如何看懂疾病基因检测报告?从基因检测报告中洞悉健康之道

遗传是指亲代表达相应性状的基因通过无性或有性繁殖传递给后代,从而使后代获得其父母遗传信息的现象。简单来说,遗传就好比父母各自提供一本字典(DNA),这两本字典将共同指导孩子日后的样貌、性格、天赋等等。

然而,如果字典出现某种形式的错误,如染色体异常、基因突变等,便有可能导致身体错误地理解相应的内容,并出现生长和工作上的混乱,最终产生各种异常症状,也就是大家熟识的“遗传病”。

遗传病,是指由遗传物质发生改变而引起的或者是由致病基因所控制的疾病,常为先天性的,也可以后天发病。据临床数据估计,约50%的遗传病患者在出生时或儿童时期发病,约30%的遗传病儿童寿命不超过5岁;但也有部分遗传病要经过几年甚至几十年后才出现明显症状。

根据病因不同,遗传病主要分为:

①染色体病

染色体病是由于各种原因引起的染色体数目和(或)结构异常的疾病,如唐氏综合征、爱德华综合征、小儿猫叫综合征等。由于染色体上基因众多,加上基因的多效性,因此这类疾病常涉及多个器官、系统的形态和功能异常。

严重者在胚胎早期死亡并自然流产,少数染色体病患者能存活至出生,但常有机体畸形、智力低下、生长发育迟缓和多系统功能障碍等症状,常表现为综合征,故染色体病是一大类严重的遗传病。

现时染色体病并无有效的治疗方法,因此通过染色体病的遗传咨询和产前诊断预防染色体病尤为重要。

②单基因遗传病

单基因遗传病是由一对等位基因控制而发生的疾病。该病的种类很多,达到9000种以上,但是每一种疾病的患病机率较小且大多属于罕见病,遗传规律遵循孟德尔定律。根据患病家系的系谱分析,单基因病可分为5种,包括常染色体显性遗传病、常染色体隐性遗传病、X连锁显性遗传病、X连锁隐性遗传病、Y连锁遗传病。

③多基因遗传病

多基因遗传病是遗传信息通过两对以上致病基因的累积效应所致的遗传病,因此与单基因遗传病相比,多基因遗传病不是只由遗传因素决定,而是遗传因素与环境因素共同起作用。

多基因遗传病大多属于常染色体隐性遗传且一般有家族性倾向,即如果父母中一方患有多基因遗传病,则子女患病的几率会比较高,比如多发性结肠息肉、先天性聋哑等。

不同的遗传病由于遗传物质的缺陷不同,采用的检测技术也可能不同,医生需要结合实际情况综合考虑及选择。

1.Sanger测序

现时Sanger测序广泛应用于已知单基因遗传病致病基因或热点致病位点的遗传检测。但由于通量有限,常作为致病基因或致病位点明确的单基因遗传病检测手段或NGS结果的验证技术。

2.NGS测序

3.MLPA技术

MLPA技术主要用于目标片段基因拷贝数改变的检测,以及用于单核苷酸多态性分析或者单碱基变异分析,如诊断杜兴肌肉营养不良症、脊髓性肌萎缩症、小儿猫叫综合征、DiGeorge综合征等。

●结果说明:对检测到的基因变异的说明和致病性评级。

●分析意见:实验室针对检测结果给出的初步结论和建议。

●疾病信息:对于检出疾病临床特征的简要描述。

拿到疾病基因检测报告时,该怎么看

Step1先观察报告中最核心的内容,即:

a.基因:哪个基因发生变异。

b.合子类型:有性生殖生物的雌雄胚子结合后形成新的细胞统称为合子。根据两性配子的基因型和基因位置的相同与否,合子可分为:

纯合:即两个等位基因相同位置存在相同变异。

复合杂合:即两个等位基因都发生变异,但变异位置不同。

杂合:即两个等位基因只有一个发生变异。

半合子:属于一种特殊情况,如男性的X染色体是没有等位基因的,当男性X染色体基因发生改变称为半合子变异。

野生型:无基因变异。

c.疾病名称:检测到的基因所对应的临床疾病。

需注意的是,一个基因通常会对应几种疾病,而一种疾病也会关联不同基因

d.致病性:根据《ACMG遗传变异分类标准与指南》,变异可划分为5个等级,分别为致病(Pathogenic)、可能致病(LikelyPathogenic)、意义未明(Uncertain)、可能良性(LikelyBenign)和良性(Benign)。

一般来说,结果为Pathogenic或LikelyPathogenic,代表致病的可能性比较大;而Uncertain,则代表,目前来看致病性证据不足,但是不能排除,需要根据临床进一步核实;而LikelyBenign或Benign的位点一般不会放到报告中。

Step2留意报告中其他重要内容

a.染色体位置:即变异在染色体的位置,如chr19:39214722,即变异位置在第19号染色体的第39214722位碱基。

b.转录本:转录本是由一条基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。由于不痛转录本中对同一个位点的描述(包括核苷酸、氨基酸的位置)是不同的,因此报告中会标注出核苷酸、氨基酸位置对应的是具体哪个转录本,方便变异位点的查找即核对。

c.核苷酸改变/氨基酸改变:根据HGVS规则命名的核苷酸变化/氨基酸变化。核苷酸有A、T、C、G四种且有固定的排列顺序,如果第211号位置发生改变,即原本的A被C取代,便会写作:c.211A>C。此外,相应的氨基酸有20种,也有固定的排列,如果第78号位置丝氨酸(S)被酪氨酸(Y)取代了,可以写作:p.S78Y。

d.频率:指该位点在正常人数据库中的频率,通常携带的频率越高,致病的可能性就越小。

e.遗传方式:常见的是常染色显性遗传(AD)、常染色体隐性遗传(AR)、X连锁显性遗传(XLD)和X连锁隐性遗传(XLR)等。

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THE END
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