我们可以给猫咪注射疫苗来保护它们不受病毒侵害。虽然如此，目前临床上还是没有普遍推广能够预防狂犬病和猫传染性腹膜炎的疫苗。
这两种疫苗全球范围内都有所应用。但在英国，只能为即将出口的动物接种狂犬病疫苗。在英国颁行了检疫隔离法之后，就可以强制性地给猫咪接种疫苗。如今，注射疫苗很好地预防了这些病毒性疾病的发生，其中就包括猫肠炎和流感。传染病不一定等同于疾病。疾病指的是动物任何器官的正常功能所受到的损伤，通常都是被传染的，但也不一定每种疾病都是传染病。比如，猫咪可能会感染上猫类冠状病毒，但是不一定就会表现出一定的患病症状。并不是所有的传染病都有传染性，也就是说，不是所有的传染病都要通过接触去感染其他的动物。
衣原体是一种有机体，从生物学上来讲它位于病毒和细菌之间（和病毒不同，它是一个独立完整的细胞体，并且并不需要宿主），它会导致猫咪的上呼吸道感染，这种疾病的症状和流感非常相似。突发的上呼吸道疾病会导致猫咪的一只眼或双眼发炎红肿，严重时还会流出脓水。这种疾病发作更严重的时候还会导致猫咪鼻子流脓，同时还伴有味觉和食欲的消失。衣原体对抗生素类的反应很大，细菌也对抗生素很敏感。从1991年开始，有一种衣原体传染病疫苗就已经投入使用了。
这种病很麻烦，它会影响猫咪的上呼吸道。这类疾病主要由两种病毒引起：猫类萝状病毒和疱疹病毒。这两种病毒都会使猫咪咳嗽、打喷嚏。鼻部和眼部的脓会使猫咪很难受，喉部剧烈的磨痛让猫咪不愿吃食喝水。猫类萝状病毒经常会导致鼻子、嘴和舌头严重溃疡。猫类疱疹病毒可能会导致鼻部、气管和肺部发炎，这会使猫咪一刻不停地咳嗽、打喷嚏。
要注意给猫咪保暖，给它舒适的环境，还要鼓励它多吃东西，足量饮水，只有这样，猫咪活下来的机会才会大一些。给猫咪服用抗生素能降低继发感染的概率，但是不能杀死原始的病毒。最好的防治措施是给猫咪接种有效的流感疫苗。
猫白血病毒（FeLV）最早引起纯种猫育种者的注意是在20世纪70年代初。一开始人们害怕这种传染病会传染给人类，尤其是小孩。后来证明并非如此——这种病毒只能在猫之间传播。最初人们认为纯种猫比其他猫种更容易感染上猫白血病，但是这一点也一直没有得到证实。一旦接触到这种病毒，所有的猫都同样会迅速地感染上这种传染病。后来人们发现感染过这种病毒的猫的比例远比人们预想中的要高得多，它们最后也活了下来并且活到很老。以前有兽医声称患了猫白血病的猫应当尽早安乐死，这个发现证明这种说法纯粹是无稽之谈。
有的猫在患了猫白血病之后又很快感染上其他传染病，这些传染病总是非常严重而且无法治疗，因为猫白血病毒会给免疫系统带来灾难性的破坏，对其他系统的影响则没有这么严重。
这种病毒和人体免疫缺陷病毒（HIV，即艾滋病毒）很类似，这种病毒会慢慢地导致猫咪患上获得性免疫缺陷综合征（AIDS）。
猫科动物的艾滋病毒并不会传染给人类，而人类的艾滋病毒也不会传染给猫。
FIV病毒会一点点地破坏猫的免疫系统。免疫力下降会导致猫咪很容易受伤，并且容易感染。虽然猫咪在感染后的初期里健康状况仍然良好，但是一些小毛病会慢慢变得无法医治，最终导致猫咪的死亡。目前为止，还没有预防这种病毒的疫苗。
其实，FIP病毒在很多猫的身上都能发现，并且只在少数情况下才会引起暂时性的腹泻。然而在感染上这种病毒的猫之中，有10%的病例会出现体内扩散的情况，病毒从肠道蔓延开来侵蚀到血管，从而导致非常严重的炎症一—这就是猫传染性腹膜炎。猫咪的体内有一层膜把腹腔从中隔开，这层膜叫做腹膜，而一旦腹膜的血管感染上了病毒而发炎，治疗起来是非常困难的，并且多半不会成功。到目前为止，我们还没有清晰地观察到这种传染病发病的整个过程。几乎猫咪的每一个年龄阶段都可能触发传染性腹膜炎，即使是很小的幼猫也有可能染上这种疾病。
湿型猫传染性腹膜炎是这类传染病中最常见的一种。这种病发作起来非常快。猫咪一天之前可能还精神奕奕、活泼好动、胃口好、排便也很正常，可一旦感染上这种病毒，24小时之内猫咪就会变得没精打采，毫无食欲，还会出现呕吐和腹泻的症状。它的皮毛变得黯淡，而最突出的特征则是因为充水而胀得非常大的腹部。这种病是治不好的，安乐死是唯一的出路。
干型猫传染性腹膜炎在这类传染病中不太常见，并且很难诊断出来。这一类发病的征兆和其他疾病的前兆很相像。到了一定阶段之后，猫咪还会并发黄疸病，并且出现和猫流感相类似的症状，比如方向感的丧失、眼部出血导致失明甚至最终导致痉挛。
我们可以通过抗体检验来测试猫的身上是否携带这种病毒。如果猫的身上没有这种病毒，那么它的滴定度设为零。80%的猫测验结果都呈阳性，这表示它们曾经接触过这种疾病。有的育种者对外称自己育种的猫滴定度为零，但大部分兽医检测的结果都显示出了一定的滴定度，只不过这个值较低，一般被认为在正常范围之内。大部分的猫看起来都很正常，即使它们检测的结果显示出滴定度较高。
猫海绵状脑病是由一种不能自生的蛋白质亚病毒引起的。它和牛的海绵状脑症（即疯牛病）很像。这种疾病对猫是致命的，并且病体死亡之前无法确诊。这种病似乎是通过吃了带病的肉传播的，比如吃了带疯牛病毒的牛肉。发病猫会有不正常的行为表现，包括不再能自己理毛、经常流口水、肌肉常常会颤抖，并且头部姿势常常不正常。但是，只有在病体死亡后才能确诊。