我国对食品出口生产企业实施备案管理制度。根据《中华人民共和国食品安全法》第九十九条，出口食品生产企业应当保证其出口食品符合进口国（地区）的标准或者合同要求。出口食品生产企业和出口食品原料种植、养殖场应当向国家出入境检验检疫部门备案。根据海关总署第249号令，出口食品生产企业应当向住所地海关备案。
申请人通过互联网+海关或者单一窗口的子系统，“中国出口食品生产企业备案管理系统”，向企业所在地海关申请备案，填写企业基本信息、企业获证情况以及企业承诺书。
在网上申请后，还应该向海关提交如下材料：
1.出口食品生产企业备案申请表
2.配料成分
3.合格的供应商名录
4.工艺流程图
5.质量控制流程管理文件
6.产品正标背标图片
7.国外客户所在国家的食品市场准入要求
8.海关要求的其它材料临时补充
主管海关对申请人提交的备案材料进行审核，如果需要下场核验，要求技术人员陪同，对材料齐全并符合法定条件的，予以备案，备案成功后系统将生成电子版《出口食品生产企业备案证明》。
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