股东基于股权转让而产生的纳税义务亦无法避免，由于股东认识错误，导致股权转让中的税收陷阱比比皆是。
一、股权转让阴阳合同中的“避税”条款无效
《股权转让协议》中关于转让方不须就股权转让价款向受让方提供任何形式的发票，但需出具收据或收条的约定，属《合同法》第五十二条第（二）项规定的恶意串通，损害国家、集体、或者第三人利益的情形，应为无效条款，但该条款无效不影响涉案合同其他条款的效力。《股权转让协议》的其他条款及《补充协议》不违反法律、行政法规的强制性规定，合法有效。
二、实缴注册资本0元，股东0元转让股权也要缴税
某物业管理公司的股东王女士，将其持有公司的10%股权（股东约定认缴现金资本100万元，王女士占10%应出资10万元，实缴0元）以人民币0元转让给了刘先生。王女士认为本次转让股权收入为0元，实收资本也是0元，无转让所得，应该不需要缴纳个人所得税。
对于王女士的这次股权转让，物业公司2016年9月《资产负债表》列报的净资产（所有者权益）为36266.43元，王女士拥有公司10%的股权，所对应的净资产份额为3626.64元。
即以股权转让收入减除取得股权时的原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”项目缴纳个人所得税。
三、企业股东转让股权并完成工商变更，即使没有收到股权转让款也要缴税
四、纳税人解除原股权转让合同并收回转让的股权，征收个人所得税不予退还
转让行为结束后，当事人双方签订并执行解除原股权转让合同、退回股权的协议，是另一次股权转让行为，对前次转让行为征收的个人所得税款不予退回。
笔者特别提示基于此规定，如果股权转让协议已经履行，履行的标志是受让人已经向转让方支付了股权转让款，并在当地工商部门办理了工商变更登记手续。
则当事人双方签订并执行解除原股权转让合同、退回股权的协议，对前次转让行为征收的个人所得税款不予退回。
五、新股东以不低于净资产价格收购股权
新股东以不低于净资产价格收购股权的，企业原盈余积累已全部计入股权交易价格，新股东取得盈余积累转增股本的部分，不征收个人所得税。
一、1名或多名个人投资者以股权收购方式取得被收购企业100%股权，股权收购前，被收购企业原账面金额中的“资本公积、盈余公积、未分配利润”等盈余积累未转增股本，而在股权交易时将其一并计入股权转让价格并履行了所得税纳税义务。
股权收购后，企业将原账面金额中的盈余积累向个人投资者(新股东,下同)转增股本，有关个人所得税问题区分以下情形处理：
（一）新股东以不低于净资产价格收购股权的，企业原盈余积累已全部计入股权交易价格，新股东取得盈余积累转增股本的部分，不征收个人所得税。
（二）新股东以低于净资产价格收购股权的，企业原盈余积累中，对于股权收购价格减去原股本的差额部分已经计入股权交易价格，新股东取得盈余积累转增股本的部分，不征收个人所得税;对于股权收购价格低于原所有者权益的差额部分未计入股权交易价格，新股东取得盈余积累转增股本的部分，应按照“利息、股息、红利所得”项目征收个人所得税。
新股东以低于净资产价格收购企业股权后转增股本，应按照下列顺序进行,即先转增应税的盈余积累部分，然后再转增免税的盈余积累部分。
六、个人股权转让过程中取得违约金收入也要征收个人所得税
笔者特别提示，转让方个人取得的该违约金应并入财产转让收入，按照“财产转让所得”项目计算缴纳个人所得税，税款由取得所得的转让方个人向主管税务机关自行申报缴纳。
七、个人股权转让合同签订生效后，即使转让方没有收到股权转让款也应当申报纳税
第二十条具有下列情形之一的，扣缴义务人、纳税人应当依法在次月15日内向主管税务机关申报纳税：
（二）股权转让协议已签订生效的；
八、个人以股权参与上市公司定向增发属于股权转让，征收个人所得税
九、以非货币出资形成的股权转让时涉及二次纳税义务
对个人非货币性资产投资形成的股权转让所得，仍应按照“财产转让所得”项目，依法计算缴纳个人所得税，第二次纳税义务产生。