1、食品小经营店备案证是各地针对“三小”（即食品小作坊、小经营店和小摊点)分布广、规模小、数量多，在方便百姓生活的也存在一定的安全隐患情况下，加强实施管理备案证。
2、食品经营许可证也可称餐饮服务许可证，是单位和个人从事食品生产经营活动，经卫生行政部门审查批准后，发给的餐饮服务许可证。
食品小经营店备案证和食品经营许可证有许多不同：
1、针对对象不同。
食品小经营店备案证是各地针对“三小”即食品小作坊、小经营店和小摊点；食品经营许可证针对所有食品行业领域生产经营活动。
2、适用法律法规不同。
食品小经营店备案证只适用各地方制定法规，食品经营许可证适用《餐饮服务许可管理办法》，为国家法律法规。
3、扮演身份不同。
小作坊、小经营店和小摊点基本上无固定法定地点，多数为无工商营业执照，食品小经营店备案证扮演“临时身份证”角色；食品经营许可证只是行业经营许可凭证。
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