中心核定内设机构25个。人员编制950人，在编679人，专业技术人员611人，正高职称94人，副高职称143人，博士研究生25人，硕士研究生315人。现有省部级专家9名，市厅级专家51名；4名退休专家荣获“四川省医疗卫生终身成就奖”。中心本部位于成都市武侯区中学路6号，占地22.6亩，建筑面积4.5万㎡；省卫生监测检验暨包虫病防治中心位于成都市双流区岐黄一路1669号，占地37.97亩，建筑总面积4.4万㎡。
中心高度重视实验室能力和资质建设。建有全省首个生物安全三级实验室，并获准开展8种病原活动资格；西南地区首个自动化、智能化的病原微生物资源库，可规范保存各类菌（毒）株或感染性样本400余万份。建有血吸虫病流行病学、包虫病流行病学及防治、现场流行病学、结核病流行病学4个省医学重点学科，艾滋病确认实验室、病原微生物分子生物学实验室、中毒理化检测实验室3个省医学重点实验室，分别与四川国际旅行保健中心和川北医学院共建有口岸疫病疫情监测四川省重点实验室，疾病监测与数智健康治理省级哲学社会科学重点实验室（试点）。现有技术服务资质10项，其中国家级5项，省级5项。24类1117项检验检测项目通过认证认可，13类601项检验检测项目通过检验检测机构资质认定，开展A类检验项目355项，开展率达96.21%。
中心大力实施创新驱动发展战略，在科技创新、人才培养等方面成效显著。与中疾控共建有“院士工作点”，创建有四川省博士后创新实践基地，建立有性病艾滋病与结核病研究、慢性病防控两个博士工作站，成立有疫苗临床研究中心，主办有《预防医学情报杂志》、《职业卫生与病伤》、《寄生虫病与感染性疾病》3个科技期刊。截至2023年底，共获得各级科技成果奖70项，专利71项，SCI收录论文196篇。中心是中国疾病预防控制中心现场流行病学、全国艾滋病防治区域培训两个国家级培训基地，国家疾控机构公共卫生医师规范化培训试点单位。是美国加州大学、科罗拉多大学和弗罗里达大学，法国孔泰大学、日本旭川医科大学的博士生实习点；四川大学、西南医科大学、成都中医药大学、成都医学院、川北医学院等5所国内院校的教学实习基地。与17个国家和地区建立了良好的合作关系，开展多项国际合作项目。先后有5位引智项目的外国专家获得四川省政府“金顶奖”，2位专家获得国家“友谊奖”。
展望未来，中心将在省委省政府、省卫生健康委、省疾控局的领导下，继续坚持新时期卫生与健康工作方针，紧紧围绕“西南领先、全国优秀”建设目标，改革创新，锐意进取，求真务实，履职尽责，加快推进国家区域公共卫生中心项目建设，全面推进疾控工作高质量发展，为保障全省公共卫生安全、人民群众健康和经济社会发展作出更大的贡献。