质谱是一种广泛应用于各个学科领域中通过制备、分离、检测气相离子来鉴定化合物的技术。质谱法在一次分析中可提供丰富的结构信息，将分离技术与质谱法相结合是分离科学方法中的一项突破性进展。在众多的分析测试方法中，质谱学方法被认为是一种同时具备高特异性和高灵敏度且得到了广泛应用的普适性方法。
质谱仪一般由样品导入系统、离子源、质量分析器、检测器、数据处理系统等部分组成。很多刚刚入行的新人可能对质谱仪的操作步骤和注意事项还不清楚，不妨来看看下面这篇干货。
1、质谱开机
打开质谱前面左下角的电源开关，这时可以听到质谱里面溶剂切换阀切换的声音，同时机械泵开始工作，仪器开始自检。等待大约两分钟，听到第二声溶剂阀切换的声音(表明质谱自检完成)后，表示仪器自检完成，可以联机。
质谱一接通电源，前级真空规就开始工作，监视前级真空值，但只有当Turbo1和Turbo2涡轮泵的转速都大于95%之后，四级杆的高真空规才会开始工作，正常读取真空值。
2、仪器模块的不同的颜色代表了仪器的不同状态
绿色：Ready，表示仪器准备就绪，可以随时进行样品分析
蓝色：表示仪器正在运行样品
粉色：表示仪器处于等待运行的状态
黄色：NotReady，表示仪器的状态还没有准备好或者仪器条件还没有达到设定值
灰色：表示仪器处于Standby或ShutDown状态
红色：表示仪器出错
3、Logbook记录本
当仪器出现故障的时候，应点击仪器事件记录本的快捷按钮查看具体的错误信息。
4、二元泵
Purge&Prime
一般来说，Purge用于日常的流动相排气泡，在更换流动相或者每天刚开机时使用，Prime用于比较剧烈的冲洗，如果系统中有明显的气泡，在做Purge无法除去时建议使用，流动相干涸的时候直接使用Prime灌注。如果排气不彻底，泵头内残留有微小的气泡，则会导致压力不稳定，如果Prime和Purge都不能使压力稳定下来，使用甲醇或异丙醇冲洗系统，水有时因为表面张力大，比较难以操作。
Sealwash
其功能是在使用缓冲盐溶液的时候，冲洗柱塞杆外部，延长柱塞杆的寿命。一般设置成间隙性工作，比如每5min冲洗0.2分钟，Singlewash一般用于排空柱塞清洗管路中的气泡，或者更换柱塞清洗溶剂的时候。柱塞清洗使用10%的异丙醇水溶液，只要安装了柱塞清洗装置，就应该使用，否则可能损伤柱塞杆，降低其使用寿命。
5、柱温箱
柱温箱的设定温度低于室温时不建议开启漏液检测功能。
6、自动进样器
取样位置可以调整进样针的插入位置，默认为零，使用标准样品瓶时针尖距离瓶底得距离约为5mm，当样品量比较多并且担心有沉淀的时候，可以选择把针的位置抬高(多比默认位置抬高5mm)。
当样品量很少时，也可以考虑把进样针的位置降低(多比默认位置降低10mm)，如果设置降低针的位置，应注意每个自动进样器可以降低的数值不一样，防止进样针降得过低扎坏样品瓶，损坏进样针和自动进样器。
另外一个选择就是使用自动平底检测功能，如果使用此功能的话，请把样品放在两个样品盘上，而不要放在右侧1-10的位置，并且注意自动瓶底检测功能不能和取样位置调整同时使用。另外，在使用内插管的时候，不要使用BottomSensing的功能。
7、方法建立
不建议使用已有方法直接选择“另存为”来创建方法，通过缺省的方法模板来创建新方法比较好。
8、方法编辑界面Sample设置参数解读
Sampleposition
单针进样时的瓶位，如果设置为“-1”，则不启动自动进样系统，只走旁路bypass。此时可以检查自动进样系统是否存在污染。
在默认的操作条件下，除了在进样的过程中，自动进样器都是在MainPass的流路，这样的流路设计是进样针和针座的内表面一直都在被流动相连续冲洗，减小了样品的残留和交叉污染。
waittimeforready
Injectvolume
单针进样时的进样体积，如果设置为“-1”，则默认为方法里面自动进样器参数下的进样量，若为一个有实际意义的值，则实际进样量就是该数值，方法里面的进样量被忽略。如果设置为“0”，则启动进样系统，但不进样；
运行序列时，该体积不起作用，以序列表中的进样体积或sampler自动进样器体积(序列表中未编辑进样体积时)为准。
一种色谱图的平滑处理选项，如果不选择，则对色谱图不会进行任何平滑，如果使用此选项，那PeakWidth的设置大值为样品的窄色谱峰的半峰宽，超出就会出现数据采集丢峰的情况，使用此复选框的时候，软件自动每11个数据点进行一次高斯平滑。
Timesegments：EMV电子倍增管电压
DeltaEMV(+)、DeltaEMV(-)分别为正、负离子模式下，在调谐的EMV的基础上增加的电压数值。在一定范围内，增加DeltaEMV可以提高灵敏度和信噪比，在满足检测灵敏度的前提下，DeltaEMV的数值越小越好，越小越有利于延长电子倍增管的寿命，一般可加压200-400V左右，但MS2SCAN模式下一般不加EMV电压，所有离子增益劳损大。
调谐的EMV电压初始值大约1100V,EMV电压的损耗前期升压较慢，1-2年左右可升至1500-1600V左右，之后会损耗较快，压力升至2300V时应更换电子倍增管，一般寿命为3年。
AcquisitionScansegments采集方法扫描段参数
Fragmentor碎裂电压，施加到毛细管出口端的电压，类似于premier的cone电压，可提高溶剂化离子的动能，使之在较高的压力环境下能够发生诱导碰撞解离。在温和的条件下，溶剂簇离子可以被打掉从而完成去溶剂过程，如果动能继续增加，就会产生碎片离子。通常分子量越大，值越高，如果有氢键存在也会增大碎裂电压。碎裂电压是默认380V，不必手动调节，但在Manualtune界面可以更改。
Source源参数
sheathgastemp鞘气温度：如果设备遭遇突然停气，因为气路的突然中断，鞘气高温可能烧坏加热组件(陶瓷材质，骤冷易碎)。损坏时实时温度显示509(传感器松动或损坏也可能导致)。JetStream在ON的状态下切忌直接打开离子源，设置为Standby后，也务必等鞘气温度下降到125度后，才能打开离子源，否则很容易烧坏鞘气的加热组件。
Capillary加在毛细管入口端的电压，仪器运行状态下可调的source参数。正离子模式电压范围2000-5500V，负离子模式一般2000-4000V，根据化合物极性及利于电离的原则可适当调高或调低，半圆柱体形电极和毛细管之间的电位差是恒定的500V(正离子模式，前者电压高，负离子模式，后者电压高)，若Capillary电压过高，导致半圆柱体形电极电压过高，易产生放电破坏化合物、损坏喷雾针尖。
Nozzlevoltage喷嘴电压，主要作用稳定电场，对负离子影响较大。正离子模式一般设置为0，弱极性、不易电离的化合物可适当加压；负离子模式电压一般设置范围500-2000V
Diagnostics参数
Turbo1power116.747wspeed>97%(<97%,>四级杆温度不是100度时，离子源温度可能出现不加热现象)
Turbo2power21.773wspeed>97%
观察仪器真空状态时的两个重要参数。
10、Actuals实时监控关键参数
chambercurrent腔电流
0.16μAstandby
0.35μAon有流动相进质谱(toMS)
0.16μAon无流动相进质谱(towaste)
roughpump粗真空
真空度过高，即小于1torr时，可能是毛细管堵了，六孔毛细管具有方向性，black部分朝外。
毛细管超声清洗的时候温度控制在50-60度。
Capillarycurrent毛细管电流
MSon高电流9998nA
MSstandby电流很小，几十nA
11、调谐
“startfromfactorydefault”选项大部分情况不必选择，如不选择此项，调谐参数的优化从上次的调谐结果开始，如果选择此项，则自动调谐会从工厂默认的参数开始，一般情况下不必选择。
调谐液放冰箱冷藏可保存2年。调谐结束后，调谐液会自动关闭，调谐文件自动保存为atunes.Tune.xml.。一定要等弹出调谐报告后再点击OK按钮。同时，每次调谐还会自动生成一个备份的调谐文件。缺省的调谐文件为atunes.Tune.xml.，如果没有必要，不要改动。
12、更换液氮时的注意事项
如果有备用液氮罐，将仪器切换到Standby，待鞘气温度降到125度后，立即实施更换。
如果不能马上更换，没有备用液氮罐，需把质谱Vent后关掉电源，待液氮准备好后再重新开机，防止由于没有氮气的保护而造成环境空气直接大量抽入质谱内部污染质谱，并可能损坏质谱。
13、氮气发生器的维护
14、机械泵的维护
每半年或当机械泵内的油颜色比较深时，就需要更换新的泵油。当油液偏低时，需适当添加新油。更换泵油时，首先放空仪器，关闭电源，拔掉电源线，把泵放置到一个较高的位置，先拧开加油盖，然后拧开排废油塞，用一个合适的容器接受排出的废油，待废油排光后，添加适量的泵油，至油位接近上限位置，但是不可超过，否则仪器操作时可能会有多余的泵油从废气管喷出。检查废液桶：每月检查质谱废液桶，当废液桶内液体比较多时，及时把多余的溶液倒掉。
15、仪器关机
注意：建议不要关闭碰撞气用的高纯氮的减压阀，仪器关机后，并不会消耗高纯氮，但是，这样可以使整个管路保持正压，有效保护高纯氮的捕集阱不被环境空气污染。