人是得病后才用药，产生耐药性的机会相对较少；动物则是天天在用药，特别是家禽业尤其严重，人药兽用很难按照说明书的要求进行使用，动物产生抗药性的机会大大增加。一旦大量动物因为使用人药而产生抗药性后，会使动物疫情的控制难度成倍加大，这既会给畜禽养殖业带来严重危害，也会给人类疾病的治疗带来很多困难。另外，动物体内积存的人用抗生素，会通过不同途径对水体和土壤环境造成污染，也能给人类带来无穷后患。
2药性有差异
人和动物的生理机制不同，代谢特点也不一致，尤其是胃液的性质、肠道的长度、总体的吸收能力等，都有很大差别。人药专为防治人的疾病而研制，以人医临床试验为基础，兽药专为防治动物的疾病而研制，以兽医临床试验为基础。兽药与人药虽有相似之处，但也存在着很大的药性差异，人用合适的药物，给动物长期使用，会产生一些意想不到的副作用。而有些效果相对较弱的人用药物，给动物使用，可能根本就不起作用。因此，兽药和人药之间不能随意替代使用。
3毒性难预测
人与种属不同的各种动物，有时对药物的反应差异很大，如：反当动物对某些麻醉药比较敏感，牛对汞剂耐受性很低，禽类使用呋喃类药物易发生中毒，食草动物使用抗生素易引起消化机能失常等等。所以，人药用于动物可能会发生什么样的毒性反应，很难预测。有些兽药具有专用特性，随便使用其他人用药物代替，也是不允许的。故人药与兽药有严格的界限，根本不能混淆。
4用法差别大
在具体使用方法上，人用药物有饭前、饭中、饭后的差别，还有饮食上的多种禁忌，这充分考虑了生理、病理的特点。动物用药在这方面则没有具体的要求，即使有类似的说明，在群体用药的情况下，也常常忽略不计。因此，将人用药物随便给动物使用，很难保证药效能充分发挥。另外，有些药物适合于混在饮水或饲料内，这只能适合于动物，适合于使用兽药，随便将人用药物添加在饮水或饲料中给动物使用，明显是不合适的。
5剂量不统一
兽药一般含量高、纯度差、杂质大、卫生标准要求低，有的剂量指标要高出人药2～4倍，如：人用土霉素每片含量只有0.25克，而兽用每片0.5～1克不等。大动物的用药量比人大许多，而小动物的用药量又比人少很多，两者之间也不易比照。
6价格不划算
按照国际惯例，人药和兽药的主要区别，关键在于生产卫生条件，人药的生产条件要求很高，兽药的生产条件要求相对较低，所以，人用药物比兽用药物在价格上要高出许多，若按照同样的剂量要求、将人用药物使用于动物，肯定增加负担，用量越大的药物，负担增加的幅度也越大，从经济价值上看，是不合算的。
7乱用属违法
2004年11月1日起施行的《兽药管理条例》规定：禁止将人用药品用于动物，违反规定的，除责令其立即改正外，对违法单位要处以1万元以上5万元以下罚款。很明显，将人用药物使用于动物，是违法行为，应严格禁止。