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医院现有职工2920余名，其中高级职称400余人，拥有中科院院士等国家高层次人才102人次。作为同济大学东方临床医学院，承担本科、硕士、博士教育，有96位博士研究生导师和140位硕士研究生导师，是上海市住院医师和专科医师培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、国家全科医师规范化培训基地、国家心血管病学和普通外科学专科医师规范化培训基地。
医院有国家、上海市重点学科15个，在灾难医学、干细胞与转化医学、心力衰竭、心脏外科、心血管内科、口腔种植修复、胆石微创、肿瘤综合诊治、脑血管病、肛肠外科、颅脑肿瘤等学科领域特色明显。2005年的诺贝尔奖得主巴里马歇尔院士与医院合作共建马歇尔国际消化病诊疗中心，并担任该中心主任。医院承担所有在浦东举办的重大国际会议、重要外国元首和重大国际赛事的医疗保障工作，医院国家紧急医学救援队是首支通过世界卫生组织认证的国际应急医疗队。
医院建有心律失常教育部重点实验室、张江国家自主创新示范区干细胞转化医学产业基地、国家干细胞库、上海市心力衰竭研究中心、上海市脑卒中中心等与国际接轨的科研平台，有临床医学、生物学博士后流动站，是国家首批干细胞临床研究备案基地。2016年疾病综合救治指数在上海市医院系统排名第8位，中国医院科技影响力排名第61位，自然指数（NatureIndex）最高排名为全国医院第8位（2016年时段排名）;2017年获批国家自然科学基金中标61项，在全国医院系统中排名第20位，中国医院自然指数最高排名第14位；2018中国医院科技影响力全国医院第63位，获批国家自然科学基金52项，位居全国医院并列第24位。
由医院建设并托管的上海市东方医院吉安医院成为新区支援老区精准医疗扶贫的典范，被国家卫计委和国家人社部评为全国卫生计生系统先进集体。
本着“学以去疾、德以扬善、同舟共济、求实创新”的办院宗旨，东方医院正为创建公益性、学术型、国际化的精品医院而砥砺前行。