猫杯状病毒是高度传染性的病原，广泛的存在全世界的猫群之中，猫杯状病毒是一种高变异，单股RNA病毒。在急性疾病时，病毒主要排放于口鼻分泌毒物，疾病恢复之后很多猫仍会持续排放病毒，大部分会长达30天以上，有少数会持许好几年，有一小部份的猫咪则对杯状病毒具有抗性，或许是因为宿主及病毒株的因素。
猫杯状病毒广泛地在猫群中散播，在室内的患病率约与猫只数量成正比，猫越多则患病率越高，室内小的猫群患病率约10%，但收容所或猫群间则曾被报告高达25~40%的患病率，而各个猫群间的患病率则有差异存在，从50%~90%
临床症状
1.急性口腔及上呼吸道疾病
猫杯状病毒感染之后的临床症状会因为感染病毒株的毒力不同、年龄、及饲养管理因素而有所不同，当发生亚临床感染时，大部分的临床病程会呈现典型的舌头溃疡及轻微急性呼吸道疾病症状，较严重的症状则类似猫疱疹病毒所引发的呼吸道症状
急性口腔及上呼吸道疾病主要发生于幼猫，感染之后的潜伏期约2~10天，主要症状为口腔溃疡、喷嚏及浆液性鼻分泌物，也可能会造成发烧及厌食，厌食通常会伴随口腔糜烂病灶引发的过度流涎，口腔病灶主要会位于舌头，而且通常会比鼻炎来得更引人注目，这样的糜烂病灶通常会在好几天之后得到缓解，某些严重的病例则可能会造成肺炎而引发呼吸困难、咳嗽、发烧、及沉郁，特别是年轻的幼猫。
2.慢性口炎
几乎所有的猫慢口炎病例都可以分离到猫杯状病毒，其特征为增生性及溃疡性的齿龈炎及咽喉炎，可能是一种对于杯状病毒及其它病原的免疫介导性反应所造成的，但目前仍无法以实验的方法来诱发慢性口炎，而猫杯状病毒在里面所扮演的角色也尚未明了。
3.跛行综合症
杯状病毒感染之后或者疫苗接种后可能会出现急性短暂的跛行，会持续数天或数周
4.恶性全身性杯状病毒
近来欧美曾报告高毒力且通常是致死性的猫杯状病毒感染病例，已经被命名为恶性全身性杯状病毒疾病，在感染之后的潜伏期约为1~5天，成猫感染会比幼猫来得严重。在研究中发现，虽然实验感染中曾显现些许保护作用，但疫苗的接种并无法于野外感染病例中提供保护作用，目前还不知道这样的状况是否是因为这些高毒力病毒株的原本特性，或是因为在疫苗已普遍接种的状况下，所以一般常见的病毒株才不太可能会引发这样严重的疾病爆发。
恶性全身性猫杯状病毒疾病的特征就是全身性炎症反应综合征、弥漫性血管内凝血(DIC)、多器官衰竭、及死亡，其死亡率可以高达67%。其临床症状有些差异存在，最初通常呈现严重急性上呼吸道疾病，特征性的症状为皮肤水肿，主要波及头部及脚肢，以及皮肤及脚掌上的溃疡性病灶，在鼻部、嘴唇、耳朵、眼睛周围、及脚掌可见痂皮病灶、溃疡、及脱毛；有些猫会呈现黄疸，可能是由于肝脏坏死或胰腺炎有些猫则可能因为肺部浸润水肿而引发呼吸窘迫；而弥漫性血管内凝血则会造成凝血功能障碍及血栓栓塞，临床的表现为出血紫斑、流鼻血、或血样粪便。
治疗：
急性上呼吸道疾病的治疗
严重感染的猫咪需要密集的护理照料及支持疗法，必须静脉输液来纠正脱水及重建离子与酸碱平衡。进食对于猫咪是非常重要的，但是大部分的病猫都不会主动进食，这或许主要是因为发烧及口腔的溃疡，但有时候是因为鼻塞而失去嗅觉所致，非甾体抗炎药物可以用来治疗发烧及口腔疼痛，选择适口性佳的食物并且适当加热或许可以刺激猫咪进食，也可以给予食欲促进剂，如(赛庚啶)，如果猫咪超过三天仍然不主动进食时，就建议放置喂食管。所有急性感染的病例都建议给予呼吸道及口腔穿透性良好的广效性抗生素来预防继发性细菌感染。
鼻腔的分泌物应该以生理盐水来清理干净，并且涂上凡士林药膏来避免分泌物粘附在鼻孔周围上，也可以给予一些黏液溶解性药物如(溴己新)，眼睛则给予不含类固醇的抗生素眼药水或眼药膏，每天数次，雾化治疗可以增加分泌物的溶解及维持呼吸道的湿度
抗病毒治疗
大部分运用于兽医上的抗病毒剂都只能抑制DNA病毒或反转录病毒的复制，猫杯状病毒的抗病毒治疗则尚未运用临床上，利巴韦林是少数可以制猫杯状病毒复制的抗病毒剂，但因为对猫具有毒性，所以不可能运用临床上，而猫的干扰素Q则已有报告认为能抑制猫杯状病毒的复制
恶性全身性猫杯状病毒疾病的治疗
已有不少临床报告成功地以密集式支持疗法、干扰素、及类固醇治愈恶性全身性猫杯状病毒疾病，但尚无对照性的研究报告发表。
猫慢性口炎的治疗
以往猫慢性口炎的病例主要以外国品种为主，但近十年来，短猫家猫则是主要的发病族群，在治疗上最经济且快速的方式就是狄波美长效类固醇的皮下或肌肉注射，效果约可持续1~2个月，口服prednisolone(泼尼松龙)也可达到效果，但很多猫咪会因为口腔剧烈疼痛而拒绝喂药或甚至攻击。类固醇的副作用则是众所皆知，所以大部分的研究还是在于取代类固醇的治疗，全口臼齿拔除或许是唯一可能痊愈的治疗方式，我的经验上约有八成以上的成功率，但先决条件是必须将所有牙根拔除干净。另外可以取代类固醇治疗的内科治疗方式还包括有口服环孢灵(cyclosporine环孢菌素)及猫干扰素Ω，其它的辅助治疗还包括有抗生素、口腔消毒液
疫苗
因为猫杯状病毒的感染非常普遍，而且很多都会引发严重的疾病，所以应该把它列为核心疫苗之一，建议所有的健康猫都应该施打，虽然疫苗的施打可以有效地对抗大部分病例的急性上呼吸道疾病与急性口腔疾病，但并无法防止杯状病毒的感染及排毒，而且疫苗所提供的保护作用是无法去对抗所有的杯状病毒病毒株的。