PETS是由教育部考试中心举办考试，大学英语四六级是由教育部高等教育司举办的考试，PETS是社会化制的考试，考试内容偏向语言的应用。这两者主要区别如下：
一、PETS和CET的主办机构是不同
PETS是由国家教育部考试中心举办，而CET是由国家教育部高等教育司组织。
二、考试的等级划分和报考要求不同
PETS考试分为五级，但考生不必按部就班从一级考起，可以根据自己的情况参加任何一级的考试；但CET的规定就要严格的多，如果考生没有通过四级的话是不允许参加六级考试的，而且按最新的规定如果考生没有大学专科毕业证，报考四级就必须有CET三级证书。
三、考试内容上不同
PETS考试更注重听力和口语考试，考试分笔试和口试两项，两项都及格才取得合格证书。但CET考试的情况就不同了，口语考试只面向那些四级成绩达到80分，六级成绩达到75分的优秀考生，因此其考生范围相当小。从严格意义上来说口语考试并不是CET四六级考试的一部分，它单独考试，单独计分，单独颁发证书，它的成绩对考生得到四六级证书是没有影响的。
四、考生范围要求不同
PETS是真正的"全国性"考试，它对考生没有任何年龄、职业和教育程度的限制，任何人都可以参加，甚至还没有年满18岁的考生同样可以报名；而CET是大学英语考试，因此该考试主要是针对在校大学生的，有学历要求。
五、考试成绩的用途不同
PETS考试：
（1）通过全国公共英语考试二级以上笔试考核者，可免试自学考试专业的英语（一）课程；通过全国公共英语考试三级以上笔试考核者，可免试自学考试专业的英语（二）课程。
（2）通过全国公共英语考试四级者可免成人高等教育本科毕业生申请学士学位非英语专业外国语统一考试。
CET考试：
大学英语四、六级考试的成绩主要是对在校大学生有着直接的影响。现在按照很多普通大学的规定本科毕业生如果没有四级证书将无法得到学士学位；艺术类和体育类院校则要求学生必须通过CET三级考试；六级成绩虽然不作为申请学士学位的必要条件，但它会对学生得到奖学金产生影响，在某些院校六级证书还会影响到保送硕士研究生，因此它也是非常重要的。