编译:Frank,编辑:小菌菌、江舜尧。
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论文ID
原名:ComparativemetagenomicsoftwodistinctbiologicalsoilcrustsintheTenggerDesert,China
译名:宏基因组学解析了中国腾格里沙漠两种不同生物土壤结皮微生物
期刊:SoilBiologyandBiochemistry
IF:5.29
通讯作者:李靖宇
通讯作者单位:北方民族大学生物科学与工程学院;北方民族大学宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室
实验设计
图1腾格里沙漠南部采样点和不同生物土壤结皮的分布。生物土壤结皮包括细菌(Z1-Z6)和苔藓(X1-X6)两种。
2生物土壤结皮的化学分析
3DNA提取、文库构建和基因组测序
4序列质量控制、装配、基因预测、分类学和功能注释
5统计分析
结果
1生物土壤结皮化学性质的比较
图2苔藓与细菌生物土壤结皮化学因子比较分析。
2细菌和苔藓生物土壤结皮微生态系统的比较
图3生物土壤结皮类型对微生物分类(a)和功能(b和c)组成的影响。a:菌属水平;b:eggNOG水平;c:KEGG通路水平。
图4苔藓与细菌生物土壤结皮菌门的比较。
图5苔藓与细菌生物土壤结皮菌属的比较。
图6在KEGG3级通路上苔藓和细菌生物土壤结皮的功能比较。
图7在KEGG模块水平上苔藓和细菌生物土壤结皮的功能比较。
图8.不同的氮转化途径及苔藓和细菌生物土壤结皮的相对基因丰度。(a)比较两种不同类型的氮转化过程的功能基因。(b)苔藓(左)和细菌(右)生物土壤结皮生物群落氮循环的主要途径。
4生物土壤结皮的化学特性与微生物群落的关系
表2用PerMANOVA方法评价不同生物土壤结皮类型和总有机碳(TOC)对菌属水平微生物群落组成的影响。
表3用PerMANOVA方法评估不同生物土壤结皮和(生物)化学参数对不同功能水平微生物组分的影响。