折耳猫天生存在着遗传性骨骼疾病，即软骨骨质化发育异常。
不要信“折耳配立耳就不会有病”，携带折耳基因（有折耳的外貌表现）就意味着百分之百发病，只是严重和轻微的区别而已。这是折耳猫典型的遗传病，先是骨质增生，接着是骨刺，最后会瘫痪。发病期从2个月到6个月不等，但一些病例是1岁以后才开始发病。
唯一能避免这种遗传病的唯一方法，就是放弃繁殖折耳猫。
已发病的折耳猫，初期表现的会不爱活动，其后行动出现障碍，明显症状包括：
1.尾巴粗短、僵硬及不能屈曲，有些病猫的尾巴是不能摆动的。
2.后肢过短，有不寻常的弯曲、增生物或者肿块。
3.四肢关节肿胀。
4.后脚掌异常肥厚，若细心观察，当猫咪坐直时，后脚掌的枕肉是接触不到地的。
5.指甲生长异常。
6.折耳猫前肢也会出现类似症状，但程度较后肢轻。
并且，目前为止并没有针对此疾病的有效疗法，所有的措施也只能是暂时缓解疼痛而已。
折耳猫发病后，请立刻带去医院检查，在兽医指导下服用药物（但是说真的，也不过是痛苦从10颗星降至7颗星，还是很遭罪）。
软骨修复药品：发病后请尽早服用软骨修复补充剂可以修复软骨，减轻磨损，缓解关节炎。
止痛药品：首先，使用止疼药的前提是你已经把猫咪带到医院，确定猫咪已经发病承受着疼痛的折磨。有很多主人都会觉得止痛药有副作用，这无疑是主人们的一片苦心。但这片苦心又是否切合爱猫的需要呢？如果患猫终日郁郁不欢，对所有事物皆没有兴趣，胃口变差及体重下降，这时作为主人的就要决定是否让爱猫服用止痛药。
同时要注意不要让患猫服用类固醇类止痛药，因长期服食类固醇会降低身体的免疫力，让患猫的身体变得更差。
当病情恶化起来，骨骼病变的情况慢慢蔓延至脊椎，导致折耳猫瘫痪，引致极大的痛楚。即使是没有“发病”的折耳猫，也会终生伴有关节粗大、手掌脚掌变形、体质较弱等问题，他们更容易感染猫瘟、皮肤病、过敏等毛病，呼吸系统异常以及心肌肥大也是折耳猫的常见病。