蚂蚁金服旗下拥有第三方支付（支付宝）、小额贷款（蚂蚁小贷）、基金（天弘基金）、银行（浙江网商银行）、在线理财（招财宝）、保险（众安保险）、征信、担保等多种金融牌照和多个实体公司，是国内互联网金融公司中业务庞杂、关联交易复杂的一个典型样本。
而恒生电子旗下也拥有基金销售（数米基金）、金融数据供应商（恒生聚源）、互联网金融（三潭金融）、P2P系统提供商（融都科技）等，且正在加速互联网金融领域的收购与并购进度。
虽然在上市之前阿里集团和蚂蚁金服签署了互不进入的协议，厘清了两者之间的关系，但蚂蚁金服与阿里之间不仅存在密切的业务往来，更与马云等集团创始人之间有着紧密的股权关系。
如何整合旗下诸多公司的复杂业务、厘清持续性的关联交易，都将成为马云互联网金融板块日后必须面对的挑战。
“不差钱”的恒生电子
恒生电子近年来四处投资和入股，充沛的现金流使其成为马云布局互联网金融领域的重要平台。
2014年，浙江融信网络技术有限公司（马云持股99.1365%）收购了恒生电子的母公司杭州恒生电子集团有限公司（下称“恒生集团”）100%的股权，从而间接持有恒生电子20.62%股权。
恒生电子的股权结构由多名自然人共同控制变为单一控制，马云成为恒生电子的实际控制人，标志着其在互联网金融领域的布局再下重要一城。
年报显示，2014年恒生电子实现营收14.22亿元，同比增长17%，主要是公司互联网金融、银行、资本市场业务线均有快速发展。2014年恒生电子归属于上市公司股东的净利润为3.6亿元，同比增长11.51%。
此外，2014年恒生电子的经营性现金净流量达到6.13亿，同比增长54.18%，数倍于利润增速。值得注意的是，2014年恒生电子的互联网业务收入同比增长124%。
4月14日，主营P2P网贷系统定制的融都科技在杭州宣布，其获得恒生电子和其关联法人宁波云汉投资管理合伙企业（下称“云汉投资”）6600余万元的战略投资。恒生电子和云汉投资共获得融都科技合计46.9%的股份。
恒生电子董事长彭政纲4月14日对21世纪经济报道记者表示，这两年P2P行业将会有大变化，进入P2P的上市公司和金融机构增多，这会给P2P做服务的公司带来机会，“恒生电子和融都科技将在市场、技术等各个方面进行合作，未来会有很多升级的产品出来，为P2P行业提供服务。”
除融都科技外，恒生电子还投资了证通股份有限公司，以布局互联网证券业务；并入股深圳开拓者科技公司，以强化期货产品线；同时对旗下子公司进行重组，以达成投资平台整合并加速互联网金融发展。
恒生与阿里的协同效应
恒生电子与阿里牵手之后，开始显示出正向的协同效应。以上海恒生聚源数据服务有限公司（下称“恒生聚源”）和数米基金网为例，其业务均在去年得到了极大的增长。
恒生电子年报显示，截至2014年底，恒生聚源的两大产品线数据库和终端产品线迅猛增长。市场覆盖率提高，同比增长13%，特别是在基金行业达24%，保险行业达33%。
而2014年数米基金网的基金开户数比2013年同期增长744.51%，交易用户数同比增长1067.53%，基金交易额同比增长885.08%，基金销售存量同比增长372.85%。
从已有的合作案例来看，恒生与阿里的协同思路为，蚂蚁金服携同恒生电子（以及恒生电子核心管理层持股的云汉投资），再加上能产生业务协同效应的第三方企业，通过股权及业务层面的合作，利用各方的优势互补共同打造庞大的“互联网金融帝国”。
马云正式入主恒生仅一月有余，双方牵手合作的两大重磅动作已然落地。
2014年11月21日，恒生电子公告称将与第一财经、蚂蚁金服、云汉投资共同增资恒生电子的控股子公司恒生聚源，增资规模预计约为3.9亿元。增资后恒生电子依然为恒生聚源的控股股东，持股约51%，第一财经预计将持股恒生聚源29.9%，蚂蚁金服持有19.1%。
联合第一财经的内容及传播优势、蚂蚁金服的数据优势，恒生聚源或对标的是中国版“彭博”，从而打通从后端的交易、风控到前端的数据咨询整个资产管理产业链。
2014年11月10日，恒生电子公告称，拟与中国投融资担保有限公司（下称“中投保”）、蚂蚁金服、云汉投资、北京盈丰时代投资管理中心共同发起设立“浙江三潭金融信息服务股份公司”。其中，中投保占股31%，蚂蚁金服占25%，恒生电子及云汉投资合计持股36.25%。
从恒生聚源和三潭金融的股权结构来看，恒生电子（联合云汉投资）在其中均占据了控制权。
三潭金融聚焦于互联网金融业务，中投保有丰富的投融资与担保资历，蚂蚁金服则有平台运作经验与流量入口，恒生电子可提供IT技术，对比蚂蚁金服已有的业务，金融资产交易平台无疑是三潭金融的重点发展方向。
由于余额宝的规模瓶颈已显现，三潭金融被寄予厚望打造下一个具有爆炸影响力的互联网金融产品。
2015年2月，三潭金融发行了“三潭普惠1号”产品，预期年化收益率为6.4%，总规模为5000万，在蚂蚁金服的“招财宝”平台上线27秒钟后即卖光。根据中投保官网的介绍，截至2015年3月中旬，三潭金融已在招财宝平台发行了规模共计5.1625亿的产品。
盘根错节的关联交易
阿里巴巴集团、蚂蚁金服、恒生电子三者之间相互存在着频繁且复杂的关联交易。
2014年12月3日，恒生电子公告称其与阿里集团旗下的三家公司，阿里云、浙江淘宝、淘宝软件，以及蚂蚁金服集团旗下的五家公司，支付宝、支付宝杭州、招财宝、集分宝和蚂蚁金服，均签订了《关于日常经营性关联交易的协议》。
其中，恒生与阿里系公司之间的关联交易合计金额不超过3440万元，与蚂蚁金服系公司之间的关联交易合计金额不超过3530万元，交易期限均为2014年10月1日至2015年12月31日。
比如，恒生向阿里云采购不超过2600万元的云服务，恒生在淘宝开通基金销售官方旗舰店需支付不超过840万元的费用。恒生向支付宝采购支付和货款收付服务，支付宝同时又向恒生采购软件和技术。粗略计算，上述关联交易总额约9770万元。
如何厘清三者之间持续性的关联交易，并做到按照市场公允定价，不损害上市公司股东利益，都将是马云麾下日渐庞大的互联网金融板块必须面对的挑战。