①原料清洗工段大量砂土杂物、叶，皮、鳞、肉、羽、毛等进入废水中，使废水中含大量悬浮物。
②生产工段原料中很多成分在加工过程中不能全部利用，未利用部分进入废水，使废水含大量有机物。
③成形工段为增加食品色、香、味，延长保存期，使用了各种食品添加剂，一部分流失进入废水，使废水化学成分复杂。
①废水量大小不一，食品工业从家庭作业的小规模到各种大型工厂，产品品种繁多，其原料、工艺、规模等差别很大，废水量从数m3/d到数千m3/d不等。对废水量不大的小型作坊，因维护管理方面存在实际困难，希望采用便于维护管理的废水处理设施。
②生产随季节变化，废水水质水量也随季节变化。例如，农产品和水产品的加工，因季节关系，由于原料输入的状况变化很大，在某个时期有加工集中情况。豆腐制作和饮食行业，由于在一天内只有数小时工作，废水在这个吋期也较集中。
④废水中含各种微生物，包括致病微生物，废水易腐败发臭。
⑤高浓度废水多，近年来，从节约水资源和降低成本的观点出发，推行水利用合理化，在有机物质不变而水量减少，和增加有机物质而水量不增加的情况下，这些都导致废水浓度增高。一般来说，食品工业废水，以较髙浓度者为多、其BOD值在500毫克/升以上的情況很多，其中有浓度高达数万毫克/升的，亦并不罕见。
⑥废水中氮、磷含量高的情况多。在肉类、豆类和动物胶加工时，从蛋白质中产生氮，在水产品加工时，在鱼糕等稍制品制作，火腿和腊肠的制作时，都使废水中的氮和磷增高。
目前国内外，食品废水处理滴滤池法，活性污泥法，氧化塘法等处理食品废水的方法。
①滴滤池法:滴滤池法是使废水从碎石塑料等铺成的滤池流下而与过滤材料表面上的薄层生物膜相接触的方法。优点是具有结构简单、占地面积小、维护费用低、对水质水量变化适应性强等缺点是处理深度不如活性污泥法，尚有部分剩余有机物，需进一步处理。
②活性污泥法:活性污泥法也称生化曝气法，是需氧处理中最主要的一种方法。活性污泥是一种絮状污泥，能吸附和凝聚污水中有机物质和其它物质，通过构成活性污泥中的好气性微生物来时进行有机物的氧化和分解。
a、活性污泥中的微生物是由多种微生物构成的群体，其中以细菌为主，其次是霉菌和酵母菌，此外还有原生动物和无脊椎动物。
c、活性污泥法处理系统主要由一次沉淀池、曝气池、曝气设备、污泥回流设备、二次沉淀池等组成。
③氧化塘法:利用水中自然存在的微生物和藻类，对废水进行好氧和厌氧生物处理的天然或人工池塘。