一般可以通过白细胞数值、中性粒细胞计数、细菌培养、病毒的抗原检测、病毒的核酸检测等方法判断是细菌感染还是病毒感染，一旦患病，应及时就医。
一般进行血常规检查时可以了解白细胞的数值，如果身体受到病毒感染后白细胞总数通常无明显变化或略微降低。而受到细菌感染时，白细胞会参与身体的免疫功能，所以会出现该项数值明显升高的情况。
如果是病毒感染所致，通常中性粒细胞计数会降低，若是细菌感染所致，通常中性粒细胞计数会增多。
此方法可以用人工的方式使细菌生长繁殖，然后制作成标本进行分离培养，再进行形态、生化及血清学反应鉴定，能够排查是否为细菌感染。
该方法可以通过检测体内的病毒蛋白质，判断自身是否存在病毒感染，一般灵敏度比较高、特异性比较强。
该方法是利用呼吸道分泌物、血液或粪便作为标本，进行详细的检查，能够排查体内是否有外来入侵的病毒核酸，有助于鉴别新型冠状病毒感染。
如果出现细菌感染可以遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒、头孢呋辛酯颗粒等药物治疗，病毒感染所致可以遵医嘱使用利巴韦林颗粒、盐酸伐昔洛韦胶囊、泛昔洛韦片等抗病毒药物治疗。
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