95.8%(91/95)和4.2%(4/95)。
基于部分S基因的系统发育分析显示,91株I型FCoV毒株表现出遗传多样性;4株II型FCoV毒株与来自台湾的II型FCoV毒株表现出密切关系。3株I型FCoV毒株HLJ/HRB/2016/10、HLJ/HRB/2016/11和HLJ/HRB/2016/13在几乎完整的基于基因组的系统发育树中形成了一个潜在的新分支。
在中国鉴定的3株I型FCoV毒株BJ/2017/27、BJ/2018/22和XM/2018/04的S基因表现出6个核苷酸缺失(C4035AGCTC4040)。
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