FEMSMicrobiologyReviews——[13.92]
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2021-01-11,doi:10.1093/femsre/fuab001
CellHostandMicrobe——[15.923]
①新生小鼠口腔上皮定植大量细菌，断奶后下降直至成年，菌群多样性和组成的动态变化均与肠道不同；②中性粒细胞通过IL-17-γδT17、菌群依赖方式，被临时募集到新生小鼠口腔上皮细胞；③新生小鼠口腔粘膜上皮出现菌群依赖的结构变化，上皮增厚、角化程度加深，通透性降低；④新生小鼠口腔上皮细胞和成年相比，更替率较慢，并有着独特的转录组特征；⑤新生小鼠唾液分泌增加、减少口腔菌群，反之口腔细菌诱导唾液抗菌成分表达。
2021-01-06,doi:10.1016/j.chom.2020.12.006
NatureCommunications——[12.121]
2021-01-26,doi:10.1038/s41467-020-20495-4
NatureBiotechnology——[36.558]
①inStrain软件使用了样本中组装的基因组和完整的短读长比对信息，并考虑了主要和次要等位基因信息；②基于模拟样本评估，与现有的工具比较（StrainPhlan、dRep、MIDAS），它能更精确的对基因组进行比较，并评估基因组的多样性；③应用于来自同一个重症监护室的160名早产儿的1163个数据中，双胞胎与无血缘关系的新生儿相比，共享更多的菌株、噬菌体或质粒；④剖宫产的婴儿与正常分娩的婴儿相比，感染的克雷伯氏菌拥有更高的核苷酸多样性。
2021-01-18,doi:10.1038/s41587-020-00797-0
GutMicrobes——[7.74]
2021-01-07,doi:10.1080/19490976.2020.1863134
JournalofGeneticsandGenomics——[5.065]
①妊娠糖尿病（GDM）患者的两种口腔样本（唾液和牙菌斑）的菌群，与牙周炎或龋病患者的口腔菌群表现出显著差异；②GDM与牙周炎之间可能的关系可能与链球菌属和韦荣球菌属的丰度降低有关，就菌群的变化而言，GDM与龋病之间几乎没有关系；③利用口腔菌群中的细菌生物标志物，构建了基于支持向量机和随机森林算法的GDM分类模型；④唾液或牙菌斑中的某些细菌可以有效区分GDM孕妇和健康孕妇。
2021-01-20,doi:10.1016/j.jgg.2020.11.006
Hepatology——[14.679]
①纳入65名接受直接作用的抗病毒药物（DAA）治疗的丙肝患者，共有7种不同的DAA组合（主要是索非布韦及雷迪帕韦）；②所有接受DAA治疗患者均达到了持续病毒学应答（SVR），从治疗前到完成24周/48周的SVR（SVR24/48）期间，患者的肠道菌群α-多样性非显著性地增加；③治疗期间，仅在无肝硬化的患者中表现出肠道菌群α-多样性的显著增加，且仅在无肝硬化的患者中可观察到SVR诱导的菌群群落结构差异。
2021-01-07,doi:10.1002/hep.31700
JournalofNeuroinflammation——[5.793]
2021-01-06,doi:10.1186/s12974-020-02053-3
Science——[41.845]
①采用代谢谱、互作转录组研究宿主代谢产物调节巨噬细胞（MΦ）内鼠伤寒沙门氏菌（S.Tm）的生活轨迹；②整体调节子分析显示S.Tm可感知MΦ代谢状态改变。MΦ糖酵解受到抑制导致SPI-2毒力岛调节子下调、影响病菌细胞内存活；③MΦ代谢产物琥珀酸诱导病菌SPI-2毒力岛、效应蛋白表达、产生抗菌抗性；④S.Tm在琥珀酸添加培养条件下更易存活；⑤体内、体外实验均显示S.Tm吸收琥珀酸的转运蛋白受损，其毒力、细胞内存活力也随之下降。
2021-01-22,doi:10.1126/science.aba8026
感谢本期日报的创作者：王帅，李志明，LastLOGIC，刘永鑫-中科院-宏基因组，szx，吴芹，好雨