肠球菌属(Enterococcus)是厚壁菌门中一种革兰氏阳性球菌，常成对或短链出现，大部分物种无鞭毛，没有明显的荚膜。
其耐受性非常好，可在10至45°C的温度范围内生长，pH值范围4.6–9.9内生长，对胆汁盐也具有耐受性。目前，肠球菌属包含四十多种已知菌种，可以存在于各种环境中，包括人类、动物和昆虫的消化系统，食物、水源、土壤和一些植物中。
但在35-37°C下生长最佳，因此非常适合在人体肠道内定植。人体肠道中常见的肠球菌是粪肠球菌(E.faecalis)(90-95%)和屎肠球菌(E.faecium)(5-10%)。而粪肠球菌也是其模式菌种。
肠球菌可以发酵多种底物，包括葡萄糖、甘油、乳酸、苹果酸、柠檬酸、氨基酸和许多α-酮酸。能量产生的主要途径是葡萄糖通过糖酵解途径同质生成l-乳酸。粪肠球菌还可以通过降解粘蛋白来获取能量。
肠球菌具有“多种面孔”，其的健康益处可能是由于能够产生具有抑菌活性的“肠素”（细菌素），对李斯特菌、金黄色葡萄球菌等具有抑制作用。
进而可被用作天然的食品生物防腐剂。一些特殊的肠球菌株还被用作益生菌，具有不同有益特性：如刺激免疫力、抗炎活性、降胆固醇作用以及预防/治疗肠易激综合征和抗生素引起的腹泻，减少鼻窦炎患者的复发等。
然而，就像一枚硬币的两面，尽管它们具有促进健康的特性，但它们也具有有害特性。肠球菌也被视为机会性病原体，其表现出复杂的毒力机制，能够在各种宿主组织中定植，并对许多抗生素具有耐药性，包括四环素、β-内酰胺类药物、氟喹诺酮类药物、头孢菌素、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶等，还可能导致耐药性的传播。
它们能够从胃肠道转移到各种组织和器官，进而造成感染或疾病。目前，肠球菌是革兰阳性菌中仅次于葡萄球菌属的重要医院感染病原菌，其感染最常见的为尿路感染，其次为腹部和盆腔等部位创伤和术后感染、败血症、心内膜炎和脑膜炎。此外由于其具有耐药性，所以感染治疗起来会更困难。同时，在心力衰竭、房颤、肥胖和炎症性肠病患者中发现了肠球菌属丰度的增加。
1形态
肠球菌属(Enterococcus)是一种革兰氏阳性、不生芽孢的兼性厌氧菌，细胞呈球形或卵圆形，大小约在0.6～2.0μm×0.6～2.5μm，呈单个、成对或短链状排列。
大部分物种无鞭毛，但极少部分菌株可以通过稀少的鞭毛而运动。没有明显的荚膜。在35-37°C下生长最佳，因此非常适合在人体肠道内定植。
注：DNAG+C含量（mol%）：35.1–44.9
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发现历史
“肠球菌”一词最早于1899年提出，用于描述具有致病能力的肠道共生菌。由于形态和生化上的相似性，肠球菌曾被归为链球菌属。
1970年，基于生化和培养特性分析，建议将其归为独立的肠球菌属。1984年，这一建议得到广泛接受，并在1986年版《伯杰氏系统细菌学手册》中出现。
2009年，基于16SrRNA基因相似性提出肠球菌科，包括肠球菌属(Enterococcus)、迷走球菌(Vagococcus)、Tetragenococcus和Melissococcus。迄今为止，肠球菌属已包含五十多个物种。
肠球菌的发现历史
doi:10.1128/CMR.00058-18.
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常见物种及分布
肠球菌(粪肠球菌和较少的屎肠球菌)在出生后7-10天内定植于大多数健康母乳喂养婴儿的消化系统中。这些微生物主要来自母亲生殖道的生理菌群，但肠球菌也会动态地定植于剖宫产新生儿的胃肠道。
这些菌种对胆汁盐表现出抵抗力，这使它们能够穿过人体消化系统并在大肠中定植。成年人也会从某些食物中获得各种肠球菌种，例如猪肉、家禽和凝乳酶奶酪。
粪肠球菌为模式菌种
粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)是肠球菌的模式菌种。人体肠道中主要存在以下两种肠球菌：粪肠球菌(E.faecalis)(90-95%)和屎肠球菌(E.faecium)(5-10%)。人体中较少见的菌群还有E.casseliflavus、E.gallinarum和E.raffinosus。肠球菌很少从阴道和口腔中分离出来，如果发现，极有可能是病原体感染。
粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)
粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)是一种革兰氏阳性菌，它不能形成孢子，但对恶劣的环境条件相当耐受，在肠道免疫中起重要作用
粪肠球菌是人类肠道的正常居民，存在于大约90-95%的人中。这种细菌通常是生命早期定植于人类胃肠道的首批微生物之一，在肠道免疫系统的发育中发挥着重要作用。
EnterococcusfaecaisYM0831:一项交叉研究发现，对健康人类受试者单次施用该菌株可显著改善血糖对蔗糖耐量试验的反应。
肠球菌的常见种
临床上分离率最高的是粪肠球菌（E.faecalis），其次是屎肠球菌（E.faecium)。除此之外，还有以下的菌种：
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鸟肠球菌(E.avium)
酪黄肠球菌(E.casseliflavus)
坚忍肠球菌(E.durans)
鸡肠球菌(E.galinarum)
芒地肠球菌(E.mundii)
恶臭肠球菌(E.maladoratum)
希拉肠球菌(E.hirae)
孤立肠球菌（E.solitarius）
棉子糖肠球菌(E.raffinosus)
假鸟肠球菌(E.pseudoavium)
粪肠球变异株(E.faecalisvar)
Enterococcusgallinarum
Enterococcusgilvus
Enterococcushaemoperoxidus
Enterococcushawaiiensis
Enterococcushermanniensis
Enterococcushirae
Enterococcusinusitatus
Enterococcusitalicus
Enterococcuslactis
Enterococcuslemanii
Enterococcusmalodoratus
Enterococcusmoraviensis
Enterococcusmundtii
Enterococcusolivae
Enterococcuspallens
Enterococcuspernyi
Enterococcusphoeniculicola
Enterococcusplantarum
Enterococcuspseudoavium
Enterococcusquebecensis
Enterococcusraffinosus
Enterococcusratti
Enterococcusrattus
Enterococcusrivorum
Enterococcusrotai
Enterococcussaccharolyticus
Enterococcussilesiacus
Enterococcussp.
Enterococcussp.2011_Ileo_MS_B2
Enterococcussp.C6I11
Enterococcussp.SI-4
Enterococcussulfureus
Enterococcustermitis
Enterococcusthailandicus
Enterococcusureasiticus
Enterococcusureilyticus
Enterococcusviikkiensis
Enterococcusvillorum
Enterococcusxiangfangensis
environmentalsamples
粪肠球菌和屎肠球菌是人体肠道中常见的肠球菌物种
肠球菌种的分布会因环境、人类和动物而异。粪肠球菌和屎肠球菌在人类胃肠道中最为常见，人类粪便中的粪肠球菌数量为每克105至107个，屎肠球菌的数量为每克104至105个。
其他动植物中的肠球菌
牲畜中分离出的屎肠球菌和粪肠球菌丰度低于从人类粪便中分离出的。家畜中常见的肠球菌有屎肠球菌(Enterococcusfaecium)、盲肠球菌(Enterococcuscecorum)、粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)、Enterococcushirae和耐久肠球菌(Enterococcusdurans)；相比之下，鹑鸡肠球菌(Enterococcusgallinarum)和鸟肠球菌(Enterococcusavium)是罕见的。
粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)是狗和猫的直肠和扁桃体中常见的一种。而鸽子肠中最常见的是柱状肠球菌(Enterococcuscolumbae)，其次是盲肠球菌(Enterococcuscecorum)。
此外，在爬行动物、蜗牛、采蜜昆虫、白蚁中也发现了肠球菌。肠球菌还可以从食物、植物、土壤和水中分离出来。虽然这些细菌被认为只是植物菌群的临时组成部分，但在良好的条件下，它们可以在植物表面繁殖。从植物中分离出粪肠球菌、屎肠球菌、海氏肠球菌(Enterococcushirae)、Enterococcusmundtii、Enterococcuscasseliflavus和硫肠球菌)。
它们通常从花中分离出来，而不是从芽或叶中分离出来。这表明昆虫可能参与了肠球菌的传播。
一些食物中也存在肠球菌
然而，随着某些类型奶酪的开发。肠球菌甚至被用作某些产品中的益生菌培养物。
另一方面，已经证明在发酵剂和食物肠球菌菌株中存在毒力因子，以及毒力决定因素向发酵剂菌株的转移。
一些具有致病性的肠球菌
以下是临床中发现具有致病性的常见肠球菌物种：
Enterococcusavium
Enterococcusfaecium
Enterococcusfaecalis
Enterococcusdurans
Enterococcuscolumbae
Enterococcusdispar
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生存条件
肠球菌的耐受性非常好，但人体肠道温度最适宜生长
肠球菌可在10至45°C的温度范围内生长，但大多数物种在35-37°C下生长最佳。许多(但不是全部)品种能在42°C甚至45°C以及(缓慢地)在10°C下生长。
粪肠球菌和屎肠球菌均可在60°C的高温下存活30分钟。
肠球菌耐高盐、高碱、高胆汁、干燥
肠球菌可在pH值范围4.6–9.9内生长，最适pH值为7.5。它们还可耐受40%(w/v)胆汁盐并在其中生长。粪肠球菌可在6.5%NaCl中生长，并具有阳离子稳态，这被认为有助于其抵抗pH值、盐、金属和干燥。
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代谢
肠球菌可以发酵多种底物，包括葡萄糖、甘油、乳酸、苹果酸、柠檬酸、氨基酸和许多α-酮酸。能量产生的主要途径是葡萄糖通过糖酵解途径同质生成l-乳酸。
由于肠球菌可以利用多种糖源，因此它可以在多种环境中生存。在肠道中，粪肠球菌的大部分能量来自未吸收糖的发酵。粪肠球菌还可以通过降解粘蛋白来获取能量，粘蛋白是一种由肠道杯状细胞产生的高度糖基化的碳水化合物。
注：能量也可以通过一些氨基酸的降解获得，如精氨酸、酪氨酸、丝氨酸、苯丙氨酸等。
在不同环境条件下，可代谢产生不同的物质
在有氧条件下，葡萄糖代谢为乙酸、乙酰和CO2。在pH5.0-6.0时，丙酮酸被粪肠球菌转化为乳酸，但在中性或微碱性的pH下，丙酮酸以2:1:1的比例转化为甲酸盐、乙醇和醋酸盐。
在营养缺乏的情况下，丙酮酸转化为乙醇和醋酸盐。粪肠球菌通过诱导的特异性苹果酸酶代谢苹果酸。葡萄糖酸盐被磷酸化为6-磷酸葡萄糖酸盐，然后异化为乳酸盐和二氧化碳。
粪肠球菌能将甘油氧化为乙酸、二氧化碳和少量过氧化氢和微量乙酰甲基甲醇；将棘皮酸水解成甘氨酸和苯甲酸。
肠球菌还具有的代谢通路
卟啉和叶绿素代谢
丙酸代谢
蛋白质输出
嘌呤代谢
嘧啶代谢
丙酮酸代谢
RNA降解
核黄素代谢
次级胆酸生物合成
链霉素生物合成
苯乙烯降解
硫代谢
牛磺酸和亚牛磺酸代谢
硫胺素代谢
色氨酸代谢
缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成
缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解
维生素B6代谢
β-丙氨酸代谢
2-氧代羧酸代谢
丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢
氨基糖和核苷酸糖代谢
精氨酸和脯氨酸代谢
精氨酸生物合成
抗坏血酸和醛糖酸代谢
不饱和脂肪酸的生物合成
生物素代谢
丁酸代谢
C5-支链二元酸代谢
氯代烷和氯代烯烃降解
氯环己烷和氯苯降解
柠檬酸循环（TCA循环）
芳香族化合物的降解
果糖和甘露糖代谢
半乳糖代谢
谷胱甘肽代谢
甘油脂代谢
甘油磷脂代谢
甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢
糖酵解/糖异生
乙醛酸和二羧酸代谢
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毒力
肠球菌作为一种条件性致病菌，与其致病性有关的特性包括毒力因子和抗生素耐药菌株的增加。
毒力因子是一种效应分子，这些因子有助于其在宿主体内定植和引起感染，会增强微生物致病能力。肠球菌的毒力因子在其致病性中起着重要作用。
肠球菌能够产生的一些毒力因子
肠球菌中最常见且描述最详尽的毒力因子是聚集物质(agg、asa1)、溶细胞素(cyl)、明胶酶(gelE)、细胞外表面蛋白(esp)、粘附于胶原蛋白(ace、acm)和粘连样心内膜炎抗原(efaAfs和efaAfm)。
粪肠球菌和屎肠球菌主要毒力因子
SangiorgioG,etal.Pathogens.2024
毒力因子的具体作用机制
聚集物质(agg和asa1)是诱导肠球菌菌株表面蛋白的毒力因子，可在细菌结合过程中促进聚集体的形成，并介导与上皮细胞的特异性结合以进行定植以及携带毒力特性和抗生素抗性基因的质粒的交换。
此外，聚集物质可以与细胞外基质蛋白结合，如I型胶原、纤连蛋白和血小板反应蛋白。agg基因增加肠球菌表面的疏水性，诱导胆固醇定位于吞噬体并延缓与溶酶体囊泡融合。不过迄今为止，agg决定簇仅存在于粪肠球菌菌株中。
溶细胞素(或β-溶血素)是一种具有双重功能的蛋白质细菌素/溶血素，是肠球菌中研究最多的毒力因子。它是一种肽类毒素，能够通过在细菌靶细胞的细胞质膜上形成孔隙来裂解细胞。由产生溶细胞素的肠球菌感染引起的死亡频率比不产生溶细胞素的肠球菌感染引起的死亡频率高5倍。
明胶酶是一种胞外锌金属内切肽酶(EC3.4.24.30)，参与明胶、胶原蛋白、β-胰岛素、血红蛋白、酪蛋白和其他生物活性肽的水解。明胶酶能够裂解纤维蛋白并损伤宿主组织，从而使细菌迁移和扩散，这使得其与肠球菌特别是粪肠球菌的毒力有关。此外，这种蛋白酶在生物膜的形成中起着重要作用。
细胞外表面蛋白(esp)是一种与细胞间粘附(特别是粘附于真核细胞和逃避宿主的免疫反应)有关的致病基因决定簇。该基因可促进定植，位于肠球菌属内高度保守的染色体区域，在屎肠球菌中最常见。
总体而言，屎肠球菌菌株中这些毒力因子的发生率低于粪肠球菌菌株。毒力最高的肠球菌种是在临床中的分离株，其次是食品分离株，然后是发酵剂菌株。
许多因素会影响肠球菌种的毒力，例如：
(1)在胃肠道(正常的栖息地)定植的能力；
(2)粘附于多种细胞外基质蛋白的能力，包括血小板反应蛋白、乳铁蛋白和玻璃粘连蛋白；
(3)粘附于尿道上皮、口腔上皮和人胚肾细胞的能力。
大多数感染被认为是内源性的，细菌通过肠道上皮细胞易位，然后通过淋巴结引起感染，从而扩散到体内的其他细胞。
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耐药性
肠球菌对常用抗生素的耐药性是另一个重要的毒力特性，这极大地增强了肠球菌的致病性，使其成为可能引起感染的条件性致病菌。
肠球菌对许多常用抗生素具有耐药性
肠球菌对许多β-内酰胺类药物、氟喹诺酮类药物、林可胺类药物、头孢菌素、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶和低浓度氨基糖苷类药物具有天然耐药性。
肠球菌还可以通过质粒或转座因子从其他微生物获得耐药性，对氯霉素、红霉素、四环素、青霉素、氨苄西林、大环内酯类、氨基糖苷类(如庆大霉素、卡那霉素、链霉素)和糖肽类药物尤其是万古霉素表现出耐药性。
对万古霉素具有耐药性的肠球菌会造成严重的健康后果
万古霉素耐药菌株会带来严重的健康问题，一项报告了7066例由肠球菌引起的菌血症病例，所有病例中有28%是抗生素耐药性的。万古霉素耐药肠球菌(VRE)的死亡风险为75%，而感染敏感菌株的患者死亡风险为45%。
数据显示，在从血液中分离的肠球菌中，2%的粪肠球菌和60%的屎肠球菌分离菌对万古霉素具有耐药性。
万古霉素耐药肠球菌(VRE)对临床医生来说是一个挑战，因为这种抗生素传统上被认为是治疗肠球菌感染的“最后手段”，因为它经常被用来替代过敏患者的青霉素、氨苄西林和氨基糖苷类药物。
因此，人们开始评估新药作为万古霉素的替代候选药物，例如喹奴普丁和达福普汀、恶唑烷酮和达托霉素。
其他动物和环境中也存在耐药性肠球菌，并可能影响人体
在世界各地的食用动物和环境中都发现了其他抗生素耐药性肠球菌。事实上，从牛(80%)、鸡(62-64%)、猪(57%)、动物源性食品(如白肉和红肉)、未煮熟的食物(如生菜)、污水中分离出的肠球菌(粪肠球菌、屎肠球菌和鸡肠球菌)中观察到了较高的庆大霉素、卡那霉素、链霉素、四环素和糖肽耐药性。
肠球菌抗生素耐药性的主要机制
总体而言，在所有这些不同的宿主和环境中都出现了高抗生素耐药性，表明耐药基因在菌株间存在传播。
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细菌素
细菌素是核糖体合成的、细胞外释放的抗菌肽，对一些细菌物种有抑菌活性。
肠球菌能够产生具有抑菌活性的肠素
肠球菌产生的细菌素被称为“肠球菌素”，对其他肠球菌和菌群具有抑菌活性。肠球菌素分为四类：
(I类)羊毛硫抗生素肠素，如溶细胞素；
(II类)非羊毛硫抗生素肠素，有三个亚类，如肠素A(II-1类)、肠素Q(II-2类)和肠素B(II-3类)；
(III类)其次是环状肠素，如肠素AS-48；
(IV类)高分子量肠素，如肠溶素A。
注：大多数已知的肠素属于II类。
肠球菌产生的细菌素
doi:10.1099/mic.0.026385-0.
肠球菌素对李斯特菌、金黄色葡萄球菌等具有抑菌活性
E.faeciumRZSC5是一种天然奶酪分离物，具有抗李斯特菌特性。来自E.faecalisS-47的肠素EJ97也表现出抗李斯特菌特性，浓度为20AUml1时，6小时后细菌数量减少，24小时后完全抑制。
肠素AS-48(由E.faecalisA-48-32产生)可抑制罐装水果和蔬菜中冷藏和高温条件下凝结芽孢杆菌(Bacilluscoagulans)细胞的生长。细菌素对抗革兰氏阴性菌的活性并不常见，但来自E.mundtii的细菌素ST15已被证明可有效对抗一系列革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌，包括不动杆菌(Acinetobacter)、芽孢杆菌(Bacillus)、梭菌(Clostridium)、克雷伯氏菌(Klebsiella)、乳酸杆菌(Lactobacillus)和假单胞菌(Pseudomonas)。
肠球菌素如何发挥抑菌作用？
细菌素的杀菌作用被认为是由于细胞膜的通透性。细菌素的随机卷曲肽与细胞膜接触后形成螺旋结构，该结构融入并跨越膜，从而产生孔隙。这种作用方式已在肠素P中观察到。由此产生的孔隙导致K+离子泄漏、膜电位耗散和抑制氨基酸吸收。ATP驱动的细胞吸收K+和细菌素介导的K+释放的循环会导致细胞死亡，从而抑制一些菌种的定值。
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与其他菌的互作
屎肠球菌可以抑制李斯特菌、伤寒沙门氏菌等
屎肠球菌(Enterococcusfaecium)是一种在人体中广泛存在的细菌，它能够产生一种名为肠球菌素的抗菌物质，这种物质具有广谱抗菌活性，可以抑制如植物乳杆菌(Lactobacillusplantarum)、单核细胞增生李斯特菌(Listeriamonocytogenes)以及伤寒沙门氏菌(Salmonellaparatyphi)等细菌的生长。
除此之外，一些研究表明肠球菌还可以抑制Peptoclostridium的生长与活性。
注：肠球菌因为这一特性可作为生物防腐剂，它们通过抑制病原菌和降解菌的生长，确保了产品的质量和安全。与传统的化学防腐剂相比，肠球菌素等具有更佳的生物相容性和环境友好性。
抑制肠球菌的细菌
Blautiaproducta的共生菌株通过产生特定的抗菌化合物，可以抑制并排除粪肠球菌(E.faecium)。
此外，肠道中的枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)释放一种抑制性化合物，可以阳止金黄色葡萄球菌的定植能力，或抑制肠球菌(Enterococcusfaecalis)的毒力因子表达。
肠球菌（Enterococcus）是人类微生物群的天然组成部分。它们常定植于下消化道，口腔和生殖道中较少见。
★肠球菌是人体共生菌之一
人体肠道中约有106至107个肠球菌，结肠中发现的肠球菌高达1%，其中大多数是粪肠球菌(105-107CFU/克粪便)或屎肠球菌(104-105CFU/克粪便)。
除了粪肠球菌(E.faecalis)和屎肠球菌(E.faecium)外，还经常分离出盲肠肠球菌(E.cecorum)和坚忍肠球菌(E.durans)，偶尔也会检测到干酪肠球菌(E.caseliflavus)、海氏肠球菌(E.hirae)、鸡肠球菌(E.gallinaroum)和鸟肠球菌(E.avium)。
参与营养物质代谢、激活免疫细胞
由于肠球菌在人体微生物群中存在大量，这表明它们可能在消化道中发挥重要作用。作为共生菌，它们参与营养物质(碳水化合物、脂质和蛋白质)的代谢，以及维持其生存环境的pH值，合成对正常功能很重要的维生素和其他代谢物，防止腐败细菌的定植和扩散，并对人体免疫系统(体液免疫和细胞免疫)产生影响。
研究发现，粪肠球菌(E.faecalis)可以起免疫调节作用，负责激活CD4、CD8（CD分化簇）细胞和B淋巴细胞。
作为一种益生菌
一些肠球菌菌株(如屎肠球菌M74和屎肠球菌SF-68)已被证明可作为一种安全有效的益生菌制剂。例如FortiFlora和Cernivet(含屎肠球菌SF68)和含粪肠球菌的Symbioflor1。
缓解肠易激综合征和抗生素引起的腹泻
肠球菌益生菌可用于治疗或预防某些人类疾病，特别是在治疗腹泻方面。研究发现屎肠球菌(E.faeciumstrainSF68)可以缓解肠易激综合征症状和接受抗生素治疗的慢性肺结核患者的腹泻发病率，并预防了粘膜炎(可能是维生素缺乏的后果)。
减少鼻窦炎患者的复发
一项双盲、安慰剂对照研究调查了157名患有慢性复发性鼻窦炎的患者在使用细菌免疫刺激剂(由人粪肠球菌细菌的细胞和自溶物组成)治疗期间急性复发的发生情况，并与使用安慰剂的患者进行了比较。结果表明，在使用粪肠球菌制成的免疫刺激剂后，复发的发生率(50次)约为安慰剂下观察到的复发次数(90次)的一半。
目前，粪肠球菌的益生菌制剂(有时富含大肠杆菌和乳杆菌)被推荐用于治疗鼻窦炎或支气管炎以及普通感冒等疾病。
注：在德国，粪肠球菌(DSM16431)以Symbioflor1的商品名作为药物出售，推荐用于治疗急性和复发性鼻窦炎或支气管炎。
一些菌种能产生丁酸，具有抗炎作用
已发现E.duransM4-5能产生丁酸、短链脂肪酸(SCFA)，其可诱导显著的抗炎作用并有助于肠道上皮的完整性。
降低胆固醇水平
研究发现肠球菌(例如E.faeciumM-74、E.duransKLDS)还具有降低胆固醇水平的特点。这些细菌产生一种水解酶，可催化胆汁酸解离过程，帮助胆固醇整合到细菌细胞壁中，或在酸性环境中帮助沉淀。
抗癌、免疫调节作用
此外，一些肠球菌还表现出抗诱变、抗致癌和免疫调节作用。
益生菌E.faeciumM-74可用于治疗患有髓性白血病患者的胃肠道并发症。在小鼠模型中发表的另一份报告表明，海氏肠球菌(Enterococcushirae)有助于形成抗癌免疫反应。
在食品中的益处
改善发酵乳制品的质地和口感
肠球菌菌株可以将蛋白质降解为肽和氨基酸，分解柠檬酸盐，并产生具有脂解和蛋白水解特性的芳香物质。它们具有蛋白水解、脂解以及柠檬酸和丙酮酸代谢的能力，因此被用作乳制品的发酵剂。
一种天然的食品防腐剂
此外，肠杆菌通过产生肠素来抑制腐败微生物的增殖，这些细菌素可用作食品防腐剂。
由于它们对热处理(烹饪、巴氏灭菌或发酵)具有耐受性，因此它们也可用作食品生产中的天然防腐剂和卫生指标。
在养殖业中的作用
益生菌制剂也用于养殖业，以预防或治疗肠道疾病，或作为生长促进剂。
免疫调节作用、防止腹泻
例如，一些肠球菌益生菌被纳入饲料添加剂类别，用于稳定单胃动物和反刍动物消化道的微生物群落。屎肠球菌NCIMB11181和屎肠球菌DSM7134菌株已获批准作为牛和猪的饲料添加剂。益生菌屎肠球菌SF68和粪肠球菌Symbioflor1也用于预防或治疗猪、家禽、牲畜和宠物的腹泻。屎肠球菌SF68对幼犬肠粘膜和消化系统发育具有免疫调节作用。
促进生长、提高代谢效率
此外，肠球菌对动物的生长和健康特征具有积极影响。用肠球菌益生菌属喂养猪，发现能减少肠道病原体。同样，给断奶后小猪口服屎肠球菌NHRDIHARA可提高血清和粪便中的IgA水平，改善小猪的生长。研究还表明，屎肠球菌能促进鸡的生长、肠道形态和盲肠微生物群的稳态。据报道，屎肠球菌还能提高肉鸡的代谢效率，降低炎症反应。
抑制水生病原体，改善鱼类生长
另一方面，许多研究表明肠球菌在水产养殖中具有有益作用。一些研究报道了屎肠球菌对水生病原体具有广泛的抑制作用，包括Yersiniaruckeri、哈维氏弧菌(Vibrioharveyi)、无乳链球菌(Streptococcusagalactiae)和维氏气单胞菌(Aeromonasveronii)。
此外，许多试验发现了将屎肠球菌添加到饲料中以改善鱼类生长和刺激免疫反应的功效。
肠球菌属(Enterococcus)普遍存在于人类及动物肠道内。正常情况下，肠球菌被认为是一种无害的共生菌，甚至被认为对许多胃肠道和全身疾病有积极作用。
然而，当与宿主的共生关系被破坏时，肠球菌可引起一些感染或疾病。目前，肠球菌是革兰阳性菌中仅次于葡萄球菌属的重要医院感染病原菌，其感染最常见的为尿路感染，其次为腹部和盆腔等部位创伤和术后感染、败血症、心内膜炎和脑膜炎。此外由于其具有耐药性，所致感染治疗困难。
注：目前几乎所有的院内肠球菌感染都是由粪肠球菌或屎肠球菌引起的。其中，粪肠球菌是致病性最强的菌种，但屎肠球菌的重要性日益增加，因为它通常对抗菌药物的耐药性更强。
肠球菌血流感染
肠球菌血流感染的死亡风险很高
在瑞士，2008年至2014年间肠球菌血流感染发病率有所增加（每100000人9至14例），总体而言，院内肠球菌BSI的死亡率相当高，为25%至50%。
大多数肠球菌性血流感染病例被认为是肠球菌从肠道易位到血液所致。其他感染途径包括静脉注射、心内膜炎、尿路感染和脓肿。
肠球菌血流感染的死亡危险因素包括病情严重程度、患者年龄以及使用第三代头孢菌素或甲硝唑。
研究发现，感染溶血性、庆大霉素耐药粪肠球菌菌株的患者与感染非溶血性、庆大霉素敏感菌株的患者相比，三周内死亡风险增加5倍。
尿路感染
肠球菌是从尿路感染中分离出的最常见的革兰氏阳性菌，2011年至2014年期间，国家医疗保健安全网络报告了超过20000例病例。在这些病例中，超过50%是由粪肠球菌引起的，其次是“其他肠球菌种”(约30%)和屎肠球菌(约20%)。
最令人担忧的是，约85%的屎肠球菌分离株对万古霉素具有耐药性，并且耐药分离株的比例每年都在增加。
心内膜炎
在肠球菌引起的感染中，感染性心内膜炎(IE)是治疗难度最大的感染之一。肠球菌占所有IE病例的10%至20%，其中大多数是由粪肠球菌引起的。
在感染性心内膜炎中，细菌在心内膜定植会导致组织内出现赘生物，并在细菌周围形成生物膜状基质，免疫系统或抗生素都难以穿透这些基质。
根管治疗失败
粪肠球菌(E.faecalis)是根管治疗失败的一个重要原因，部分原因是它对许多消毒剂和抗菌剂具有耐药性。
根管治疗常用的消毒剂无法完全杀灭粪肠球菌
在导致根管治疗失败的慢性和持续性根尖周围病变病例中尤其如此，24%~77%的病例中分离出粪肠球菌。氢氧化钙是根管治疗常用的消毒剂，已证实其本身无法完全杀死粪肠球菌，其他消毒剂如柠檬酸也是如此。
组织挫伤
肠球菌感染在宿主体内引发病理变化。这可能由宿主的炎症反应，或是粪肠球菌分泌的毒素、蛋白酶及有毒代谢副产物直接造成的组织损伤引起。
肠球菌脂磷壁酸具有炎症性
肠球菌脂磷壁酸(LTA)与多种生物过程有关，LTA的一些特性包括调节宿主的免疫反应和介导肠球菌粘附于宿主细胞。
研究发现肠球菌的LTA与革兰氏阴性菌的脂多糖一样具有炎症性。肠球菌结合物质(EBS)(至少部分源自LTA)缺陷且蛋白质粘附素AS缺陷的粪肠球菌菌株在注射到兔子体内会诱发临床疾病症状。
肠球菌溶细胞素和蛋白酶对细胞具有一定毒性
肠球菌溶细胞素和两种蛋白酶（一种是锌金属蛋白酶（明胶酶）、一种是丝氨酸蛋白酶）是会导致疾病严重程度的分泌因子。溶细胞素的存在还被证实会促进粪肠球菌在血液中的出现。
这种毒素它既具有细菌素活性，又会对多种哺乳动物细胞类型有毒性。
使用兔眼内炎模型获得了由细胞溶素引起的病理损伤最直接和定量的证据。感染后24小时β波反应减弱和视网膜结构完全破坏明确证明了细胞溶素在组织病理学中的作用。
在无菌大鼠模型中，一种蛋白水解(Gel+)菌株表现出致龋活性，而三种非蛋白水解菌株几乎没有致龋性。
产生过量的过氧化氢造成细胞损伤
除了分泌蛋白外，粪肠球菌和屎肠球菌还被证明会产生有毒的氧代谢物，从而导致细胞或器官损伤。
食源性肠球菌的危害
肠球菌的威胁不仅存在于临床感染。由于卫生条件差造成的污染导致食品中存在肠球菌也具有一定危害。粪肠球菌或屎肠球菌是造成手工和传统奶酪污染的最常见原因，但也发现了其他菌种(E.casseliflavus、E.durans、E.hirae和E.gallinarum）。
例如，从散装牛奶储罐中分离出E.casseliflavus和粪肠球菌。禽肉在加工过程中也可能被粪肠球菌和屎肠球菌污染，这种情况很常见。
对抗生素的耐药性会通过被肠球菌污染的食物传播
抗菌药物的广泛使用促进了耐药微生物的出现和传播。食物链是耐药性在环境和人类之间传播的关键因素。
人们发现临床材料和食物之间的细菌耐药性特征相似。最常见的是，这些细菌菌株对链霉素、红霉素、四环素和利福平表现出耐药性。
从即食食品中分离的肠球菌菌株中检测到氨基糖苷类、四环素类和大环内酯类药物的耐药基因水平转移。
研究显示，携带耐药基因的食源性肠球菌数量众多可能会显著降低抗生素治疗肠道感染的有效性。由于其高度适应能力，食物中的肠球菌会暂时或永久地定植于消化道，这增加了基因转移至肠道菌群的危险。
肠球菌会导致食物腐败
肠球菌也会导致食物腐败。它们会产生酪胺、组胺、苯乙丙氨酸、尸胺和腐胺等热稳定性胺，这些胺可引起过敏反应或中毒。
肠球菌在其他疾病中的丰度变化
移植物抗宿主病
一些细菌如肠球菌(Enterococcusspp.)与移植物抗宿主病(GVHD)高风险有关。
心力衰竭和房颤患者中丰度增加
与对照相比，心力衰竭患者肠道菌群中的肠球菌属(Enterococcus)丰度增加，在心脏病变患者中也观察到肠球菌属和肠球科的升高。
较多的基因和属种表明房颤患者体内可能存在多种有害细菌过度生长。瘤胃球菌(Ruminococcus)、链球菌(Streptococcus)、韦荣氏球菌(Veillonella)和肠球菌(Enterococcus)等在房颤患者中更为富集。
肥胖和炎症性肠病中肠球菌数量增加
肥胖是一种慢性代谢性疾病，引起肥胖的因素众多，如遗传因素、环境变化、生活和饮食习惯等，其中肠道微生物群的影响越来越受到人们的重视。
在属的水平上，分枝杆菌属、粪杆菌属、拟杆菌属、副拟杆菌属、粪杆菌属、毛螺菌属等显著减少，而梭菌属、芽孢杆菌属、布劳氏菌属、肠球菌属(Enterococcus)、萨特氏菌属、克雷伯氏菌属、柯林氏菌属、普雷沃氏菌属和乳酸杆菌属显著增加。
而在活跃期炎症性肠病与某些菌群的数量过多有关，如:
肠杆菌科(Enterobacteriaceae)↑↑↑
梭杆菌属(Fusobacterium)↑↑↑
咽峡炎链球菌(Streptococcusanginosus)↑↑↑
肠球菌(Enterococcus)↑↑↑
可能存在一定的致癌作用
肠道微生物群中的几种菌，这些细菌除了它们的致病性之外，还被可能对结肠直肠癌具有致癌作用，包括幽门螺杆菌、肝螺杆菌(Helicobacterhepaticus)、牛链球菌(Streptococcusbovis)、大肠杆菌、脆弱拟杆菌(B.fragiis)、败血梭菌(Clostnidiumsepticum)、粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)、具核梭杆菌(F.nucleatum)和牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonasgingivalis)，这些细菌都显示出潜在的致癌作用。
此外，肝外胆管癌患者体内也检测到大量肠球菌(Enterococcus)。
百岁老人肠球菌属含量较低
研究发现，与100岁以下人群相比，百岁老人体内肠道细菌（如拟杆菌属、脱硫弧菌属、瘤胃球菌科、乳杆菌、嗜粘蛋白阿克曼氏菌、发酵短杆菌属）含量较高，而Faecalibacter、普雷沃氏菌属、克雷伯氏菌属、链球菌属、肠杆菌属、肠球菌属含量较低。因此，我们推测肠球菌的丰度过高可能不利于健康。
肠球菌属(Enterococcus)是一种革兰氏阳性、兼性厌氧球菌，广泛存在于胃肠道中，在阴道或口腔中较少见。粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)和屎肠球菌(EnterococcusFaecium)是人类中最常见的菌种。作为共生菌，肠球菌定植于消化系统中并参与营养物质代谢及调节人类的免疫系统。
肠球菌还因其生物特性(酶和蛋白水解活性)而被用作食品发酵的发酵剂，或因其产生的抗菌细菌素(称为肠素)而被用作天然的食品生物防腐剂。一些特殊的肠球菌株还被用作益生菌，具有不同有益特性：如刺激免疫力、抗炎活性、降胆固醇作用以及预防/治疗肠易激综合征和抗生素引起的腹泻，减少鼻窦炎患者的复发等。
然而，就像一枚硬币的两面，尽管它们具有促进健康的特性，但它们可能具有有害特性。由于肠球菌菌株表现出复杂的毒力机制，使其能够在各种宿主组织中定植，并对许多抗生素具有耐药性，可能会导致耐药性的传播，肠球菌也被视为机会性病原体。
需要更深入地了解具体肠球菌种的健康益处、毒力特性，尤其是抗生素耐药性的增加，以便充分认识到肠球菌在改善健康和致病方面的复杂性。
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牛奶蛋白过敏（CMPA）是婴儿最常见的食物过敏类型之一。粪便病原菌培养显示产气荚膜梭菌阳性率超过30%，明显高于其他细菌。因此推测产气荚膜梭菌定植可能是婴儿牛奶蛋白过敏的发病因素之一。
这项研究表明产气荚膜梭菌肠道定植在婴儿中很常见，与婴儿牛奶蛋白过敏和食物过敏的发生有关。
产气荚膜梭菌是一种厌氧、革兰氏阳性芽孢杆菌，是一种可引起胃肠道或皮肤和深层组织感染的细菌。产气荚膜梭菌的定植可能导致侵袭性胃肠道感染，产生肠毒素，可能破坏肠上皮细胞间的紧密连接，造成上皮损伤，引起肠道菌群失衡，导致宿主免疫反应异常。
在这项广州妇女儿童医疗中心的研究中，共招募了358名0-6个月的婴儿。对这些婴儿粪便样本进行病原培养，其中128名产气荚膜梭菌呈阳性。
共有270名婴儿（44.07%为女孩；平均年龄为2.78±2.84个月）参加了为期12个月的跟踪调查。
注：
2020年1月1日至2021年12月31日期间因胃肠道症状住院或门诊的所有0-6个月大的婴儿
排除先天性代谢性疾病、免疫缺陷性疾病和恶性肿瘤的患者
doi:10.1186/s13099-023-00572-x
病程差异
产气荚膜梭菌阴性组与产气荚膜梭菌阳性组显著差异（P<0.001）。
喂养方式
纯母乳喂养组、母乳添加配方奶喂养组和纯配方奶喂养组产气荚膜梭菌定植阳性率分别为32.14%、46.43%、21.43%(P<0.05)（下表）。
主要症状及诊断
主要症状是腹胀、腹泻和粘液便和/或血便。
有或没有产气荚膜梭菌定植的婴儿，腹胀和粘液样便和/或血便的发生率存在显著差异(P<0.05)。
与产气荚膜梭菌阴性组相比，阳性组NEC（坏死性小肠结肠炎）和FPIAP（食物蛋白诱发的过敏性直肠结肠炎）发生率显著升高（下表）。
抗生素
甲硝唑给药率：产气荚膜梭菌阳性组高于阴性组（33.9%vs.10.76%）（P<0.0001）。
血常规检查（231名患者）
两组之间白细胞增多、血小板增多和中性粒细胞减少事件的数量存在显著差异。
粪便常规检查（267次）
粪便潜血阳性率为37.45%（100/267），
粪便白细胞阳性率为8.2%（22/267）。
两组比较差异有显著性（P<0.001）（下表）。
产气荚膜梭菌携带潜在特异性毒素基因的出现率如下：
没有携带其他毒素的分离株。
对83份样本进行基因型鉴定，其中：
17例患者中同时检测到A基因型和C基因型。
经过12个月的随访调查，根据症状、饮食排除和口服食物挑战，临床诊断如下：
24.44%的病例(66/270)食物过敏，其中18.5%的儿童(50/270)患有牛奶蛋白过敏。
在产气荚膜梭菌阳性组队列中：
这两个比例都显著高于产气荚膜梭菌阴性组[分别为7.59%(12/158)和5.06%(8/158)](P<0.0001)
(下图）。
共有8.52%（23/270）的儿童被诊断为过敏性疾病，其中：
产气荚膜梭菌阳性组氨基酸配方奶粉/深度水解配方奶粉利用率为35.71%，高于阴性组9.49%（P<0.0001）。两组中喂养氨基酸配方奶粉和/或深度水解配方奶粉超过12个月的儿童人数分别为16.07%和3.79%（P=0.0005）
这项真实世界研究结果首次表明，产气荚膜梭菌在有胃肠道症状的中国婴儿中定植率很高，并且与食物过敏和牛奶蛋白过敏的发生有关。
产气荚膜梭菌广泛存在于健康人和动物的胃肠道中。
本研究显示，有胃肠道症状的婴儿中有33.52%有产气荚膜梭菌定植，新生儿和1~6月龄婴儿产气荚膜梭菌阳性率分别为30.25%和45.88%。不同的定植率可能是由于不同的患者群体、分娩方式、喂养方法和胃肠道疾病状况所致。
研究重点是产气荚膜梭菌感染及其产生一系列致命毒素（七种主要毒素型A-G）和酶（例如卵磷脂酶、纤维蛋白酶、透明质酸酶、胶原酶和DNA酶）的能力，这些酶有助于其侵袭性。
目前还没有关于产气荚膜梭菌定植是否影响儿童食物过敏发生的报道。在112名确诊产气荚膜梭菌定植婴儿队列中，其中48.21%出现食物过敏，37.5%出现牛奶蛋白过敏，这两种患病率均显著高于产气荚膜梭菌阴性组（7.59%和5.06%），并且显著高于一般儿科人群中报告的水平。
研究表明，产气荚膜梭菌肠毒素（CPE）在促进紧密连接分解和诱导上皮损伤方面发挥着关键作用，从而导致微生物群变化并触发宿主免疫反应。免疫细胞群的变化很大程度上是由环境和微生物抗原驱动的。
关于产气荚膜梭菌定植与食物过敏的研究很少，但结果并不一致。有报道，过敏婴儿的拟杆菌和/或克雷伯氏菌定植率较高，而产气荚膜梭菌/丁酸梭菌定植率较低。
总之，研究人员推测产气荚膜梭菌定植会因其肠毒素而引起侵袭性胃肠道感染，导致紧密连接分解、上皮损伤、微生物群变化、宿主免疫反应异常，并最终导致食物过敏。
需要进一步的研究来阐明产气荚膜梭菌定植的婴儿发生食物过敏的潜在免疫学和分子机制。
总的来说，产气荚膜梭菌定植为婴儿牛奶蛋白过敏和食物过敏提供了一个思路，应用肠道菌群检测可以帮助识别食物过敏的风险，从而采取相应的预防措施。此外，对于产气荚膜梭菌定植的抵抗力、空间和特定营养物质的竞争或毒素功能的研究，也能为进一步探索肠道菌群与过敏关系及预防和治疗提供了新的视角。通过深入研究肠道菌群的变化及其与过敏疾病的关联，这可能涉及有效的药理学抑制剂/化合物的合理设计，调节补充剂/益生菌等各种方式对肠道菌群加以改善，有望为未来开发更加个性化的过敏预防和治疗策略提供重要参考。
这里我们来系统地了解一下产气荚膜梭菌。
产气荚膜梭菌是一种革兰氏阳性，产毒厌氧细菌，有荚膜、非运动、无鞭毛，属于梭菌属，是人类和动物肠道固有的机会病原体。
芽胞形成能力强，可在不利环境下存活
这些特征有利于其在不同的环境生态位中生存，包括土壤、粪便、污水、食物以及人类和动物的肠道。
这种“生存能力”意味着产气荚膜梭菌与许多感染和疾病有关，包括食源性细菌性疾病等。
具有多种水解酶
可分解蛋白质、脂肪等营养物质，为自身生长提供营养。
产气荚膜梭菌产生大量胞外降解酶，例如蛋白酶（例如梭菌蛋白酶）、透明质酸酶（mu毒素）、胶原酶和糖苷内切酶。
内切-N-乙酰半乳糖酰胺酶EngCP，在A型菌株引起的气性坏疽期间很重要，而两种锌金属蛋白酶则导致G型菌株引起的禽坏死性肠炎。
最广为人知的产气荚膜梭菌降解酶是神经氨酸酶，它从宿主细胞表面或粘液中的各种唾液酸糖结合物上产生游离的神经氨酸。产生三种神经氨酸酶，分别为NanJ、NanI、NanH。
产生多种细胞外毒素
A型和C型毒素被认为会引起人类疾病。
男性的发病率略高(65%)，大多数病例发生在20-49岁人群中。
C型毒素与1944年-1949年在德国战后出现的地方性坏死性肠炎，以及在巴布亚新几内亚高地出现的猪痢有关。严重营养不良会增加对C型感染的易感性。
CPE基因，在孢子形成后细胞裂解时产生肠毒素CPE，可能会导致胃肠炎。
产气荚膜梭菌主要毒素的结构域示意图
doi.org/10.1080/22221751.2024.2341968
(A)CPA毒素：CPA毒素与GM1a相互作用，水解磷脂酰胆碱（PC）和鞘磷脂（SM），导致二酰甘油（DAG）和神经酰胺（CER）的形成，并激活原肌球蛋白激酶A受体（TrKA），并触发细胞内信号级联与IL-8释放。磷脂酰肌醇3(IP3)的激活促进细胞质内钙(Ca+)进入。
(B)CPB毒素：CPB与血小板内皮细胞粘附分子1(PECAM-1)结合，随后释放三磷酸腺苷(ATP)并形成允许离子交换进出细胞的孔。
(C)ETX毒素：ETX毒素与蛋白质“髓磷脂和淋巴细胞”(MAL)相互作用，形成活性孔，诱导离子跨细胞膜运输和交换。
(D)ITX毒素：Ib与脂解刺激脂蛋白受体（LSR）受体的结合介导其进入宿主细胞，通过内吞作用促进Ia进入通道的形成，随后肌动蛋白丝解聚，产生形态变化和改变细胞通透性。
(E)CPE毒素：CPE毒素与紧密连接蛋白受体结合，通过离子交换和渗透失衡促进细胞表面孔的形成。
有研究培养从333名婴儿的粪便样本中分离出的产气荚膜梭菌，其中29.4%的婴儿在出院前已被产气荚膜梭菌定植。
产气荚膜梭菌在母乳中生长不良，说明母乳喂养在早产新生儿护理中的重要性。
长期使用抗生素或持续气道正压通气（CPAP）氧气治疗会在早产儿肠道中为产气荚膜梭菌创造一个不利的环境，从而降低携带的可能性。
产气荚膜梭菌分离物在营养丰富的培养基或母乳中生长，可以作为单一培养物，也可以与婴儿双歧杆菌共培养，婴儿双歧杆菌被选为代表典型的竞争性肠道物种。
食源性疾病
产气荚膜梭菌是食源性疾病（食物中毒）的常见原因，产生肠毒素导致急性胃肠炎。食源性产气荚膜梭菌会导致：腹泻、腹部绞痛、胀气和腹胀。
通常，人们在摄入细菌及其孢子后，当微生物在肠道中形成孢子时，就会形成毒素，通常在6-24小时内就会出现症状。腹泻突然发生，但通常症状会在24-48小时内消失。
非食源性胃肠道感染
这种类型的感染通常归因于抗生素的使用。但有些人即使不服用抗生素，也会因产气荚膜梭菌而出现偶发性胃肠道症状。免疫系统较弱的人患此类疾病的风险最大。
非食源性产气荚膜梭菌胃肠道感染导致：
这种类型的产气荚膜梭菌感染通常发生在最近服用过抗生素的60岁以上成年人中。症状与食源性梭菌感染相似，但持续三天到几周不等。
这种类型的梭菌感染可导致严重脱水（体内水分流失）。然而，人们通常会康复。
一项研究表明，与健康个体[5%]相比，IBD成年患者[19-27%]产气荚膜梭菌的患病率更高，这表明与IBD存在潜在关联。
产气荚膜梭菌具有大量HMO消化所需的糖苷水解酶，表明它具有婴儿肠道机会性定植的可能性，从而导致临床疾病。
皮肤和深层组织感染
产气荚膜梭菌与严重外伤后可能发生的严重皮肤和深层组织感染（气性坏疽）有关。
从受污染的伤口（例如复合性骨折、产后子宫）开始，感染会在1-3天内扩散。
皮肤或深层组织产气荚膜梭菌感染（气性坏疽）会导致：
有时，感染仅导致厌氧性筋膜炎或蜂窝织炎。
其他感染
如乳腺炎、子宫内膜炎等。
促进定植
定植能力，即体内持续和增殖/存活的能力，是一些产气荚膜梭菌感染（例如F型菌株非食源性人类胃肠道疾病）的重要特征，产气荚膜梭菌定植通常涉及生长/生存和粘附所需的营养获取。例如，F型非食源性胃肠道疾病即使在腹泻时也能持续长达数周，这表明肠道粘附和营养获取对于这些F型菌株在腹泻时稳定定植于肠道是必需的。
肠道粘附
NanI的蛋白酶激活可能进一步促进产气荚膜梭菌菌株引起的定植。
增加营养物质的获取
可能涉及几种潜在的机制：
NanI可能通过修饰肠细胞表面来促进产气荚膜梭菌粘附，从而允许暴露用于结合的未知受体，和/或减少该表面上唾液酸的负电荷。
大批量烹制并在不安全温度下保存的食物，通常会导致产气荚膜梭菌食物中毒的爆发。通常与产气荚膜梭菌食物中毒有关的特定食物包括：
产气荚膜梭菌食物中毒的爆发往往发生在为大量人群提供服务并且将食物保持在适当温度可能很困难的环境中，例如医院、学校食堂、监狱、疗养院和提供餐饮的大型活动。
组织感染
食物中毒
将食物煮至安全的内部温度杀死细菌。使用食物温度计进行检查，尤其是整只家禽和大块烤肉。
如果煮熟的食物不尽快食用，请将其保持在60℃或更高温度或4℃或更低温度。
烹饪食物或将其从保持安全内部温度的器具中取出后2小时内，将剩菜冷藏在4℃或更低的温度下。如果食物暴露在32℃以上的温度下（例如炎热的汽车或野餐），请在1小时内冷藏。
热食可以直接放入冰箱。
将大锅食物（例如汤和炖菜）和大块肉类（例如烤肉）分成小份，以帮助其在冰箱中快速冷却。
食用前将剩菜重新加热至74℃或更高温度。
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腹泻是常见的健康问题，相信绝大多数人在生活中都曾遭受过腹泻的困扰。
全球对所有腹泻原因中特定类型细菌性腹泻患病率的估计包括大肠杆菌10%-25%、志贺氏菌10%、沙门氏菌3%、弯曲杆菌3%-6%。
我国是15个腹泻高发国家之一。十年纵向监测研究显示，主要病毒病原体来自A型轮状病毒和诺如病毒，主要的细菌病原体来自腹泻性大肠杆菌、非伤寒沙门氏菌。
腹泻的种类多、原因复杂，有病原体感染引起的急性腹泻，也有胃肠道疾病、神经系统疾病、食物过敏等伴随的慢性腹泻。
在腹泻期间肠道环境的短暂氧化，专性厌氧肠道菌群急剧消失，肠道菌群可能出现短暂失调。实际上，每次腹泻对肠道引起的波动不容小觑，人体内的肠道菌群相当于“历了个劫”。
DOI:10.1016/bs.pmbts.2022.08.002
实际上如果不引起重视没有及时干预，或者说身体免疫系统没有将病原体彻底清除，一些病原体残留在体内，可能引起多次腹泻，反复多次后可能逐渐形成慢性腹泻，甚至悄悄延伸到其他慢性疾病。
我们也有时候会看到这样的现象：
腹泻一般会出现以下症状：
可能还会伴随着：
腹泻可能引起脱水，如果不及时治疗，有可能危及生命。脱水对儿童、老年人和免疫系统功能低下者来说尤其危险。
成人脱水症状：
婴幼儿脱水症状：
★感染
感染可能是由于食用了被某种致病菌污染的食物，或饮用受污染的水，其中可能含有细菌、寄生虫等。
常见的感染有：细菌、病毒、真菌、寄生虫等。
★旅行者腹泻
部分地方可能很难将废水和污水与烹饪、饮用和洗澡的水分开，就比较容易出现腹泻。
★药物
许多药物都可能引起腹泻，包括抗生素、抗酸剂（含镁）、口服糖尿病药物、抗癌药物、降胆固醇药、秋水仙碱等。
★食物问题
食物过敏：对牛奶、大豆、谷物、鸡蛋、海鲜等食物过敏可能会导致慢性腹泻。
乳糖不耐受：很多人有这个问题。乳糖是存在于奶类和其他乳制品中的一种糖。有乳糖消化障碍的人在食用奶制品后会出现腹泻。
有些人小时候喝牛奶没事，长大后慢慢出现腹泻的情况了。由于人体内帮助消化代谢乳糖的酶会随着年龄的增长有所减少，乳糖不耐受症的情况也会随着年龄的增长而增多。
其他比如说果糖，天然存在于水果和蜂蜜中，有时，也作为甜味剂添加到一些饮料中。对于有果糖消化障碍的人来说，果糖可引起腹泻。
有些人可能吃含糖、辛辣、高脂肪或油炸食品，也会腹泻。食物中成分刺激胃黏膜和肠道，引起胃肠道炎症和蠕动加快，从而导致腹泻。
★慢性疾病
★手术
肠道微生物可改善围手术期和术后康复效果
★营养不良
腹泻是五岁以下儿童营养不良的主要原因。每一次腹泻都会使他们的营养不良更加严重。
对于大多数感染来说，营养不良和腹泻之间的相互作用是双向的。也就是说，营养状态改变宿主对感染的反应，营养不良会导致对肠道病原体的抵抗力下降，增加腹泻的风险；而反复腹泻则会改变营养状态。当感染频繁时，尤其是复发性腹泻病，宿主营养状况也在相应变化且逐渐恶化，导致营养不良，免疫力下降，发育矮小。
发育迟缓/营养不良不容忽视，问题很有可能在肠道
急性腹泻
持续一到两天的稀稀水样腹泻。这是最常见的类型，通常无需治疗，在几天内自行消失。
大多数急性腹泻病例都有感染性病因。
急性腹泻有没有可能发展为其他疾病？
急性感染性腹泻会导致原有的肠道微生态失调恶化，如果这种情况发生在儿童身上，从长远来看，粘膜免疫系统的发育和成熟以及肠道屏障的完整性可能会受到影响，使儿童更有可能因肠漏而患上自身免疫性疾病。（我们在后面会详细讲到）。
持续性腹泻
持续约两到四个星期的腹泻。
慢性腹泻
全球每年有17亿儿童腹泻病例，腹泻是五岁以下儿童死亡的第二大原因，每年约有52.5万儿童死亡。
慢性腹泻影响全世界3%-20%的成年人。
美国细菌性腹泻约占所有腹泻的31%。导致食源性腹泻的细菌病原体比例为：沙门氏菌15.4%，弯曲杆菌11.8%，志贺菌4.6%，产志贺毒素的大肠杆菌（STEC）约3%。
我国是15个腹泻高发国家之一。以下是一项对我国长达十年（2009-2018年）的纵向监测研究。
在患者中检测到的两种主要病毒病原体：
其次是腺病毒和星状病毒。
两种主要的细菌病原体：
其次是志贺氏菌和副溶血性弧菌。
年龄对病原体检测的影响：
以上我们了解了关于腹泻的一些基本信息，腹泻作为一种常见的消化系统症状，与肠道微生物群的平衡之间有什么关联呢？下一章节我们详细了解一下。
这里我们从两个方面来了解：
■气单胞菌属（Aeromonas）
气单胞菌属细菌更常见于海鲜、肉类，有时也存在于蔬菜中。症状往往在食用受污染食品后不久出现，可以持续几天到2周。除了腹泻，一般没有腹痛，呕吐和发烧可能存在，也可能不存在。
■蜡样芽孢杆菌（Bacilluscereus）
■弯曲菌属（Campylobacter）
弯曲菌常见于乳制品、不同肉类和家禽中。潜伏期为2至4天，之后出现症状。整个病程在5至7天之间。呕吐通常不会发生。不过，腹泻时伴有发热、腹痛。
■梭菌属（Clostridium）
艰难梭菌感染的潜伏期是可变的。艰难梭菌引起的腹泻症状通常在用抗生素后5-10天开始，但也可能在第一天或长达2个月后出现；艰难梭菌的病程也有很大差异。
艰难梭菌轻中度感染症状：
严重感染时通常会脱水，需要住院治疗。
（关于艰难梭菌感染我们在后面还会详细讲）
产气荚膜梭菌感染的潜伏期通常不超过1天，可以短至几个小时，病程大概仅持续约1天。呕吐一般较轻，通常不发烧，但腹泻时确实会出现腹痛。
■大肠杆菌（E.coli）
虽然我们说大肠杆菌自然存在于人类的肠道中，但一些菌株可能会导致严重的疾病。
不同的腹泻大肠杆菌菌株表现出不同的流行病学，并分为肠致病性大肠杆菌（EPEC，婴儿腹泻的主要原因）、肠出血性大肠杆菌，根据病理类型、定植部位、毒力机制和临床症状，可分为肠毒素性大肠杆菌（ETEC，旅行者腹泻和婴儿腹泻的主要原因）和肠侵袭性大肠杆菌。
通常不呕吐，可能发烧，也可能不发烧，但腹痛伴有腹泻。产肠毒素大肠杆菌的潜伏期为1至3天，疾病持续约3至5天。低烧伴呕吐、腹痛、腹泻。
■李斯特菌属（Listeria）
李斯特菌属细菌常见于牛奶和乳制品中。潜伏期约1天，期间无症状。这种疾病往往会持续3天左右。有些人确实会呕吐，但通常并不常见。出现发烧，腹痛可能也可能不会与腹泻同时发生。
■邻单胞菌属（Plesiomonas）
■沙门氏菌属（Salmonella）
沙门氏菌是一种革兰氏阴性兼性厌氧细菌，存在于许多不同的食品中，包括乳制品、鸡蛋、肉类、豆芽、黄瓜等。潜伏期可以是几小时到3天。这种被称为沙门氏菌病的疾病可以持续约2至7天。除了腹泻（水样腹泻），还有呕吐、发烧、腹痛、胃痉挛。粪便颜色可能出现绿色。
大多数沙门氏菌引起的腹泻患者可以完全康复。一些沙门氏菌感染者在感染结束后会出现关节疼痛，称为反应性关节炎。一些患有反应性关节炎的人在排尿时会出现眼睛刺激和疼痛。
■志贺氏菌属（Shigella）
志贺氏菌一般分四类：
志贺菌属引起志贺菌病，这是常见的细菌性痢疾类型之一。痢疾志贺氏菌产生志贺毒素，引起细菌性痢疾。宋内氏志贺氏菌毒性不如其他志贺氏菌，但容易暴发和流行。
如果由患病且不保持良好卫生的人处理，任何食品中都会发现这种病毒。用受污染的水烹制的生鲜食品或用受污水污染的水灌溉的蔬菜也可能是一个问题。
潜伏期最长可达2天。志贺菌病通常持续2至7天。表现为高烧、腹痛伴腹泻，即使肠子空了也感觉还需要排便。呕吐通常不会发生。5岁以下的儿童最容易患志贺氏菌病，但所有年龄段的人都可能患上这种疾病。志贺氏菌感染中约有5%具有广泛耐药性。
志贺氏菌等感染后伴随发烧症状，可能是一些人群的肠道屏障薄弱，致病菌就容易进入到血液，引起发烧。大多数志贺氏菌感染是自限性的。
■葡萄球菌属（Staphylococcus）
■弧菌属（Vibrio）
弧菌属细菌通常存在于牡蛎等海鲜中。较为知名的弧菌种类是霍乱弧菌，它是霍乱的病因。它通常通过受污染的水传播。弧菌感染的潜伏期非常短，最多1天左右。这种病最长可以持续5年。
■小肠结肠炎耶尔森菌（Yersiniaenterocolitica）
小肠结肠炎耶尔森菌通过未充分煮熟的猪肉传播给人类。它也可能通过受污染的水传播。潜伏期可以持续数小时到6天不等。这种疾病最短可持续1天，最长可达45天。通常症状包括发烧、呕吐、腹痛伴腹泻。
谷禾长期的肠道菌群检测实践发现，很多的健康人或者是说非腹泻人群的肠道菌群检测报告中，也可能会携带以上这些菌群，这是为什么呢？
有些致病菌可能是一过性的，最近旅行，或者吃的不干净的食物中把这些菌带进去了，但是它在健康的肠道中没有定植成功，又从粪便排出体外，因此肠道菌群检测就检出了这些菌。
致病菌也可能悄悄潜伏在身体内，正常情况下没有反应，但当有时候没睡好太累了免疫力低下的时候，或者其他病理炎症感染的时候，或者服用抗生素之后正常菌群一定程度存在失调，这些致病菌趁虚而入，定植成功，就到了它们发挥作用的时候，腹泻也就随之而来。
以上所提及的菌群与腹泻有直接联系，那么在腹泻期间，整体肠道菌群是否会受到影响呢？
我们接着看。
腹泻早期肠道菌群失调
这里将疾病的早期定义为腹泻症状没有消退的时期，通常是在疾病发作或出现在医院后的前三到五天内。
腹泻发作后，兼性厌氧菌的增殖
腹泻发作后，肠道微生物组发生了显著的分类变化，有利于快速生长的兼性厌氧菌的增殖。变形杆菌（主要是肠杆菌科/大肠杆菌）和链球菌（主要是唾液链球菌和Streptococcusgallolyticus）在早期阶段富集最为显著，在粪便微生物群中的相对丰度可能高达80%。
肠道短暂氧化，专性厌氧肠道共生菌的急剧消失
然而，腹泻细菌通常是短暂的和/或低丰度的（第一天的霍乱弧菌除外）。
并不是在所有腹泻患者中都发生菌群失调
部分感染患者的粪便微生物群与健康对照组的粪便微生物组非常相似。特别是，腹泻儿童的肠道微生物组可以分为四种肠道类型，每种类型都以一个分类单元为主：双歧杆菌、拟杆菌、链球菌或大肠杆菌。
感染性腹泻下的肠道微生物组演替
doi:10.1016/j.mib.2022.01.006
F.mortiferum过多可能是肠道失调的一般标志
除了埃希氏菌和链球菌，腹泻粪便微生物群中也发现了其他细菌过多，即使在整个肠道微生态没有失调的情况下也是如此。
在越南的研究强调，其中包括Fusobacteriummortiferum，以及人类口腔微生物群的几个菌（Granulicatella、Gemella、放线菌、Rothia、具核梭杆菌等）。
厌氧F.mortiferum通常在中国人的胃肠道定植（虽然丰度较低），但在西方人群中没有定植，最近在大肠息肉患者中注意到其增殖。
这些结果表明，F.mortiferum过多可能是肠道失调的一般标志，尤其是在亚洲人群中。
口腔细菌与腹泻肠道微生物群的紧密联系
对健康个体来说，微生物在口腔-肠道轴上的移位是频繁发生的，而腹泻所产生的生态贫瘠环境可能是这些口腔菌群临时定居的理想条件。
不同腹泻病因的菌群存在一些细微的差异
虽然整体的生态失调模式与不同的腹泻病因无关，但存在一些细微的差异。
这可能表明，病毒感染导致厌氧肠道共生菌减少的程度较低，可能是因为大多数病毒（轮状病毒、诺如病毒）感染的是小肠内壁的细胞，而不是结肠。在小鼠模型中，轮状病毒感染仅在回肠微生物群中导致拟杆菌和阿克曼菌群（均具有粘蛋白降解能力）增加，但这两个分类群在人类轮状病毒感染中过度生长的证据尚不确定。
另一方面，贾第虫引起的腹泻，始终与γ变形菌减少和普雷沃氏菌属富集有关。
这些发现表明，细菌感染和痢疾通常伴随着与健康状况进一步不同的失调状态，这可能是病原体引发的炎症和/或频繁使用抗菌药物的影响。
腹泻后恢复阶段
中期：拟杆菌↑↑，晚期：普雷沃氏菌属，产短链脂肪酸菌↑↑
通过对感染了霍乱弧菌和产肠毒素大肠杆菌的孟加拉国患者的研究，研究人员提出了肠道菌群恢复的逐步（中晚期）演替模型。大肠杆菌/链球菌的扩张最终耗尽肠道环境中的氧气，导致其种群在恢复阶段下降。
拟杆菌成为结肠生态恢复的关键物种
这随后启动了一个复杂的交叉喂食网络，以加快其他厌氧菌和产短链脂肪酸的菌（双歧杆菌、玫瑰杆菌、粪便杆菌等）的重新繁殖，从而建立一个分类学和功能多样性的群落。
患者恢复的微生物群是否恢复到感染前状态？
由于缺乏腹泻队列研究，此类数据有限。一项弯曲杆菌人类挑战研究结果表明，在比较恢复期和感染前的微生物组，显著的成分差异仍然存在，恢复期拟杆菌的丰度归因于抗菌药物的使用。
相比之下，在病毒性肠胃炎的康复过程中，拟杆菌富集期的存在并不突出，这可能是由于其不太严重的失调状态和很少使用抗菌药物。
儿童腹泻带来的长期影响
虽然腹泻大多是急性的，但反复腹泻可能会对儿童健康产生终身影响。长期以来，研究表明，腹泻和营养不良相互影响，使儿童在成年后容易发育迟缓、认知障碍和葡萄糖不耐受。
秘鲁儿童的纵向微生物组跟踪表明，腹泻频率的增加，大大降低了肠道微生物组的多样性和丰富度，而发育迟缓儿童的这种影响更为严重。发育迟缓还与微生物群恢复速度较慢有关，而长期的扰动反过来又降低了对随后肠道感染的适应能力，形成了腹泻和营养不良的恶性循环。
口腔菌群→肠道定植，可能引发炎症
非洲发育迟缓的儿童的小肠和结肠中口腔细菌过度生长，口腔细菌占优势，如唾液乳杆菌和链球菌。研究人员推测，反复腹泻增加了移位口腔细菌适应紊乱肠道环境的机会，口腔菌群稳定定植可能会引发炎症并改变微生物组的功能。
无症状携带的肠道病原体也会重塑肠道微生物组
腹泻：耐药基因水平转移，促进新的耐药性表型
肠杆菌科在腹泻早期的扩张，大大增加了它与攻击性病原体的接触，从而增加了水平基因转移的可能性。实验模型已经证实，由于结肠炎诱导的肠杆菌科细菌增多，质粒很容易从沙门氏菌转移到大肠杆菌。
越南的研究发现，共生大肠杆菌和致病性Shigellasonnei中存在相同的多药耐药质粒，这两种质粒都是从一名腹泻儿童身上分离出来的。这表明，一旦病原体进入肠道感染发生率和抗菌药物使用率高的环境，肠道的肠杆菌科可以成为促进新的多药耐药性表型出现的有效宿主。
腹泻后的肠道微生态失调是短暂且可逆的，但其负面影响在脆弱人群中会被放大。
以上是关于感染性腹泻与肠道菌群之间的关联，实际上研究表明，肠道菌群的失调与慢性腹泻之间也存在密切的联系。接下来，我们从具体疾病中一一来看它们之间的关联机制。
IBS的亚类包括：
什么人群更易出现IBS？
IBS的多种病理生理机制
如运动能力改变、屏障功能受损、免疫激活、内脏过敏和中枢神经系统异常，并可能与个人和环境风险因素有关，包括遗传易感性、压力、抗生素使用、肠道感染、心理困扰、饮食等。
doi.org/10.3390/jcm12072558
脑-肠轴的失调会改变胃肠道系统的运动、感觉、自主和分泌功能，进而改变肠道蠕动、肠道通透性、内脏敏感性和肠道微生物群组成，所有这些都与IBS的发病机制有关。
IBS中常见的肠道蠕动变化是由血清素代谢改变介导的。肠神经系统的肠嗜铬细胞释放血清素，刺激肠道蠕动并调节分泌和血管舒张功能。肠神经系统失调可导致血清素分泌增加或减少，分别表现为腹泻或便秘。
IBS的肠道菌群变化
IBS-D的特点是粪便微生物群的微生物多样性总体下降，厚壁菌门显著减少，拟杆菌门增加。
多种类型IBS的菌群变化：
低度炎症和免疫功能障碍在IBS中发挥作用
研究发现IBS患者的促炎细胞因子水平升高，部分原因可能是压力所致。
10%的IBS病例是在最近患有胃肠道疾病的情况下感染后发生的，这通常会导致粘膜和全身炎症。
IBS症状与心理、生理和神经胃肠道因素有关
肠道微生物组的改变也会导致一些炎症和免疫学变化，这些变化可能会通过增加肠道通透性来损害胃肠粘膜屏障。这反过来可能会干扰胃肠道稳态，并使脑-肠伤害感受通路失调，导致内脏过敏或胃肠道疼痛感增强。
IBS患者饮食方面要注意，豆类、含乳糖食品和人工甜味剂中存在的可发酵低聚糖、单糖、二糖和多元醇(FODMAP)由于其发酵和渗透作用，可能会加剧部分患者的症状。
IBS基于病理生理学的分类和治疗建议
四分之一的IBS-D患者实际上患有特发性胆汁酸腹泻，接下来我们来看看胆汁酸腹泻。
胆汁酸腹泻
胆汁酸腹泻（BAD）是一种常见的疾病，其起因是原发性胆汁酸流失增加，并可导致微生物群变化，同时与腹泻型肠易激综合征（IBS-D）有重叠之处。
胆汁酸腹泻患者报告的最常见症状是爆发性腹泻、难闻的气味或水样腹泻(80%)、尿急(85%)以及腹胀或肿胀(54%)。
实际上，25-33%的慢性腹泻患者患有原发性胆汁酸腹泻。继发性胆汁酸腹泻继发于终末期回肠切除或发生在克罗恩病或放射线后。
胆汁酸腹泻是怎么回事？
胆汁酸由肝脏产生并储存在胆囊中。吃脂肪食物时，胆汁酸会释放到小肠中分解脂肪，之后胆汁酸被重新吸收并送回肝脏重新利用。通常，只有很少的胆汁酸最终进入大肠。
胆汁酸的正常肝肠循环
对于BAD患者，大量胆汁酸会被冲入大肠。这会导致肠道内液体增加。液体通过肠道的运动速度加快，结果是水样大便。
与肠道菌群有什么关联？
由于电解质失衡，胆汁酸的吸收不良或过量产生会导致肠道菌群失调和腹泻。
肠道菌群负责初级胆汁酸的去结合、脱氢、7α脱氢和差向异构化，在胃肠腔产生次级胆汁酸，并介导胆汁酸合成的反馈控制。肠道菌群是胆汁酸的主要调节者，反过来又调节微生物群的组成和丰富度及其特征。
在一组胆汁酸排泄过多的IBS-D患者（BA+IBS-D）中，一种以胆汁酸转化梭菌物种富集为特征的特定肠道菌群能够增强胆汁酸总排泄量，这与粪便胆汁酸和血清7-羟-4-胆甾酮（C4）水平较高有关。
另一项最新研究显示，BAD患者粪便细菌多样性降低，其他菌群变化如下：
BAD患者的初级粪便胆汁酸比例也较高，可能是由于肠道微生物群中双歧杆菌和Leptum减少，大肠杆菌增加所致。这可能会改变胆汁酸对FXR和TGR5的亲和力，从而导致FXR活性降低，胆汁酸向结肠的输送增加。
另有研究表明，双歧杆菌丰度增加的同时，次级粪便胆汁酸减少，从而导致乙酸盐和丙酸盐水平升高。
乳糜泻(CD)是一种常见的全身性疾病，是由于人体免疫力对麸质摄入的异常反应而导致的。
注：麸质是一种存在于小麦、大麦、黑麦等谷物中的蛋白质，可溶于酒精。
乳糜泻的发病机制涉及遗传和环境因素的复杂相互作用。肠道微生物群在乳糜泻的发病机制中发挥着复杂的作用。
包括有益菌丰度降低，特别是以其抗炎和免疫调节特性而闻名的双歧杆菌。
还有乳杆菌通过多种机制，包括分泌抗炎细胞因子和改变Th1免疫反应。
某些细菌的过度生长与肠道通透性增加有关，这是乳糜泻的一个标志。具体来说：
肠道微生物群导致乳糜泻的可能发病机制
这里从环境因素的作用、微生物群本身的作用、遗传学因素、围产期因素等几个方面来说。
环境因素的作用：
一种假设是，一些肠道细菌表达模仿麦醇溶蛋白（麸质的一种成分）的表位，可以引发宿主免疫反应。这种反应导致免疫系统激活并产生攻击肠道内壁的抗体。
一些细菌，例如铜绿假单胞菌，与麸质结合可导致粘膜炎症加剧。这两个因素的结合可能会导致肠道内壁进一步受损，并加剧乳糜泻症状。
最后，病毒感染也可以触发先天免疫系统的激活。具体来说，TLR3是一种可以识别病毒感染并做出反应的受体，导致先天免疫系统激活和肠道炎症。
微生物群本身的作用：
微生物群代谢产物的作用：
肠道细菌还可以通过释放短链脂肪酸来调节，具体来说，短链脂肪酸通过促进紧密连接形成、抑制促炎细胞因子的产生以及促进调节性T细胞分化，参与维持肠上皮屏障的完整性。通过这种方式，肠道细菌及其产物的平衡可能会影响宿主对包括麸质在内的膳食抗原的耐受能力，可能导致乳糜泻的发生。
遗传学的作用：
患有乳糜泻一级亲属的婴儿的大规模前瞻性出生队列研究，在引入食物(包括麸质)之前，4-6个月大的婴儿中几种链球菌和粪球菌的丰度减少与患乳糜泻的遗传风险有关。发生乳糜泻的标准遗传风险和高遗传风险与拟杆菌和肠球菌种类增加有关。出生后4-6个月时，下列菌群丰度下降：
围产期因素的作用：
剖腹产：由于粪肠球菌增加，拟杆菌属和副拟杆菌属数量减少，导致乳糜泻的风险更高。
喂食类型：婴儿配方奶粉喂养可能是发生乳糜泻的危险因素，但结果不一致。
抗生素使用：与乳糜泻之间存在关系，这可能是剂量依赖性的。
胃肠道感染：出生后6-18个月内的胃肠道感染会因肠道通透性增强而增加患乳糜泻的风险。
肠病毒、腺病毒12型、正呼肠病毒和白色念珠菌也与乳糜泻风险增加有关。
以上所有这些机制凸显了肠道微生物组、麸质和免疫系统在乳糜泻发展过程中复杂的相互作用。
炎症性肠病（IBD）常见症状是腹痛、腹泻和体重减轻。炎症性肠病主要包括：克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）。
IBD类型通常通过炎症位置和胃肠道的组织病理学特征来区分。临床上：
这两种情况均源于遗传易感宿主对微生物和/或环境因素的不适当免疫反应。
炎症性肠病患者肠道菌群变化
炎症性肠病患者肠道菌群多样性较低，对大多数炎症性肠病患者的报告了厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门内特定细菌类群的丰度变化，具有攻击性的菌群的增多，如变形杆菌、梭杆菌属、瘤胃球菌，同时具有保护性的菌群的减少，例如Faecalibacterium、罗氏菌属、毛螺菌科、双歧杆菌属。
当粘蛋白降解细菌（如瘤胃球菌）过度生长时，粘液层开始变薄，肠壁更容易受到肠道微生物的促炎信号的影响。
当这种情况变成慢性时，肠壁中的异常炎症反应似乎成为常态，导致我们在IBD中看到的肠壁损伤以及特征性的高粪便钙卫蛋白和FIT。慢性炎症会使肠道菌群失调和肠道屏障功能障碍长期存在，形成恶性循环。
肠道中高水平的具核梭杆菌（一种来自口腔的共生细菌），与炎症性肠病的进展有关。
其他例如普拉梭菌等一些产丁酸菌也减少，丁酸盐有助于肠壁修复和调节炎症。如果肠道丁酸生成量低，肠壁可能会变得渗透性过高，并由于这种微生物介导的愈合机制的丧失而出现慢性炎症。
炎症性肠病中宿主与微生物群的相互作用
发病率：
AAD的临床病程因是否涉及艰难梭菌而异，大多数非艰难梭菌发作。艰难梭菌AAD严重程度轻微，自限性强，仅持续几天。
AAD组动物模型中变形菌门和放线菌门丰度较高。更重要的是，模型组乳杆菌的丰度明显低于对照组，而肠球菌的丰度明显高于对照组。
抗生素治疗还增加了柠檬酸杆菌（Citrobacter）、窄养单胞菌（Stenotrophomonas）和谷氨酸杆菌（Glutamicibacter）的丰度，而抗生素降低了支原体和幽门螺杆菌的丰度。
■艰难梭菌感染
艰难梭菌是一种革兰氏阳性厌氧芽孢杆菌，是一种重要的医院病原体。艰难梭菌是属于厚壁菌门的正常微生物群的一部分，正常在特定范围内。
艰难梭菌感染的临床表现各不相同，从无症状或非常轻微的腹泻到严重的伪膜性结肠炎。艰难梭菌感染的发病机制似乎与正常肠道微生物群的破坏有关，主要来自抗生素治疗，如阿莫西林、氟喹诺酮、氨苄青霉素、克林霉素和头孢菌素，这些药物可能导致肠道微生态失调。
注：健康微生物组的共生菌群通过定植抗性控制艰难梭菌等病原体的定植。在抗生素和抗肿瘤或免疫抑制药物对正常肠道菌群产生破坏性影响后，肠道易被艰难梭菌定殖，或者这种影响可能导致肠道环境中预先存在的微生物种群过度生长，从而导致CDAD。
病原体通过粪口途径和孢子传播，一旦摄入，可以在胃酸中存活并定植于结肠，释放肠毒素A和细胞毒素B，这在很大程度上是造成临床严重程度的原因。
与未发生艰难梭菌感染的患者相比，抗生素治疗后艰难梭菌感染患者的微生物群多样性较低。与对照艰难梭菌抗性小鼠相比，发现数量显著增加的初级胆汁酸和某些碳水化合物有利于艰难梭菌的生长。
对于复发性艰难梭菌感染，可以使用粪菌移植FMT治疗，目前临床上有较好的反馈，随着研究的深入和技术的成熟，成功率也越来越高，关于FMT我们在后面章节也会讲到。
有时候常常将食物过敏与食物不耐受混为一谈。虽然这两种情况可能会导致类似的症状，但它们是由不同的机制触发的。
食物过敏是由于免疫系统对特定食物物质的过度反应引起的。食物过敏的主要原因是蛋白质。
蛋白质存在于花生、坚果、鸡蛋、乳制品、鱼、小麦、大豆和虾等贝类中。
牛奶过敏是婴幼儿期常见的食物过敏，牛奶蛋白质分为两大类：酪蛋白和乳清蛋白，所有蛋白质都可能是潜在的过敏原，并且可以诱导IgE和非IgE介导的免疫反应，从而导致广泛的临床表现和不同的表型。
非IgE介导的牛奶过敏涵盖多种疾病，包括食物蛋白诱发的过敏性直肠结肠炎、食物蛋白诱发的小肠结肠炎综合征和食物蛋白诱发的肠病。
当身体遇到少量的有害食物时，它都会释放组胺，肠道内布满了具有组胺受体的细胞。当组胺与这些受体结合时，会引起消化系统的肌肉收缩，导致腹部痉挛和腹泻。
患有慢性小肠结肠炎综合征的婴儿表现出更多的慢性症状，如呕吐、慢性腹泻和生长发育不良。
案
例
一名6个月的患者，基本情况：中度营养不良，牛奶蛋白过敏，每日腹泻较多。
肠道菌群检测报告如下：
以上我们可以看到：
病原菌中：
对应的菌属中：链球菌属，志贺氏菌属，梭菌属这几类有害菌较多的菌属属于人群中较高。
针对牛奶蛋白过敏，以及出现中度营养不良和腹泻的情况，对应报告中：
消化道疾病部分的显示的，肠炎高风险，细菌性腹泻、病毒性腹泻和过敏性腹泻均提示注意。
结合前面病原菌的超标和每日腹泻症状，判断较大可能存在细菌性腹泻的可能。较大可能存在肠炎的情况，并引发肠道屏障损伤，导致乳蛋白过敏的情况。
干预建议：
牛奶过敏暂时可以使用深度水解的奶粉减少过敏。另外可以适当开始摄入米粉等辅食，补充碳水化合物。
基于肠道炎症的情况，可以考虑少量服用姜黄素，并补充益生菌。
扩展阅读：生命早期微生物接触和过敏风险：如何预防
微生物群对三大过敏性疾病发展的影响
肠道微生物群在过敏性鼻炎中的作用
放射性腹泻患者的肠道微生物群落变化比非放射性腹泻患者的肠道微生物群落变化更大，因此，肠道微生物群对于预防放射性腹泻至关重要。
腹泻患者的拟杆菌、Dialister、Veillonella和未分类细菌种类增加，梭菌XI和XVIII、Faecalibacterium、Oscillobacter、Prevotella、Parabacteroides减少。
一些证据还表明，接受放射治疗的患者艰难梭菌感染的发生率很高，这与高死亡率有关。研究表明，肠道微生物群组成可作为放射治疗引起的腹泻和疲劳发展的预测标志。
肠道微生物组对辐射诱导的胃肠道粘膜炎发病机制的影响，是通过调节氧化应激和炎症过程、肠道通透性、粘液层组成、上皮修复和抵抗有害刺激的能力，以及免疫效应分子在肠道中的表达和释放介导的。
肠道微生物组可以通过两种机制影响辐射诱导的胃肠道粘膜炎：易位和微生态失调。
辐射破坏肠道屏障和粘液层，导致细菌移位，从而激活炎症反应。生物失调，无论是由辐射还是其他因素引起，都会影响局部和全身免疫反应。
TLR具有抗辐射保护作用的另一个潜在机制是激活NF-κB信号传导，这对于保护肠道免受辐射诱导的细胞凋亡至关重要。也就是说TLR可能通过NF-κB途径影响肠道对辐射诱导的上皮损伤的反应。
由于缺乏纤维，便秘往往是生酮饮食的最大问题，但事实上，生酮饮食也会导致腹泻。酮症腹泻可能只是比平时更多的水样大便和/或更频繁地排便。
酮症腹泻的原因可能如下：
脂肪很难消化
人工甜味剂和糖醇可能会对胃造成伤害
在生酮饮食中经常摄入更多的糖醇和其他人造甜味剂。这些甜味剂虽然碳水化合物含量低且通常是安全的，但过量食用可能会导致腹胀和腹泻。因此，如果有人食用大量糖醇含量高的酮类产品，他们可能会患酮类腹泻。
破坏肠道菌群
酮症腹泻持续多久？
酮症腹泻并不是一个永久性的问题。通常是暂时的，一般会发生在一开始改变饮食的时候，可能是在身体能够调整之前的第一到四周。
然而，如果高脂肪饮食对一个人的身体来说不容易消化，或者肠道微生物群确实发生了变化，腹泻可能是一个长期的副作用。
如果酮类腹泻持续存在，就值得重新考虑饮食计划。一种饮食计划不太可能适合所有人，其他可能考虑地中海饮食等饮食方式。
▼
1.腹泻未发生→预防
勤洗手：可以预防感染性腹泻的传播，比如准备食物前后，如厕、换尿布、打喷嚏、咳嗽、擦鼻涕等之后都要洗手。
正确储存食物：在正确的温度下储存食物，并烹饪所有食物直至达到建议的温度。不要冒险食用过期的食物或饮料。
预防旅行者腹泻：到卫生条件不完善的地区旅行时，需要注意食品安全。吃完全煮熟的热食，吃水果要吃可以去皮的，喝原包装的瓶装水，包括刷牙也用瓶装水。避开未经高温消毒的牛奶或果汁产品。合理摄入一些益生元，降低旅行者腹泻的风险。
保持肠道菌群平衡：当我们肠道菌群在一个良好的状态时，可以提高我们的免疫力，甚至能抵抗病原菌的定植，通过均衡饮食、保持良好的作息规律、适度运动、减少压力等各个方面，维持肠道菌群平衡。
当腹泻发生时，首先要判别感染源和感染原因。
在处理优先级上，首先要解决感染问题
细菌性感染
不过需要注意的是，使用抗生素的时候尽量遵医嘱一次性吃到位，如果吃了一天感觉好了就不吃了，没有起到彻底杀菌的作用，则可能出现病情反复，那么这时候也会带来抗生素耐药性问题，即便吃了抗生素药也不一定很快好转。
因此关于抗生素用药需要谨慎，要么不用，要么用到位，尽量避免形成抗生素耐药性问题。如果有进行肠道菌群检测，也可以看到有没有抗生素耐药性问题，如果存在某种抗生素耐药，则可以避免该药物，改用其他抗生素代替。
病毒性感染
如果主要症状是腹泻+呕吐，也可能伴随出现一些腹痛、头痛、发烧、畏寒、肌肉酸痛等情况，则考虑可能是病毒性感染。一般病毒性感染具有自限性。
病毒性感染则需要避免使用抗生素。配合一些补液及益生菌，辅助治疗。
其次，考虑其他功能性问题
肠道感染也是IBS的危险因素，如果是IBS患者，饮食因素可诱发或加重IBS症状。
短期使用利福昔明可以改善IBS的腹痛、腹泻、腹胀症状。洛哌丁胺的随机双盲安慰剂对照研究证实其可以显著降低IBS排便频率。
医生可能会开出胆汁酸螯合剂来减少胆汁的循环。通常为10-14天。
有些不明原因的腹痛、腹胀、腹泻、各种不适，在进行肠道菌群健康检测后，如果发现存在失调的情况，比如说肠道菌群多样性过低，有益菌缺乏，一些其他有害菌超标，那么需要结合相应的指标去综合判别，纠正可能的诱发因素。
我们来看一个案例：一名患者50岁，主诉腹泻。
可以看到肠道菌群多样性明显缺乏，且埃希氏菌属明显超标。大肠埃希氏菌在正常情况下对人体无害，但某些菌株也可能引起感染和疾病，导致胃肠道症状，如腹泻、腹痛等。
整体肠道菌群检测结果也与该患者“腹泻”的症状吻合，可以作为临床上的参考。
在纠正诱发因素后，可以采取措施进行调理，提升免疫力，合理应用微生态制剂，也就到了接下来第三步。
一次腹泻，对于我们肠道来说，就好比打了一场仗，各大菌群忙着争夺领地、占据优势地位，肠道菌群的平衡却遭受了巨大的打击，有益菌可能被削弱，而有害菌则可能过度繁殖，甚至肠粘膜都受损。因此，腹泻后的肠道养护很重要。
我们从两个方面进行养护肠道，营养和菌群。
营养
腹泻后可以吃什么？
土豆（不带皮），含有维生素B6、维生素C、烟酸和微量矿物质碘等营养成分。不要加黄油那些会刺激肠道的添加物，可以直接吃。
生吃蔬菜可能很难消化。可以通过剥皮、去除种子和彻底煮熟吃更好。
面食，提供膳食纤维和碳水化合物。
苹果酱，比生苹果更好，因为水果的皮含有不溶性纤维。苹果酱还含有果胶，可以帮助粪便凝固。
腹泻后避免吃什么？
以上只是关于腹泻期间饮食的普适性建议，临床上病人腹泻情况复杂，可能需要根据不同类别的腹泻进行分层管理。
对于IBS患者来说，则需额外避免：
对于胆汁酸腹泻患者来说，其他干预包括：
对于炎症性肠病患者来说，一些干预措施包括：
每个人的身体状况，肠道菌群特征各不相同，并不适用于所有人。比如说有些人吃香蕉后腹泻会更严重，这个就需要避免，根据自身情况而定。
菌群
除了上述营养之外，也可以通过对肠道菌群的调理，促进有益菌生长，抑制有害菌过度生长，优化菌群组成；增强肠道屏障功能，加强抵抗病原体入侵后的定植；从根本上改善人体免疫力。
▼益生菌
普遍认为，益生菌的功能在于：
一项研究表明，益生菌大肠杆菌抑制其他大肠杆菌菌株，以及病原菌金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的生物膜形成。
小鼠研究表明，短双歧杆菌和BifidobacteriumpseudocantenulatumDSM20439可以抑制肠出血性大肠杆菌产生的志贺毒素的表达。
益生菌也可以减轻与抗生素使用有关的肠道微生物群的改变，并可能抑制抗生素耐药性细菌的生长。
▼益生元
益生元也可以对腹泻患者产生积极影响。益生元的主要靶标是乳酸杆菌和双歧杆菌。益生元的摄入会增加短链脂肪酸的产生，这对维持肠道屏障的完整性很重要。由于丁酸盐在促进正常细胞增殖和分化方面的作用，它是被认为对肠道健康最有益的短链脂肪酸。
白术挥发油通过调节肠道菌群缓解急性溃疡性结肠炎。白术挥发油可以有效缓解溃疡性结肠炎小鼠的出血性腹泻、结肠组织损伤和结肠炎症。白术挥发油抑制了潜在的有害细菌(Turicibacter、Parasuterella、Erysipelatoclosstridium)的生长，富集了潜在有益菌(Enterorhabdus、Parvibacter、Akkermansia)。综上，白术挥发油可能作为一种新型益生元缓解溃疡性结肠炎。
doi.org/10.3389/fcimb.2021.625210
▼粪菌移植（FMT）
我们知道一般腹泻用抗生素治疗可见明显好转，但也有些用了抗生素，病情没有好转，反而产生耐药性，形成慢性腹泻，反反复复，那这样的情况就可能需要用到FMT。
在腹泻患者中使用FMT的好处是基于这样一种观点，即通过FMT引入的健康微生物群可以战胜病原体，并将恢复健康肠道微生物组的组成。
此外，FMT在4周后，IBS患者的生活质量方面显著优于安慰剂（平均差[MD]=7.47，95%置信区间[CI]：2.05-12.89，p=0.04）
单臂分析显示，IBS症状改善的发生率为57.8%（45.6%-69.9%），IBS-SSS减少（MD=-74，95%CI：-101.7至-46.3）。
一项临床研究表明，FMT可能安全有效地改善慢性放射性肠炎患者的肠道症状和粘膜损伤。此外，FMT也是缓解急性放射综合症的有效疗法。
▼中药
越来越多的研究支持：中草药配方通过调节肠道菌群缓解腹泻症状。传统中药方剂，如“四君子汤、痛泻要方、补中益气汤、参苓白术汤”等，广泛用于治疗慢性腹泻。
升姜泻心汤可以有效预防人类伊立替康引起的迟发性腹泻的发生。增强肠道屏障功能并减轻小鼠结肠炎。改善胆汁酸代谢和氨基酸代谢。
肠安Ⅰ号方治疗IBS-D临床能够明显降低IBS-SSS积分，提高AR应答率，疗效优于安慰剂，临床未发现明确不良反应。
在一项为期28天的双盲、随机、对照初步研究中，香沙六君子汤（XSLJZT）对IBS患者的腹泻（定义为频繁排便）有改善，但对稀便或急便没有改善。
除了中药配方，越来越多的证据表明，中国单一草药，如生姜、人参发酵物、苍术、小檗碱、黄柏提取物还具有止泻特性，恢复不平衡的肠道微生物群。
一项荟萃分析报告称，肠溶薄荷油可改善整体IBS症状。
中草药多糖对慢性腹泻患者肠道微生物群的影响
一次看似偶然的腹泻，实际上可能是我们肠道菌群平衡打破的一声警钟。平衡的肠道菌群可以帮助我们抵抗腹泻病原菌的定植。
当腹泻发生后，我们首先应该去寻找腹泻的原因，传统的医学检查往往需要繁琐的流程和耗时的等待以及不确定的结果，而依托于高通量测序和人工智能等技术的肠道菌群检测，则极大地提高了效率和精确性，在医疗手段飞速发展的时代，“快检、便检”已经逐渐开始成为获得关键医学信息的刚需，便于临床医生能够快速判断疾病类型和严重程度，有针对性地制定治疗方案。
注：本账号内容仅作交流参考，不作为诊断及医疗依据。
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人体消化系统包含大约几百到几千种不同的细菌种类，其丰度构成因人而异。
其中少数益生菌乳杆菌属，即嗜酸乳杆菌、植物乳杆菌、短乳杆菌、乳酸乳杆菌、干酪乳杆菌、保加利亚乳杆菌、发酵乳杆菌、鼠李糖乳杆菌特异性产生细胞外蛋白、胞外多糖、细菌素和脂磷壁酸，通过与上皮细胞相互作用影响宿主的健康和生理，增强宿主免疫系统。
在乳杆菌菌种中，植物乳杆菌（L.plantarum）是革兰氏阳性、短杆状、微需氧、耐酸、不形成孢子、不呼吸、低G+C含量、异型发酵的乳杆菌群，具有一系列作为发酵剂和防腐剂在食品工业中的应用。
它是一种非孢子形成细菌，可产生有机酸，例如乙酸、琥珀酸和乳酸作为主要代谢物。植物乳杆菌在人类和其他哺乳动物的胃和其他复杂的胆汁盐分泌物中的低缓冲能力下生长。
除了在食品工业中的应用外，肠道微生物植物乳杆菌是一种很有前途的益生菌，可治疗腹泻、高胆固醇和特应性皮炎等。它是如何工作的，它还有哪些其他好处？本文带您了解更多。
植物乳杆菌是一种分布广泛、用途广泛的乳酸菌。它代表了许多食物和饲料的微生物群的一部分，包括乳制品、肉类、鱼类、蔬菜发酵产品（例如，葡萄汁、酸菜、泡菜、酸面团）和青贮饲料；它也是人和动物粘膜（口腔、胃肠道、阴道等）的天然居民。
植物乳杆菌是一种具有抗癌、抗炎、抗肥胖和抗糖尿病特性的抗氧化剂[1].
植物乳杆菌菌株的微观形态图像
DOI：10.1099/ijs.0.65319-0
植物乳杆菌耐受不同范围的盐，尤其是NaCl和胆汁盐，pH值为4.0-8.0，温度为28-45°C，并且分别在37°C和pH7.0的温度下具有最佳细胞生长。鉴定出的菌株在上消化道中经受了各种生物障碍，例如低pH值、裂解酶和胆汁盐。能够利用广泛的糖类，尤其单糖和双糖。此外，淀粉酶和蛋白酶等细胞外酶的产生对其有利。
B族维生素
从生牛奶中分离出的植物乳杆菌能够产生B族维生素核黄素(B2)和叶酸(B9)[2].
铁吸收
植物乳杆菌可使健康女性从果汁饮料中吸收的铁增加约50%[3].
植物乳杆菌可以使女性对燕麦中铁的吸收提高100%以上[4].
钙吸收
含有植物乳杆菌的发酵乳表现出更高的钙保留摄取[5].
植物乳杆菌是体内的短暂居民。它可以轻松抵御胃酸，并可以完成从补充品进入口腔，到肠道，到结肠，到粪便的完整旅程。植物乳杆菌生长的最佳温度非常接近体温。
植物乳杆菌也是一种强大益生菌，可猛烈攻击体内的致病性有害细菌。通过杀死坏菌，它帮助我们自己的本地细菌变得更强壮，并帮助我们人体更能抵抗外来病原体的入侵。
除了作为增强免疫系统的重要方式之外，人类在所有有记录的人类历史中都食用了大量的植物乳杆菌。
该菌株用于许多食品中，例如：
酵母面包；酸菜；泡菜；发酵食物
注意
植物乳杆菌益生菌补充剂尚未获得国家药监局和FDA的医疗用途批准，可能缺乏可靠的临床研究。为防止罕见的副作用，请在使用益生菌之前咨询权威的医疗建议。
可能有效
1)腹泻
2)皮肤健康
在临床试验中，植物乳杆菌显着增加了面部和手部的皮肤水分含量。益生菌组志愿者在第12周时皱纹深度明显减少，皮肤光泽度在第12周时也有显着改善。益生菌组的皮肤弹性在4周后改善了13.17%，在12周后改善了21.73%[8].
当作为益生菌服用时，植物乳杆菌改善皮肤水合作用，对人体皮肤具有抗光老化作用[9、10].
植物乳杆菌抑制胶原蛋白的降解并促进其合成，减少活性氧(ROS)的产生[11].
在无毛小鼠中，植物乳杆菌降低了UVB诱导的表皮厚度，抑制了水分流失并增加了神经酰胺水平[12,13].
特应性皮炎
每天摄入含有热灭活植物乳杆菌的柑橘汁可减轻人类特应性皮炎的症状[14].
从泡菜中分离出的植物乳杆菌改善小鼠特应性皮炎[15].
3)溃疡性结肠炎
在多项临床试验中，乳酸菌益生菌已显示出减轻溃疡性结肠炎症状的希望。含有植物乳杆菌的合生元混合物在8周后显着改善了73名患者的UC症状[16、17].
4)胆固醇
在许多临床试验中，乳酸菌益生菌降低了胆固醇。在一项针对60名高胆固醇志愿者的研究中，含有植物乳杆菌的益生菌在12周后将总胆固醇降低了13.6%[18].
在患有糖尿病的大鼠中，植物乳杆菌降低血液甘油三酯和“坏”低密度脂蛋白胆固醇的比率，同时增加“好”高密度脂蛋白胆固醇的水平[19].
摄入植物乳杆菌后，胆固醇升高的小鼠的总血清胆固醇和甘油三酯显着降低[20].
双涂层植物乳杆菌可降低高脂肪饮食小鼠的胆固醇水平[21].
证据不足
研究人员目前正在调查植物乳杆菌是否具有其他健康益处。本节中的潜在益处至少在一项临床试验中产生了积极的结果，但这些研究规模小、相互矛盾或存在其他局限性。出于任何原因补充植物乳杆菌之前，请谨慎。
5)肥胖
辅以含有植物乳杆菌的富含益生菌的奶酪的低热量饮食降低了患有肥胖症和高血压的俄罗斯成年人的BMI和血压[22].
植物乳杆菌还保护小鼠免受饮食引起的肥胖。这种细菌可降低肥胖小鼠的体重、脂肪量、空腹血糖、血清胰岛素、瘦素水平和促炎标志物[23、24、25].
植物乳杆菌发酵大麦逆转了高脂肪饮食大鼠的葡萄糖耐受不良，改善了升高的胰岛素，降低了甘油三酯和总胆固醇水平[26].
植物乳杆菌通过诱导丙氨酸氨基转移酶(ALT)、γ-谷氨酰转移酶(GGT)、血浆甘油三酯、总胆固醇浓度、肌酐、尿素和体重的降低，来改善肥胖大鼠的肝功能和泌尿功能[27].
6)血糖
植物乳杆菌降低了绝经后妇女的血糖水平[22].
含有植物乳杆菌的豆浆具有抗氧化特性，可减少2型糖尿病患者的DNA损伤[22].
植物乳杆菌降低小鼠的食物摄入量、血糖水平、糖化血红蛋白水平和瘦素水平。这种细菌还有利于调节胰岛素水平并增加“好”(HDL)胆固醇[28].
植物乳杆菌导致高脂肪饮食小鼠对胰岛素的血糖水平显着降低[29].
用植物乳杆菌治疗可有效调节糖尿病大鼠的血糖、激素和脂质代谢[30].
植物乳杆菌显着改善糖尿病大鼠的免疫学参数并保护胰腺组织。此外，这种益生菌治疗显着降低了胰腺和血浆脂肪酶活性以及血清甘油三酯和低密度脂蛋白胆固醇率，并增加了高密度脂蛋白胆固醇水平。它还对肝肾功能发挥有效的保护作用[19].
7)伤口愈合
在一项针对34名腿部溃疡患者的小型临床研究中，局部应用植物乳杆菌减少了糖尿病和非糖尿病患者的感染性慢性静脉溃疡伤口细菌负荷、中性粒细胞、凋亡和坏死细胞，并诱导伤口愈合[31].
8)牙齿健康
热灭活的植物乳杆菌减少了接受牙周支持治疗的患者的牙周袋深度[32].
9)免疫力
在一项对171名成年人进行的临床研究中，植物乳杆菌提高了免疫活性并降低了应激标记物[33].
即使是热灭活的植物乳杆菌也会激活人类的先天性和获得性免疫力[32].
植物乳杆菌增强免疫抑制小鼠小肠的免疫力[34].
抗病毒
在感染单纯疱疹病毒1型(HSV-1)的小鼠中，口服植物乳杆菌显着延缓了感染早期皮肤损伤的发展，并减少了大脑中的病毒数量[35].
同样在小鼠中，从发酵的韩国卷心菜中分离出的植物乳杆菌赋予了100%的保护作用，防止致命的甲型流感病毒感染，防止显着的体重减轻并降低肺部病毒载量[36].
10)过敏
在一项针对42名成年人的临床研究中，植物乳杆菌发酵的柑橘汁改善了日本柳杉花粉症的症状[37].
在一项细胞研究中，植物乳杆菌降低了大豆粉的过敏性[38].
口服植物乳杆菌可减轻小鼠的气道高反应性和过敏反应[39].
11)念珠菌病
在外阴阴道念珠菌病(VVC)患者中，植物乳杆菌减少了常规治疗后的阴道不适，并改善了阴道细菌含量和阴道pH值[40].
在一项临床试验中，使用植物乳杆菌可使外阴阴道念珠菌病复发风险降低三倍[41].
植物乳杆菌还在实验室中杀死念珠菌[42].
动物和细胞研究（缺乏证据）
没有临床证据支持将植物乳杆菌用于本节所列的任何病症。以下是对现有动物和细胞研究的总结，应指导进一步的研究工作。但是，不应将下列研究解释为支持任何健康益处。
12)排毒
植物乳杆菌在实验室中减轻镉(Cd)在人类肠道细胞和小鼠中诱导的细胞毒性[43、44].
植物乳杆菌通过减少肠道铝吸收和组织积累，改善肝损伤、肾脏和大脑氧化应激，从而防止小鼠受到铝中毒[45].
用植物乳杆菌处理可通过增加铜排泄和减少铜在组织中的积累来减轻铜毒性。植物乳杆菌还逆转了铜暴露引起的氧化应激，恢复了ALT和AST血液水平并改善了小鼠的空间记忆[46].
13)血管性痴呆
植物乳杆菌发酵豆浆提取物可作为降血压剂和神经保护剂，改善血管性痴呆大鼠的学习和记忆[47].
14)焦虑
长期摄入植物乳杆菌可增加运动活性、多巴胺和血清素水平，同时减少小鼠的焦虑样行为。它还减少了抑郁样行为和炎性细胞因子水平，并增加了遭受早期生活压力的小鼠血清中的抗炎细胞因子水平[48、49].
15)心血管健康
血压
植物乳杆菌发酵豆浆提取物可作为大鼠的降血压剂[47].
同样在大鼠中，用植物乳杆菌发酵的蓝莓降低了血压并改善了可能指示心血管疾病风险的标志物[50].
动脉粥样硬化
来自植物乳杆菌的脂磷壁酸(LTA)可抑制小鼠促炎细胞因子的产生，并抑制动脉粥样硬化斑块炎症[51].
16)炎症
植物乳杆菌显着降低小鼠和大鼠促炎细胞因子的产生[52,53].它还减轻了氧化应激和肾上腺素水平[52].
17)肝脏健康
用植物乳杆菌治疗大鼠阻塞性黄疸可恢复活跃的肝屏障功能[54].
植物乳杆菌可保护小鼠免受氧化应激和肝脏炎症损伤[55].
植物乳杆菌减轻了高脂血症小鼠的肝损伤[56].
补充植物乳杆菌5周可恢复患有非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)大鼠的肝功能，并降低肝脏中的脂肪堆积水平。此外，该细菌显着减少了促炎细胞因子[53].
18)肠道健康
植物乳杆菌减少肠上皮细胞的炎症[57].
摄入植物乳杆菌可以抵消肠道中不需要的细菌[3].
植物乳杆菌增强了洛哌丁胺诱导的便秘小鼠的胃肠道转运[58].
溃疡
口服植物乳杆菌可通过抗炎和免疫调节活性改善小鼠的溃疡性结肠炎[59].
肠易激综合症
植物乳杆菌可减少肠易激综合征患者的胀气问题和疼痛[60].
幽门螺杆菌感染
植物乳杆菌可预防小鼠幽门螺杆菌感染引起的胃粘膜炎症和胃微生物群改变[61].
植物乳杆菌延缓幽门螺杆菌在大鼠胃中的定植，减轻胃炎症并改善胃组织病理学[62].
19)婴儿成长
植物乳杆菌菌株在慢性营养不良期间维持幼鼠的生长[63].
20)身体耐力
21)女性生育能力
植物乳杆菌改善了小鼠炎症诱导的不孕症[65].
植物乳杆菌增强了自然微生物群落，并导致感染大肠杆菌的小鼠的生育能力恢复[66].
22)组胺不耐受
植物乳杆菌可以在实验室环境中降解生物胺。在组胺不耐受的人群中可能值得研究[67].
癌症研究
植物乳杆菌增强了肠腺癌小鼠的抗肿瘤免疫反应并延缓了肿瘤形成[68].
长期服用植物乳杆菌可预防大鼠患乳腺癌[69、70].
植物乳杆菌抑制大鼠结肠癌发生的发展[71].
纳米尺寸的植物乳杆菌还在小鼠中表现出抗结直肠癌活性[72].
植物乳杆菌显着抑制肝癌细胞、胃癌细胞和结直肠腺癌细胞的增殖[73].
这些影响尚未在人类受试者中进行过研究。
在大鼠身上没有观察到任何类型的不良反应，即使在大量食用后也是如此。然而，与其他益生菌一样，在器官衰竭、免疫功能低下和肠道屏障机制功能失调的患者中使用可能会导致感染[74].
为了避免不良事件，请在使用益生菌之前咨询医生。
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排便是一个复杂而协调的过程，它整合了多个生理系统，包括神经、肌肉、激素、认知系统等。
结肠基本知识
在了解排便过程之前，我们先认识一些关于结肠结构的基本知识。
结肠和肛门直肠的神经肌肉解剖结构
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a|结肠和肛门直肠与排便生理有关的外源性感觉运动神经支配。
b|肛门直肠的冠状图，显示了克制中结构重要性的特征。
结肠是一个粘弹性管状器官，从近端回盲肠交界处开始，远端直肠乙状结肠交界处结束。成人结肠长约130厘米，盲肠的管腔直径为60-80毫米，乙状结肠的管腔逐渐狭窄至25毫米。
结肠接受来自肠神经系统的内在神经支配，来自腰神经的外在交感神经支配，以及来自迷走神经(近端结肠)和盆腔内脏神经的外在副交感神经支配，这些神经支配结肠的感觉运动功能。
便便的产生
我们吃进去的食物在体内经历了什么？是如何变成粪便排出的？
进食的时候，食物与唾液相混合，唾液浸湿食物，同时也含有消化淀粉和脂肪的酶。
随后食道将食物推向胃。胃酸、胃液、酶进一步分解，完成后食物就到了小肠。
在胰腺、胆囊、微生物群的帮助下，脂肪、蛋白质、微量营养素等进一步被分解，通过小肠吸收后到肝脏，剩下的部分则转到大肠。
排便过程
关于排便过程，这里主要涉及四个阶段：基础阶段、排出前阶段、排出阶段、结束阶段。下图详细说明了在每个阶段中为保持自制或促进排便所发生的具体变化。
乳酸菌属益生菌是使用最广泛的益生菌之一。罗伊氏乳杆菌(L.reuteri)是一种经过充分研究的益生菌，可以在大量哺乳动物中定殖。
罗伊氏乳杆菌是一种革兰氏阳性杆状细菌，已在各种食物中发现，尤其是肉类和奶制品。在人类中，罗伊氏乳杆菌存在于不同的身体部位，包括胃肠道、泌尿道、皮肤和母乳。罗伊氏乳杆菌的丰度因个体而异。
可能的优势
●可能促进皮肤光泽和头发浓密
●可能有助于对抗感染
●可能减少炎症并加强免疫
●可能会改善肠道健康（减少IBS和IBD症状）
●可能降低胆固醇
可能的副作用
●可能对组胺不耐受的人不利
●可能导致某些人体重增加
●缺乏大规模临床研究
●长期补充的安全性未知
罗伊氏乳杆菌（Lactobacillusreuteri）名字来自德国微生物学家GerhardReuter，他在1960年代在人类肠道和粪便样本中发现了它。1960年代被发现时，罗伊氏乳杆菌自然存在于30-40%的人体内，现在大约降至10-20%。科学研究者将这种下降与生活方式的改变联系起来。我们不像以前那样吃发酵食品，如酸菜，而是使用防腐剂，这会杀死食物和体内的细菌。
罗伊氏乳杆菌在发酵过程中能够产生葡聚糖和果聚糖。其中一种葡聚糖，α-1,4/1,6葡聚糖，分子量为40MDa，支化度约为16%，似乎是一种饱腹感诱导剂，对胰岛素和血糖水平有良好的影响在人类。葡聚糖不会在胃和空肠中降解，而是在结肠中完全降解。由于其慢淀粉特性，这种葡聚糖可能是烘焙应用中一种促进健康的成分。
不同菌株的Lactobacillusreuteri已被证明具有不同的生理作用。例如，LactobacillusreuteriDSMZ17648用于治疗幽门螺杆菌(H.pylori)，而LactobacillusreuteriNCIMB30242用于治疗高胆固醇。
但是，罗伊氏乳杆菌补充剂尚未获得批准用于医疗用途，而且有的益处和副作用缺乏可靠的临床研究。法规制定了补充剂的制造标准，但不保证它们是安全或有效的。
大多数关于Lactobacillusreuteri的研究是在动物或细胞中进行的。临床研究很少，而且大多数是低质量的、小规模的或可能存在偏见的。此外，使用的确切菌株因不同研究而异。
尽管罗伊氏乳杆菌在人类中是正常的，但并不是每个人的胃肠道中都有它。口服补充剂可以增加和补充胃肠道罗伊氏乳杆菌，然而它不一定会长期留在那里。
为消化和吸收而建，胃肠系统的某些部位已发展为对微生物定植不利。这方面的例子可以在由小肠上部胃酸和胆汁盐引起的低pH条件下看到。因此，在胃肠道定植的第一步就是在这样的环境中生存。幸运的是，罗伊氏乳杆菌对低pH值和胆汁盐具有抵抗力。这种抗性被认为至少部分取决于其形成生物膜的能力。