方案的综合分析，就是将每个方案在技术、经济上的各种指标、优缺点全面列出，以作为方案评价和选择时的分析依据。方案的综合分析一般包括以下内容：
1）列出和分析每个方案的计算经济影响指标。任何一个技术方案，它的投资效果系数和投资利润都应高于国家或部门规定的标准数据。若项目的投资是在有偿使用的条件下，投资效果系数和投资利润率一定要高于银行贷款的利率，否则，在项目建成后，连利息都付不起，这样的项目是不能投资和建设的。
2）列出各方案总投资、单位投资和产品投资率，分析投资构成和投资水平的原因，提出减少投资的方向和具体措施。在分析投资时，特别要注意结合项目技术特点，严格分清项目建设及逐年所需的投资额，避免投资积压，尽量提高投资的使用效果。
3）列出并分析各方案的生产成本、分析成本的组成及影响因素，提出了降低成本的原则和主要途径。
4）列出并分析每一方案实施后产品的数量和质量，指出这些产品对发展食品工业、提高人民生活水平和发展农业，特别是出口产品的意义，体现国际竞争力。
5）分析了各项目投入生产后的劳动生产率，与同类企业相比，国内、国际水平高、低，如何提高生产效率等。
6）分析各方案采用了哪些先进技术，其水平和成熟度如何，这些先进技术对提高产品质量和劳动生产率有何影响，经济效益如何。
7）列出并分析各方案在消耗重要物资和拥有农业用地方面的情况，并说明采取了哪些措施。
8）分析每个方案的建设周期，提出保证工程质量、缩短工期的措施。
9）分析项目的“三废”处理情况。
2、食品工厂设计方案选择的原则
正确、合理地选择规划，将为地区和企业的经济繁荣打下坚实的基础，而方案的选择是十分困难和复杂的。通常在选择时，彼此面对的各种方案常常是矛盾的。为了做出正确的决策，我们应该根据项目的特点和以下原则选择最佳方案。
1）食品工厂建设计划的选择，有充足的原材料和市场需求，将考虑经济效益。
2）方案的选择要符合国情和地区实际情况，例如根据我国能源紧张和劳动力比较富裕的国情特点，在选择进口先进设备时就要具体分析，切勿盲目引进，给国家、地方或企业造成不必要的经济损失。
3）方案的选择要与方案的实施相结合，选择的方案虽经济效果最好，如实施有困难，则仍是纸上谈兵。在方案选择时，不可忽视方案实施的可能性。
4）在选择方案时，要听取不同意见，尽量避免片面性，使方案选择更加合理。这样，当食品工厂投产后，就可获得较好的经济效益和社会效益。