不孕不育疾病的病因较为复杂，科学系统的检查以查找正确病因，对于治疗不孕不育起到关键作用。通常检查不孕是针对男性女性双方的，而双方的检查自然也会有所不同，如女性需要检查amh、内膜、子宫环境等，而男方则需要检测男性细胞等，至于男性不孕检查具体要做什么项目，在文中也可以详情了解。
1.全身检查
对身高、体重、血压、脉搏、体态、外形、有无男性第二性征、男性内分泌功能紊乱体征等进行必要检测和观察，同时注意心血管、呼吸系统、消化系统和神经系统有无异常的体征。
2.生殖系统检查
是男性不育检查的重点，包括阴茎的检查、阴囊的检查、睾丸的检查、精索的检查、附睾的检查等。导致男性不育的生殖系统异常主要有尿道下裂、尿道上裂、隐匿阴茎、小阴茎以及可以造成男性不育的尿道炎症、精囊炎症、附睾炎症等。
3.精液分析和检查
是男性不育症诊断与治疗主要的检查项目，是评价男子生育力的重要依据。为确保检查的正确靠谱，患者应在检查的前叁至五天内没有过性生活。精液的检查包括精液外观、精液酸碱度、精液气味、精液的凝固与液化、精液量的检查。
4.男性细胞的检查
5.精液微生物学检查
男性泌尿生殖系统感染不但可引起生殖器官的炎症如睾丸炎、附睾炎、前列腺炎等，还是男性不育的常见原因。引起泌尿生殖系统感染的病原微生物有细菌、病毒、支原体、衣原体、真菌等，检测的方法有涂片检查、病原体培养、抗原抗体检测等。精液的微生物检查主要内容有细菌检查、病毒检测、衣原体支原体检测等。
6.前列腺液检查
男性前列腺检查主要是为了检查患者磷脂小体数量、有无细菌、滴虫等。前列腺液收集时，如果按摩用力过度，会造成前列腺壁微小损伤，导致前列腺液中红细胞数目增加。前列腺炎症充血期，前列腺液检查时白细胞数目可能正常或减少。
7.睾丸组织活检
8.细胞遗传学检查
主要查明有无先天因素或染色体异常引起的男性不育。染色体异常引起男性不育的发病率约6%-15%，常用的细胞遗传学检查内容有：鼓棰小体检查、染色体核型分析、染色体畸变等。
9.免疫学检查
人类精液含有大量的抗原成分，包括精浆抗原、男性细胞抗原和精浆与男性细胞共有抗原，此外还存在血型抗原成分复杂，较强的抗原性能引起自身、同种或生殖道局部的免疫反应，诱发特异性抗体产生。精液(男性细胞)抗体的产生往往是不孕的一个严重原因，因此临床上重视对抗男性细胞抗体的检测。
10.内分泌学检查
主要检测睾丸的雄性激素(主要是睾酮)的分泌状况，临床证明，内分泌异常也是男性不育的常见原因之一。内分泌学检查还包括促卵泡刺激素(FSH)检查、促黄体生成素(LH)检测、雌二醇(E2)检测等。
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