主角能够遇见赤红、青绿和碧蓝，并与之对战。
在完成递送包裹任务之前，火箭队三人组代替了醉酒的老人阻挡主角前往２号道路。
增加了卡拉卡拉和死去的嘎啦嘎啦相遇的剧情。
在火箭队基地，增加了搭档取得电梯钥匙的剧情。
主角挑战常青道馆前，增加了取得钥石及超级石的剧情。
主角于常青道馆战胜坂木并取得绿色徽章后，便改由青绿担任新的常青道馆馆主。
宝可梦
包含了关都的全部151只宝可梦以及一些阿罗拉的样子的宝可梦。
野生宝可梦在地图上均为可见。部分宝可梦会主动靠近与玩家互动。
相同种类宝可梦的不同个体拥有各自的身高和体重，可以通过红色或蓝色光环确定是比图鉴上的高还是低。
最初拿到的宝可梦为搭档皮卡丘LP或搭档伊布LE。
搭档宝可梦的种族值与普通的皮卡丘、伊布相比有所提升，且6项能力的个体值必定是31。
搭档伊布与普通的伊布不同，拥有性别差异。可以通过游戏开始时出现尾巴形状或花纹判断皮卡丘或伊布的性别。
两只新的幻之宝可梦登场：美录坦及其进化型美录梅塔。
根据宝可梦的体型和习性，能够让宝可梦跟随在身后或者骑乘。
整合成一键包了，安装就能使用，非常方便
版本限定宝可梦是指在主系列的同一系列的版本中只能从其中的一个或几个版本内可以凭单一版本获得，而在其他的版本内无法获得的宝可梦。
由于在后期的游戏版本中的联动要素增加，获得宝可梦的形式也更为复杂，一些宝可梦尽管游戏中有获得途径但条件并无法通过单一版本满足，以下列表以游戏中存在的获得途径为准。
背景色代表在该游戏中可以得到这只宝可梦。
白色背景表示无法得到这只宝可梦。
全技能招式+全秘术解锁方法介绍
1、头槌：初次击败小刚后获得。
2、挑衅：红莲镇研究所右侧第二个房间。
3、帮助：玉虹市商场3楼售货员。
4、瞬移：宝可梦塔。
5、睡觉：玉虹市游戏厅地下。
6、光墙：玉虹市商场顶楼购买饮料苏打给女孩。
7、保护：玉虹市商场顶楼购买饮料柠檬给女孩。
8、替身：带皮皮到金黄市上方民宅2楼给女孩看。
9、反射壁：玉虹市商场顶楼购买饮料矿泉水给女孩。
10、挖地洞：华蓝市右侧击败火箭队。
11、鬼火：常青市左下砍树NPC给。
12、空气斩：7号路训练师赠送。
13、劈瓦：10号路教练训练师。
14、飞翔：16号路左侧方法内女孩给。
15、地球上投：正辉家旁边教练训练师。
16、电磁波：24号路。
17、龙尾：玉虹市商场购买。
18、急速折返：玉虹市商场购买。
19、铁尾：玉虹市商场购买。
20、暗之波动：玉虹市游戏厅地下。
21、欺诈：宝可梦屋。
22、岩崩：宝可梦屋教练训练师。
23、雷电拳：金黄市格斗系道馆教练训练师。
24、十字劈：12号道路。
25、拳瀑：玉虹市商场购买。
26、毒击：玉虹市游戏厅旁。
27、剧毒：击败浅红市阿言。
28、三重攻击：玉虹市商场购买。
29、热水：击败小霞后取得。
30、健美：玉虹市商场购买。
31、火焰拳：15号道路教练训练师。
32、魔法闪耀：12号路民房里取得。
33、冥想：击败娜姿取得。
34、龙之波动：西尔佛公司7楼。
35、急冻拳：21号道路教练训练师。
36、十万伏特：击败马志士。
37、喷射火焰：西尔佛公司10楼。
38、打雷：无人发电厂。
39、逆鳞：冠军之路。
40、精神强念：金黄市民宅。
41、地震：击败阪木。
42、自爆：西尔佛公司2楼。
43、暗影球：玉红市商场购买。
44、嬉闹：玉虹市大楼顶楼(需要绕道后方)。
45、日光束：冠军之路。
46、打字爆炎：打败夏伯。
47、冲浪：15号道路。
48、破坏光线：玉虹市商场购买。
49、蛮力：冠军之路。
50、羽栖：12号道路通道2楼。
51、暴风雪：冠军之路。
52、污泥爆弹：宝可梦屋。
53、百万顿吸收：击败艾丽嘉。
54、加农光炮：西尔佛公司5楼。
55、急冻光线：双子岛。
56、隐形岩：冠军之路。
57、聚宝功：3号道路教练训练师。
58、直冲钻：17号道路教练训练师。
59、食梦：12号道路教练训练师。
60、超级角击：华蓝洞窟门口教练训练师。
1.性格
首先，我们先来了解一下性格的作用，首先打开精灵面板，在如下的六边形框中，有着6种属性
红色的特攻表示由性格的影响特攻加成1.1倍，而蓝色的特防则是特防加成0.9倍，意思特防不是增加而是减少。没有颜色则是无加成与减少，一个性格既然存在着加成，也同时存在着减少，当然不会有性格存在两个加成或是减少的。
Q：博士，在捕捉的时候，有时候想要培育一只加速度减物攻的特攻向喷火龙，可是好不容易抓到的性格都不对啊，博士我该怎么办呢？
2.个体值
Q：博士，总有些大佬说个体值是什么4V5V6V又是些什么？？？
A：关于个体值，很多新入坑的训练家可能会很陌生。
个体值是宝可梦游戏专用名词，个体值我们可以把它看成先天战斗能力值，是在刚遇到的时候就已经确定的数值。个体值越高，能力越高。它在任何两只精灵间都是可能存在差距的。它分为六项，分别是HP,物理攻击力，物理防御力，速度，特殊攻击力和特殊防御力。每项的值都为0-31之间的任意一个整数。
如果你的6种属性，有一个个体值为31，即为1V，二个为31，则为2V，以此类推。
Q:博士，那么怎么看个体值呢？
A：首先我们先去11号路右侧通道处的二楼取得评定系统，打开精灵面板，按Y，就会显示如下。属性的下方有显示最棒，最棒就代表个体值为31，6个为31，那么这个皮卡丘就是6V的。
Q：博士，那么怎么获得6V宝可梦呢？
A：本作游戏中没有孵蛋系统，因此只能靠抓捕宝可梦的方式获得高V宝可梦。
我曾捕捉独角虫做过测试,连续捕捉142只独角虫
其中，在连续抓同一只宝可梦时
连续数量0-10：出现高v概率低
连续数量11-20：至少2v
连续数量21-30：至少3v
连续数量31+：至少都是4v，出现5v，6v就只能看脸了
不存在30连必出6v的事情！
在连锁捕捉宝可梦的时候，会出现打破连锁的情况：
1、存档后关闭游戏，再打开游戏时连锁取消
2、捕捉的时候，宝可梦逃跑了
3、捕捉其他的宝可梦
在连锁捕捉宝可梦的时候，建议大家带上充足的球与引虫香水，提高捕捉效率。
由此，我们就从性格与个体的角度上培育了一个优质的宝可梦，之后我们需要给它搭配技能，提高等级，对它进行特训，就会成为我们强力的搭档。
在《精灵宝可梦》的世界里，有一些极少露面的特别宝可梦。这些宝可梦被称为“传说的宝可梦”。在本作的舞台关都地区，急冻鸟、闪电鸟和火焰鸟这三种“传说的宝可梦”将会登场。
在与急冻鸟、闪电鸟和火焰鸟对战并取得胜利之后，便能获得捕捉它们的机会！
在对战中全力以赴，努力将“传说的宝可梦”捕捉到手吧！
只有取得对战的胜利才能有机会捕捉“传说的宝可梦”。
胜利后便能获得捕捉它们的机会！
捕捉成功后，你还可以让它跟随你一起冒险！和“传说的宝可梦”一起享受关都地区的冒险吧。